การเพาะเลี้ยงสัตว์น้ำจืดหมายถึงการทำฟาร์มพืชและสัตว์น้ำจืด ปลาสัตว์ไม่มีกระดูกสันหลังและพืชหลายชนิดปลูกในระบบการเพาะเลี้ยงสัตว์น้ำจืดทั่วโลก แม้ว่าระบบเหล่านี้ส่วนใหญ่จะใช้ในการปลูกอาหาร แต่มีฟาร์มเพาะเลี้ยงสัตว์น้ำจืดที่เชี่ยวชาญในการเลี้ยงปลาสวยงามและพืชที่เก็บรักษาไว้ในพิพิธภัณฑ์สัตว์น้ำและบ่อ
โดยทั่วไปมีสามระบบที่ใช้ในการเพาะเลี้ยงสัตว์น้ำจืด ในระบบบ่อซึ่งเป็นวิธีที่ง่ายที่สุดในการติดตั้งและบำรุงรักษาเกษตรกรเลี้ยงปลาอ่อนในบ่อที่มีอยู่หรือที่มนุษย์สร้างขึ้น นอกจากนี้ระบบกรงยังสามารถติดตั้งในแหล่งน้ำธรรมชาติที่มีขนาดใหญ่เกินไปสำหรับการเก็บเกี่ยวได้ง่าย การพัฒนาทางเทคโนโลยีทำให้เกษตรกรสามารถควบคุมสภาพแวดล้อมทางน้ำโดยใช้ระบบหมุนเวียน ระบบนี้ช่วยให้สามารถผลิตได้มากตลอดทั้งปี แต่ต้องใช้เงินลงทุนเริ่มต้นจำนวนมาก
ปลานิลซึ่งเติบโตอย่างรวดเร็วและเป็นปลาที่ค่อนข้างบึกบึนมักเลี้ยงในบ่อแม้ว่าจะทำได้ดีในระบบการเพาะเลี้ยงสัตว์น้ำก็ตาม ด้วยรสชาติที่นุ่มนวลและมีปริมาณโปรตีนสูงปลานิลจึงเป็นอาหารยอดนิยมของปลาทั่วโลก ปลาสายพันธุ์ได้อย่างง่ายดายและกินเกือบทุกอย่างซึ่งทำให้ง่ายต่อการทำฟาร์ม ในบางส่วนของโลกปลานิลยังเติบโตในนาข้าวช่วยประหยัดพื้นที่และให้ชุมชนในชนบทหลายแหล่งมีโปรตีนและรายได้เสริม กุ้งรวมถึงกุ้งและกุ้งสามารถเลี้ยงในนาข้าวควบคู่ไปกับปลานิล
ปลาอีกประเภทหนึ่งที่นิยมทำกันคือปลาเทราท์ ต้องใช้เงื่อนไขที่แม่นยำกว่าปลานิลปลาเทราท์มักจะเลี้ยงในระบบการเพาะเลี้ยงสัตว์น้ำแบบหมุนเวียน ปลาเทราท์ที่ทำจากฟาร์มมักใช้ในการเก็บกักน้ำทะเลสาบลำธารและอ่างเก็บน้ำเพื่อให้ผู้คนสามารถตกปลาได้ ฟาร์มปลาเทราท์ยังขายปลาสดให้กับร้านขายของชำและตลาด
ปลาสวยงามจากปลาทองไปจนถึงปลาหมอสีถูกเพาะพันธุ์และเลี้ยงโดยใช้การเพาะเลี้ยงสัตว์น้ำจืด การใช้หลักการเดียวกันกับระบบหมุนเวียนที่มีขนาดใหญ่ขึ้นผู้เพาะพันธุ์ปลาแปลกใหม่จะต้องควบคุมทุกด้านของสภาพแวดล้อมทางน้ำหากสัตว์ที่มีความอดทนน้อยจะเจริญเติบโต พ่อพันธุ์แม่พันธุ์ของปลาพิพิธภัณฑ์สัตว์น้ำให้ปลาเพื่อการค้าสัตว์เลี้ยง
พืชสามารถปลูกได้ในระบบการเพาะเลี้ยงสัตว์น้ำจืด พิพิธภัณฑ์สัตว์น้ำและพืชบ่อเช่นดอกบัวหรือดอกบัวมักปลูกในบ่อหรือถัง นอกจากนี้ชุมชนเกาะหลายแห่งก็เริ่มใช้เทคโนโลยี aquaponic ซึ่งอนุญาตให้ปลาและพืชน้ำจืดเติบโตขึ้นในระบบชีวภาพ ใน aquaponics ของเสียที่สร้างขึ้นโดยปลามักจะเป็นปลานิลหรือปลาดุกให้สารอาหารที่จำเป็นในการปลูกผักกาดหอมหรือพืชอื่น ๆ ที่สามารถรับประทานหรือขายได้
