โครงสร้างองค์กรเป็นกรอบงานที่พนักงานของธุรกิจหรือองค์กรได้รับการดูแลและมีการจัดสรรงาน ในขณะที่คำสั่งดังกล่าวมีความหมายกว้างเกี่ยวกับวิธีโดยรวมที่องค์กรบรรลุเป้าหมาย แต่ก็มีผลอย่างมากต่อการจัดการโครงการเฉพาะ บทบาทของโครงสร้างองค์กรในการจัดการโครงการมีความสำคัญเนื่องจากการกำกับดูแลและโครงสร้างการจัดสรรงานขององค์กรมีผลกระทบโดยตรงต่อความคาดหวังระดับความเป็นอิสระและความยืดหยุ่นที่อนุญาตให้คนหรือกลุ่มทำงานในโครงการบางโครงการ โครงสร้างองค์กรสามารถส่งผลกระทบต่อวิธีการที่กลุ่มต่าง ๆ ทำงานร่วมกันในโครงการที่มีปฏิสัมพันธ์ซึ่งกันและกันและการจัดสรรทรัพยากรของโครงการที่ จำกัด
หลายองค์กรมีโครงสร้างในลักษณะที่เป็นลำดับชั้นอย่างเข้มงวดซึ่งหมายความว่ามีโครงสร้างอำนาจที่กำหนดไว้อย่างเข้มงวดซึ่งผู้บังคับบัญชาทำการตัดสินใจที่ควบคุมการกระทำของผู้ใต้บังคับบัญชา โครงสร้างองค์กรแบบลำดับชั้นโดยทั่วไปจะบังคับใช้ความมั่นคงและประสิทธิภาพในการจัดการโครงการ ผู้บังคับบัญชาทำการตัดสินใจที่สำคัญเกี่ยวกับหลักสูตรของโครงการระยะเวลาและการจัดสรรงานและทรัพยากรและผู้ใต้บังคับบัญชาของพวกเขาดำเนินงานที่มีอิสระน้อยหรือไม่มีเลย โครงสร้างองค์กรประเภทนี้สามารถนำไปสู่ความสำเร็จของโครงการอย่างรวดเร็วและใช้ทรัพยากรอย่างมีประสิทธิภาพ
โครงสร้างองค์กรอื่น ๆ ในขณะที่โดยรวมยังคงเป็นลำดับชั้นโดยทั่วไปจะอนุญาตให้มีอิสระมากมายในการจัดการโครงการ วัตถุประสงค์ของโครงสร้างองค์กรแบบนี้ในการจัดการโครงการคือการให้โอกาสมากขึ้นสำหรับความคิดสร้างสรรค์และนวัตกรรม โครงการมักจะเสร็จสมบูรณ์โดย "ทีม" ขนาดเล็กที่มีในตัวเองซึ่งมีโครงสร้างองค์กรของตัวเอง ในขณะที่ทีมหรือบุคคลที่ปกครองตนเองได้รับการคาดหวังให้รายงานความคืบหน้าของตนต่อผู้บังคับบัญชาพวกเขามักไม่จำเป็นต้องทำตามระยะเวลาที่เข้มงวดและสามารถกำหนดวิธีที่ดีที่สุดในการทำโครงการให้เสร็จสมบูรณ์ โครงสร้างประเภทนี้มักจะส่งผลให้โครงการเสร็จช้าลงและใช้ทรัพยากรอย่างมีประสิทธิภาพน้อยลง แต่มันก็เอื้อต่อนวัตกรรมที่สามารถเพิ่มมูลค่าของโครงการได้อย่างมาก
โครงสร้างองค์กรสามารถส่งผลกระทบต่อการจัดการโครงการในวิธีอื่น ๆ ในบางกรณีตัวอย่างโครงสร้างขององค์กรรวมถึงโปรแกรมการฝึกอบรมอย่างละเอียดที่สามารถปรับปรุงความสามารถของผู้จัดการและพนักงานเพื่อให้โครงการบางประเภทเสร็จสมบูรณ์ โครงสร้างบางอย่างปรับปรุงโครงการการจัดการโครงการและส่งผลให้การใช้ทรัพยากรที่มีประสิทธิภาพและแรงงานที่มีความสามารถ อื่น ๆ โดยเฉพาะอย่างยิ่งโครงสร้างที่ซับซ้อนมากเกินไปอาจซับซ้อนเพียงการจัดการโครงการและส่งผลให้อุปสรรคในการบริหารจัดการโครงการและการเสร็จสิ้นไม่ยอมรับราชการ
