โดยทั่วไปจะมีหกขั้นตอนในการตรวจสอบการปฏิบัติงานซึ่งมีตั้งแต่การเตรียมงานเพื่อทำการสัมภาษณ์และรวบรวมเอกสารจนถึงการนำเสนอรายงานเป็นลายลักษณ์อักษรขั้นสุดท้าย การตรวจสอบควรได้รับการปรับแต่งเพื่อตอบสนองความต้องการเฉพาะของ บริษัท ดังนั้นขั้นตอนมาตรฐานสามารถใช้เป็นแนวทางเท่านั้น ผู้บริหารและผู้ตรวจสอบภายในและภายนอกของ บริษัท จะปรับกระบวนการให้สอดคล้องกับเป้าหมายและวัตถุประสงค์เฉพาะของ บริษัท
การตรวจสอบการปฏิบัติงานเป็นการทบทวนกระบวนการภายในของ บริษัท เป้าหมายคือเพื่อพิจารณาว่าทรัพยากรของ บริษัท มีการใช้อย่างมีประสิทธิภาพและเพื่อระบุวิธีในการปรับปรุงระบบ การตรวจสอบรวมถึงงานต่าง ๆ เช่นการควบคุมทางการเงินสภาพของอุปกรณ์และการจัดสรรทรัพยากรมนุษย์ บริษัท ขนาดใหญ่มักจะมีแผนกตรวจสอบภายในที่จะจัดการการตรวจสอบการดำเนินงาน บริษัท บางแห่งจะนำที่ปรึกษาจากภายนอกซึ่งมีความเชี่ยวชาญในการตรวจสอบการปฏิบัติงานเพื่อทำการตรวจสอบหรือเพื่อทำงานร่วมกับพนักงานภายใน
ขั้นตอนแรกในการตรวจสอบการดำเนินงานคือการจัดโครงสร้างการตรวจสอบที่จะเกิดขึ้น สิ่งนี้อาจนำมาซึ่งการประชุมเพื่อจัดเค้าร่างความคาดหวังและเพื่อตอบคำถามเกี่ยวกับกระบวนการ ผู้ตรวจสอบภายนอกจะใช้ขั้นตอนนี้เพื่อรวบรวมข้อมูลที่เกี่ยวข้องเกี่ยวกับ บริษัท และกำหนดเป้าหมายและวัตถุประสงค์สำหรับการตรวจสอบ ขั้นตอนเบื้องต้นนี้กำหนดขอบเขตของการตรวจสอบ
ขั้นตอนที่สองและสามของการตรวจสอบคือการสำรวจการจัดการและของพนักงาน โดยทั่วไปแล้วผู้จัดการจะถูกสัมภาษณ์เพื่อขอรายละเอียดเกี่ยวกับระบบและขั้นตอนของ บริษัท พนักงานจะถูกสัมภาษณ์และสังเกตในสภาพแวดล้อมการทำงานของพวกเขา การสังเกตสามารถนำไปสู่ความเข้าใจที่สำคัญเกี่ยวกับข้อบกพร่องในการดำเนินงานที่จะไม่ปรากฏให้เห็นผ่านการสัมภาษณ์
โดยทั่วไปแล้วการนำเสนอแผนการตรวจสอบเป็นขั้นตอนที่สี่ในการตรวจสอบการปฏิบัติงาน แผนการตรวจสอบเป็นวาระที่เป็นลายลักษณ์อักษรซึ่งระบุรายละเอียดขั้นตอนที่ บริษัท จะต้องปฏิบัติตามเพื่อให้การตรวจสอบเสร็จสมบูรณ์ มันถูกปรับแต่งและขึ้นอยู่กับข้อมูลที่ผู้สอบบัญชีรวบรวมในขั้นตอนก่อนหน้า
ขั้นตอนที่ห้าคือการตรวจสอบจริง ผู้สอบบัญชีใช้แผนการตรวจสอบซึ่งโดยปกติจะรวมถึงการตรวจสอบประสิทธิภาพของ บริษัท และความพยายามในการขาย ในด้านการเงินเขาประเมินการเรียกเก็บเงินการจัดการกระแสเงินสดและกระบวนการรายงาน ขั้นตอนการบริหารความเสี่ยงของ บริษัท ยังรวมอยู่ในการตรวจสอบตามปกติ การตรวจสอบการปฏิบัติงานอาจรวมถึงเรื่องเหล่านี้และอื่น ๆ ที่ฝ่ายบริหารคิดว่าจำเป็นต้องมีการประเมินโดยบุคคลที่สาม
ในขั้นตอนที่หกผู้สอบบัญชีจัดทำรายงานเป็นลายลักษณ์อักษรครั้งสุดท้าย มันมีรายละเอียดข้อสรุปและคำแนะนำของเขา รายงานนี้อาจมีความยาวหลายร้อยหน้าขึ้นอยู่กับขนาดของ บริษัท และจำนวนพื้นที่ปฏิบัติงานที่รวมอยู่ในการตรวจสอบ
