อัตราการรอดชีวิตจากมะเร็งหลอดอาหารขึ้นอยู่กับตำแหน่งของมะเร็งและปัจจัยอื่น ๆ เช่นอายุและสุขภาพทั่วไป แต่โดยทั่วไปผู้ป่วยที่วินิจฉัยว่าเป็นโรคมะเร็งหลอดอาหารมีอัตราการรอดชีวิตเฉลี่ย 17% ห้าปี นี่อาจจะสูงกว่ามากสำหรับมะเร็งเล็ก ๆ ที่แปลแล้วและต่ำกว่ามากสำหรับมะเร็งที่แพร่กระจายไปไกล ผู้ป่วยที่มีการวินิจฉัยโรคมะเร็งหลอดอาหารควรพูดคุยกับแพทย์ของพวกเขาเกี่ยวกับการพยากรณ์โรคด้วยตัวเลือกการรักษาที่หลากหลาย
สถิติเกี่ยวกับอัตราการรอดชีวิตจากโรคมะเร็งหลอดอาหารนั้นจัดทำในรูปแบบของอัตราการรอดชีวิตห้าปีซึ่งสะท้อนให้เห็นถึงจำนวนผู้ป่วยที่มีชีวิตอยู่ห้าปีหลังการวินิจฉัย อัตราเหล่านี้ให้ข้อมูลโดยรวมที่ดี แต่เป็นสิ่งสำคัญที่ต้องทราบว่าแต่ละกรณีสามารถแตกต่างกันมาก ผู้ป่วยบางรายมีโอกาสรอดชีวิตดีเยี่ยมในขณะที่คนอื่นอาจมีแนวโน้มเยือกเย็นกว่า
สำหรับผู้ป่วยมะเร็งขนาดเล็กที่แยกได้จากเมือกในหลอดอาหารอัตราการรอดชีวิตจากมะเร็งหลอดอาหารอาจสูงถึง 80% เมื่อมะเร็งเริ่มบุกเข้ามาในผนังของโครงสร้างนี้โอกาสในการรอดชีวิตก็จะลดลง การมีส่วนร่วมของกล้ามเนื้อรอบ ๆ หลอดอาหารทำให้อัตราการรอดชีวิตลดลงเหลือประมาณ 20% และหากมะเร็งแพร่กระจายไปยังเนื้อเยื่อข้างเคียงและต่อมน้ำเหลืองอัตราการรอดชีวิตอาจต่ำเพียงเจ็ดเปอร์เซ็นต์ ในผู้ป่วยที่เป็นมะเร็งระยะลุกลามและระยะแพร่กระจายระยะไกลอัตราการรอดชีวิตจากโรคมะเร็งหลอดอาหารจะลดลงถึงสามเปอร์เซ็นต์
ชนิดของเซลล์มะเร็งที่เกี่ยวข้องสามารถสร้างความแตกต่างได้เช่นกัน Adenocarcinomas ที่เกิดจากเนื้อเยื่อต่อมมีความก้าวร้าวและสามารถนำมาซึ่งโอกาสรอดชีวิตได้ ผู้ป่วยสูงอายุมักจะมีอัตราการรอดชีวิตจากโรคมะเร็งหลอดอาหารลดลงเนื่องจากอาจมีอาการป่วยที่ทำให้การรักษาซับซ้อน ผู้ป่วยที่ดื่มและสูบบุหรี่อาจมีผลลัพธ์ที่เลวร้ายเช่นกันเช่นเดียวกับผู้ป่วยที่มีสุขภาพไม่ดี
ปัญหาหนึ่งของโรคมะเร็งหลอดอาหารคือการวินิจฉัยที่ล่าช้า ผู้ป่วยอาจทนต่อความเจ็บปวดและการระคายเคืองที่ลำคอเป็นเวลานานก่อนที่จะไปพบแพทย์และแพทย์จะต้องใช้ชุดของการทดสอบเพื่อหามะเร็งหลอดอาหาร โดยเฉพาะอย่างยิ่งหากผู้ป่วยยังเด็กหรือไม่มีปัจจัยเสี่ยงที่ชัดเจนแพทย์อาจไม่คิดว่ามะเร็งเป็นสาเหตุของอาการทันทีและอาจส่งผลให้การวินิจฉัยล่าช้า อัตราการรอดชีวิตจากมะเร็งหลอดอาหารอาจขึ้นอยู่กับว่าผู้ป่วยได้รับการรักษาอย่างไรเนื่องจากโรงพยาบาลบางแห่งมีความก้าวร้าวและมีผลลัพธ์ที่ยอดเยี่ยมในขณะที่บางแห่งอาจใช้วิธีการรักษาที่มีประสิทธิภาพน้อยกว่า
