ปัญหาเกี่ยวกับระบบภูมิคุ้มกันสามารถพัฒนาได้จากหลายสาเหตุเช่นความเจ็บป่วยทางกายการเลือกวิถีชีวิตหรือการใช้ยาบางชนิด ความผิดปกติของภูมิต้านทานผิดปกติเช่นโรคไขข้ออักเสบหรือโรคลูปัสมักเกี่ยวข้องกับระบบภูมิคุ้มกันที่ผิดปกติ การตอบสนองต่อการแพ้จะเกิดขึ้นเมื่อระบบภูมิคุ้มกันมีการตอบสนองมากเกินไปและเป็นที่เชื่อกันอย่างกว้างขวางว่าปัญหาการดำเนินชีวิตเช่นการสูบบุหรี่หรือนิสัยการกินที่ไม่ดีต่อสุขภาพอาจนำไปสู่การพัฒนาปัญหาเกี่ยวกับระบบภูมิคุ้มกัน ยาที่ใช้ในการรักษาสภาพเช่นโรคเอดส์หรือโรคมะเร็งอาจทำให้การทำงานของระบบภูมิคุ้มกันตามธรรมชาติของร่างกายแย่ลง คำถามหรือข้อสงสัยใด ๆ เกี่ยวกับปัญหาเกี่ยวกับระบบภูมิคุ้มกันในแต่ละสถานการณ์ควรปรึกษาแพทย์หรือผู้เชี่ยวชาญทางการแพทย์อื่น ๆ
การเจ็บป่วยทางกายเป็นสาเหตุหลักของปัญหาเกี่ยวกับระบบภูมิคุ้มกัน เงื่อนไขทางการแพทย์หลายประเภทที่แตกต่างกันอาจทำให้ระบบภูมิคุ้มกันทำงานผิดปกติ โรคลูปัสและรูมาตอยด์เป็นโรคที่เกิดจากภูมิต้านทานตนเองซึ่งทำให้เกิดปัญหากับระบบภูมิคุ้มกัน อาการปวดบวมและมีปัญหากับการเคลื่อนไหวเป็นอาการที่เป็นไปได้ที่เกี่ยวข้องกับโรคเหล่านี้ ปฏิกิริยาการแพ้สามารถทำให้ระบบภูมิคุ้มกันของร่างกายตื่นตัวมากเกินไปส่งผลให้เกิดอาการเช่นคันน้ำตาไหลและหายใจลำบาก
การติดเชื้อสามารถทำให้เกิดปัญหากับระบบภูมิคุ้มกันที่มีตั้งแต่อ่อนถึงร้ายแรงในธรรมชาติ ไข้, อาการไอ, และการรบกวนทางเดินอาหารเป็นสัญญาณทั่วไปที่แสดงว่ามีการติดเชื้อบางแห่งในร่างกาย การติดเชื้อรุนแรงเช่นเอดส์ไส้ติ่งอักเสบหรือภาวะโลหิตเป็นพิษสามารถแพร่กระจายไปทั่วร่างกายและทำให้อวัยวะหยุดทำงานอย่างถูกต้องบางครั้งนำไปสู่ความตาย
การเลือกวิถีชีวิตที่ไม่ดีต่อสุขภาพเช่นนิสัยการกินที่ไม่ดีหรือการสูบบุหรี่สามารถเพิ่มความเสี่ยงในการพัฒนาปัญหาเกี่ยวกับระบบภูมิคุ้มกัน การสัมผัสกับสารพิษจากสิ่งแวดล้อมเช่นโลหะหนักหรือสารเคมีสามารถลดความสามารถของร่างกายในการต่อสู้กับผู้บุกรุกจากต่างประเทศ การปรับพฤติกรรมการบริโภคอาหารและการออกกำลังกายการกำจัดการสูบบุหรี่และการทานอาหารเสริมที่จำเป็นอาจช่วยป้องกันหรือรักษาปัญหาเหล่านี้ที่เกี่ยวข้องกับระบบภูมิคุ้มกัน สารเคมีที่ใช้ในครัวเรือนและสารพิษต่อสิ่งแวดล้อมอื่น ๆ ควรหลีกเลี่ยงเมื่อเป็นไปได้โดยเฉพาะอย่างยิ่งผู้ที่มีประวัติความผิดปกติของระบบภูมิคุ้มกัน
การใช้ยาบางชนิดอาจทำให้เกิดปัญหากับระบบภูมิคุ้มกัน ยาที่ใช้รักษาโรคมะเร็งหรือโรคเอดส์มักทำให้ระบบภูมิคุ้มกันช้าลงและทำให้ผู้ป่วยมีความเสี่ยงต่อการติดเชื้อและภาวะแทรกซ้อนอื่น ๆ ผลข้างเคียงเหล่านี้มักจะหายไปหลังจากที่ยาหยุดใช้แล้ว
