โรคอวัยวะเพศชายที่พบมากที่สุดคือโรคติดต่อทางเพศสัมพันธ์ซึ่งแพร่กระจายผ่านการมีเพศสัมพันธ์กับพันธมิตรที่ติดเชื้อ มะเร็งอวัยวะเพศชายเป็นโรคที่พบได้ยากในอวัยวะเพศชายซึ่งอาจส่งผลต่อต่อมอวัยวะเพศ บางครั้งความผิดปกติเพิ่มเติมอาจส่งผลกระทบต่อภูมิภาคของอวัยวะเพศชายและสิ่งเหล่านี้อาจเกิดจากโรคหรือปัจจัยอื่น ๆ
โรคอวัยวะเพศชายอาจรวมถึงความเจ็บป่วยที่หลากหลายซึ่งส่งผลกระทบโดยตรงต่ออวัยวะเพศ โรคติดต่อทางเพศสัมพันธ์เป็นโรคที่พบมากที่สุดของอวัยวะเพศชาย ซึ่งรวมถึงการติดเชื้อที่อาจเกิดขึ้นหลายอย่างรวมถึงโรคเริมที่อวัยวะเพศหนองในหรือซิฟิลิส พวกเขาแพร่กระจายผ่านการมีเพศสัมพันธ์กิจกรรมทางเพศในช่องปากและบางครั้งมีเพศสัมพันธ์ทางทวารหนัก อาการอาจแตกต่างกันไปขึ้นอยู่กับความเจ็บป่วย แต่บ่อยครั้งพวกเขารวมถึงการปลดปล่อยจากอวัยวะเพศ, ความรุนแรง, บวม, สีแดง, การเผาไหม้เมื่อปัสสาวะและบางครั้งหูดหรือกระแทกบนหรือรอบอวัยวะเพศชาย
โรคติดต่อทางเพศสัมพันธ์ส่วนใหญ่สามารถป้องกันได้โดยการเลิกบุหรี่ การควบคุมการเกิดวิธีการกีดกันเช่นถุงยางอนามัยยังช่วยป้องกันโรคติดต่อทางเพศสัมพันธ์ อาการอาจไม่ปรากฏขึ้นทันทีหรือเลยดังนั้นผู้ที่มีเพศสัมพันธ์โดยไม่ใช้การป้องกันควรได้รับการทดสอบอย่างสม่ำเสมอ โรคอวัยวะเพศชายประเภทนี้สามารถพบได้โดยการตรวจเลือด
มะเร็งอวัยวะเพศชายเป็นโรคอวัยวะเพศชายชนิดอื่น มันเป็นของหายากและพบได้ทั่วไปในผู้ชายที่ไม่ได้เข้าสุหนัตมากกว่าคนที่เข้าสุหนัต การรักษาอาจรวมถึงการผ่าตัดเคมีบำบัดหรือการฉายรังสี มะเร็งอวัยวะเพศชายเป็นสาเหตุการเสียชีวิตที่ผิดปกติ แต่เนื่องจากเป็นเรื่องแปลกแพทย์อาจไม่ตรวจสอบโดยอัตโนมัติเมื่อทำการทดสอบเพื่อหาสาเหตุของอาการต่าง ๆ การตรวจหาในภายหลังนี้อาจนำไปสู่เวลาที่ยากขึ้นในการรักษาโรค
บางครั้งโรคอวัยวะเพศชายอาจทำให้เกิดปัญหาเพิ่มเติมเช่นสมรรถภาพทางเพศและความอ่อนแอ โรคอวัยวะเพศชายที่มีเพศสัมพันธ์เช่นเดียวกับปัจจัยอื่น ๆ สามารถนำไปสู่ปัญหาทางเพศ โดยทั่วไปแล้วการทดสอบต่าง ๆ นั้นจำเป็นสำหรับการทดสอบหาสาเหตุของความผิดปกติทางเพศ ทั้งความเจ็บป่วยและปัญหาทางจิตใจอาจถูกตำหนิ
โรคอวัยวะเพศชายสามารถแพร่กระจายไปยังส่วนอื่น ๆ ของร่างกายในที่สุด โรคติดต่อทางเพศสัมพันธ์หลายโรคสามารถแพร่เชื้อไปยังอวัยวะอื่นได้หากไม่ได้รับการรักษาเป็นเวลานาน พันธุ์ส่วนใหญ่สามารถรักษาหรือหายขาดได้ด้วยการแทรกแซง แต่เนิ่น ๆ และยาที่เหมาะสมที่แพทย์สั่ง บางอย่างเช่นเริมอวัยวะเพศไม่สามารถรักษาให้หายขาดได้ แต่การระบาดสามารถป้องกันหรือลดลงได้
