คีโตซีสเป็นสภาวะที่ร่างกายต้องใช้โปรตีนและไขมันสำรองเพราะมันมีคาร์โบไฮเดรตไม่เพียงพอซึ่งมักเป็นผลมาจากอาหารที่มีโปรตีนสูงและคาร์โบไฮเดรตต่ำ แม้ว่าคีโตซีสด้วยตัวมันเองนั้นไม่จำเป็นว่าจะอันตราย แต่คีโตซีสที่ยืดเยื้ออาจนำไปสู่สภาวะที่เรียกว่าเคโตซิซิโดสิสซึ่งเลือดกลายเป็นกรดมากเกินไป ผลข้างเคียงของคีโตซีสที่ไม่รุนแรง ได้แก่ กลิ่นปากและก๊าซ; สิ่งที่สำคัญกว่า ได้แก่ ความอ่อนแอคลื่นไส้และเวียนศีรษะ หากคีโตซีสเกิดขึ้นเป็นเวลานานและนำไปสู่ภาวะคีโตซิซิสผลข้างเคียงอาจรวมถึงความเสียหายของตับและความเสียหายของไตและในกรณีที่รุนแรงถึงขั้นเสียชีวิต
ในระยะแรกผลข้างเคียงคีโตซีสอาจจะค่อนข้างน้อย ตัวอย่างเช่นอะซิโตนจะถูกสร้างขึ้นภายในปากระหว่างคีโตซีส เป็นผลให้หลายคนประสบกับกลิ่นปาก การแปรงฟันปากและลิ้นบ่อย ๆ อาจลดผลกระทบของอะซิโตน นอกจากนี้การดื่มน้ำมากขึ้นและการกินผักอาจลดผลกระทบของคีโตซีส
บางคนบ่นว่าผลข้างเคียงคีโตซีสอื่น ๆ - เวียนศีรษะฉับพลันอ่อนเพลียและง่วงเป็นเรื่องธรรมดา นอกจากนี้คนส่วนใหญ่บ่นเรื่องปวดหัวโดยเฉพาะอย่างยิ่งเนื่องจากร่างกายของพวกเขาบริโภคแคลอรี่น้อยลงอย่างมากเมื่อพวกเขากำลังอดอาหาร แม้ว่าผลข้างเคียงเหล่านี้จะไม่เป็นอันตรายถึงชีวิตพวกเขาอาจทำให้คนทำผิดพลาดง่าย ๆ ที่พวกเขาจะไม่ทำตามปกติ
บางครั้งผลข้างเคียงคีโตซีสเหล่านั้นจะมาพร้อมกับอาการคลื่นไส้และท้องเสียเช่นกัน บางครั้งคนที่เป็นคีโตซีสจะมีอาการอารมณ์แปรปรวนเช่นหงุดหงิดและซึมเศร้า หากอาหารที่มีโปรตีนสูงมากและคาร์โบไฮเดรตต่ำคนอาจมีอาการของแก๊สหรือท้องผูกเช่นกัน
คนส่วนใหญ่ติดตามอาหารคาร์โบไฮเดรตต่ำเป็นระยะเวลาสั้น ๆ หากมีการติดตามเป็นระยะเวลานานอาจทำให้เกิดผลข้างเคียงของคีโตซีสที่รุนแรงมากขึ้นเมื่อร่างกายเข้าสู่ภาวะ ketoacidosis เช่นความเสียหายของไตและความเสียหายของตับ ตัวอย่างเช่นโปรตีนส่วนเกินอาจทำให้ไนโตรเจนถูกปล่อยเข้าสู่กระแสเลือดของบุคคล เมื่อสิ่งนี้เกิดขึ้นไตจะต้องทำงานอย่างหนักเป็นพิเศษเพื่อที่จะเอามันออกไปทางระบบทางเดินปัสสาวะและเมื่อมีการบริโภคไขมันจะต้องกำจัดกรดไขมันที่เป็นผลพลอยได้จากไตที่ทำงานมากเกินไป คีโตซีสกรณีร้ายแรงเป็นเวลานานอาจถึงแก่ชีวิตได้
โดยทั่วไปผู้ให้บริการด้านการดูแลสุขภาพส่วนใหญ่จะไม่แนะนำอาหารคาร์โบไฮเดรตต่ำเป็นระยะเวลานานกว่า 14 วัน นอกจากนี้ผลข้างเคียงคีโตซีสไม่ดีต่อสุขภาพสำหรับหญิงตั้งครรภ์ดังนั้นพวกเขามักจะบอกให้หลีกเลี่ยงอาหารดังกล่าว ด้วยแผนอาหารใด ๆ ที่ดีที่สุดคือการปรึกษาผู้ให้บริการทางการแพทย์ ผู้ที่มีปัญหาสุขภาพบางอย่างเช่นความดันโลหิตสูงและโรคหัวใจอาจได้รับการเตือนเกี่ยวกับอาหารที่มีโปรตีนสูงเช่นกัน หากมีข้อกังวลเกิดขึ้นในขณะที่ผู้ป่วยกำลังคีโตซีสควรขอคำแนะนำจากแพทย์
