สาเหตุที่พบบ่อยที่สุดของหนองสีฟ้าผูกติดอยู่กับแบคทีเรียที่เรียกว่า pseudomonas aeruginosa การติดเชื้อนี้มักจะปรากฏในระดับปานกลางถึงผิวหนังที่รุนแรงและการบาดเจ็บของเนื้อเยื่ออ่อนเช่นการเผาไหม้ระดับที่สองถึงสาม นอกจากนี้ยังสามารถรับผิดชอบต่อการติดเชื้อทางเดินปัสสาวะที่เกิดจากการใช้สายสวนอย่างไม่เหมาะสม สีฟ้าของหนองนั้นเกิดจากผลพลอยได้ของแบคทีเรีย pseudomonas aeruginosa ที่ เรียกว่า pyocyanin ในขณะที่แบคทีเรียนี้พบบ่อยในการล่าอาณานิคมที่ไม่ติดเชื้อบนพื้นผิวที่แตกต่างกันบางครั้งก็สามารถร้ายแรงเมื่อมันบุกรุกบาดแผลเปิดในคนที่มีระบบภูมิคุ้มกันอ่อนแอ
หนองสีน้ำเงินมักปรากฏในฝีที่ปิดซึ่งอาจมีขนาดแตกต่างกันไปขึ้นอยู่กับขอบเขตของการติดเชื้อ หนองในประเภทนี้มีสีต่างกันไปตั้งแต่สีน้ำเงินเข้มจนถึงสีน้ำเงินอ่อนขึ้นอยู่กับปริมาณของ pyocyanin ที่มีอยู่ สารนี้ทำหน้าที่เป็นยาปฏิชีวนะตามธรรมชาติที่พยายามทำให้เป็นกลาง pseudomonas aeruginosa เมื่อส่วนที่เหลือของการป้องกันภูมิคุ้มกันของร่างกายไม่ได้ผล บาดแผลถาวรที่มีหนองสีน้ำเงินซึ่งไม่ได้รักษามักจะบ่งบอกถึงระบบภูมิคุ้มกันที่ถูกบุกรุกและมักจะต้องการการรักษาทางการแพทย์เพิ่มเติมด้วยยาทางปากหรือยาทา
การติดเชื้อ pseudomonas aeruginosa ขั้นสูงบางครั้งอาจส่งผลให้เกิดหนองสีเขียวและสีฟ้าและบางครั้งสีนี้บ่งชี้ว่ามีโปรตีนต้านเชื้อแบคทีเรียอื่นที่เรียกว่า myeloperoxidase ทั้งโปรตีนและ pyocyanin นี้ทำงานเพื่อช่วยให้เซลล์เม็ดเลือดขาวกำจัดแบคทีเรียที่ติดเชื้อโดยกระบวนการของการกลืนจุลินทรีย์ที่บุกรุกเข้ามา เช่นเดียวกับการติดเชื้อชนิดอื่น ๆ ในที่สุดเซลล์เม็ดเลือดขาวก็จะตายและสะสมกับสสารติดเชื้อที่เป็นกลางเพื่อสร้างหนอง นักวิจัยทางการแพทย์บางครั้งรายงานว่าวัฒนธรรมการทดสอบในห้องปฏิบัติการของหนองที่มี pseudomonas aeruginosa สามารถให้กลิ่นแปลก ๆ คล้ายกับการหมักองุ่น
บาดแผลส่วนใหญ่ที่มีหนองสีฟ้าสามารถรักษาให้หายขาดได้โดยการรักษาความสะอาดบริเวณที่บาดเจ็บและป้องกันการติดเชื้อเพิ่มเติม แพทย์มักพบว่ายาเฉพาะที่มีกรดซาลิไซลิคมีประสิทธิภาพในการต่อสู้กับเชื้อ pseudomonas aeruginosa บางกรณีการรุกรานของ pseudomonas aeruginosa ของอวัยวะภายในจำเป็นต้องได้รับการรักษาด้วยยาปฏิชีวนะที่มีประสิทธิภาพ เนื่องจากแบคทีเรียชนิดนี้สามารถอยู่รอดได้บนพื้นผิวที่ไม่ใช่ทางชีววิทยาจึงอาจพบได้ในอุปกรณ์ทางการแพทย์เช่นเครื่องช่วยหายใจและทำให้เกิดการติดเชื้อรวมถึงโรคปอดอักเสบในผู้ป่วยที่โรงพยาบาล Pseudomonas aeruginosa - เหนี่ยวนำให้เกิดโรคปอดบวมมักถูกขับออกจากหนองสีเขียวหรือสีน้ำเงินจากปอดและแพทย์เน้นว่ากรณีเหล่านี้สามารถป้องกันได้อย่างสมบูรณ์ผ่านการฆ่าเชื้อด้วยอุปกรณ์ที่เหมาะสม
