สาเหตุที่พบบ่อยของหนองในแผลพุพองคือการติดเชื้อแบคทีเรียที่เป็นรองในกรณีส่วนใหญ่ แต่บางครั้งอาจนำไปสู่ภาวะแทรกซ้อนต่อไป หนองส่วนใหญ่เป็นผลมาจากการติดเชื้อเป็นหนองซึ่งระบบภูมิคุ้มกันถูกกระตุ้นให้ต่อสู้กับแบคทีเรียที่เป็นอันตราย หนองในแผลพุพองมักพบได้ในสภาพผิวเช่นสิวรูขุมขนรอยไหม้เล็กน้อยหรือแผลเย็นที่เกิดจากเชื้อไวรัสเริมชนิดที่ 1 สาเหตุอื่นของหนองในเนื้อเยื่อภายในร่างกายรวมถึงคอ strep, ฝีฟันหรือต่อมทอนซิลที่ติดเชื้อ
แผลไฟไหม้เล็กน้อยบนผิวหนังมักก่อให้เกิดแผลพุพองที่เป็นของเหลวซึ่งเป็นผลมาจากความเสียหายของเนื้อเยื่อและหลอดเลือดขนาดเล็ก ของเหลวภายในหนึ่งในแผลเหล่านี้เรียกว่าเซรั่มและทำหน้าที่เป็นชั้นป้องกันสำหรับเนื้อเยื่อที่บาดเจ็บ ในขณะที่การระบายตุ่มเป็นวิธีปฏิบัติทั่วไปที่มีหนึ่งในการเผาไหม้เหล่านี้ก็สามารถแนะนำแบคทีเรียที่นำไปสู่การก่อตัวของเซลล์หนอง เมื่อเซลล์ภูมิคุ้มกันของร่างกายจู่โจมแบคทีเรียที่บุกรุกเข้ามาหนองก็จะเกิดผลลัพธ์เมื่อเซลล์เหล่านี้สลายตัวและตายไป เซลล์ที่ก่อตัวเป็นหนองในแผลพุพองเรียกว่านิวโทรฟิลและในที่สุดก็สลายตัวได้แม้ว่าจะประสบความสำเร็จในการต่อต้านแบคทีเรียที่ติดเชื้อ
หนองในแผลพุพองมักเกิดขึ้นในกรณีที่เป็นสิวเมื่อผู้ประสบภัยปรากฏหรือบีบสิว แพทย์ผิวหนังมักจะแนะนำให้ต่อต้านการปฏิบัตินี้เพราะมันสามารถเลวลงลักษณะของการเริ่มต้นสิวเช่นเดียวกับเพิ่มโอกาสของการติดเชื้อและรอยแผลเป็น รูขุมขนอักเสบคือการติดเชื้อของรูขุมขนซึ่งส่งผลให้เกิดตุ่มหนองเล็ก ๆ ที่จุดที่ผมแรกงอกออกมาจากหนังศีรษะหรือผิวอื่น ๆ แผลพุพองที่ถูกเปิดออกมักเป็นสาเหตุของหนองในแผลพุพองเนื่องจากมีการแนะนำของแบคทีเรีย สภาพผิวเหล่านี้มักจะรักษาในอัตราที่ดีขึ้นเมื่อผู้ประสบภัยล้างมือบ่อย ๆ ใช้ยาต้านแบคทีเรียเฉพาะที่และห้ามมิให้สัมผัสแผล
การติดเชื้อภายในสามารถนำไปสู่การก่อตัวของตุ่มหนองที่เต็มไปด้วย ปัญหานี้พบได้บ่อยในการติดเชื้อที่ลำคอเช่น strep และต่อมทอนซิลอักเสบ ต่อมทอนซิลที่มีแผลพุพองเป็นหนองบ่อยครั้งอาจเป็นปัญหาโดยเฉพาะและต้องผ่าตัดเพื่อกำจัดอาการนี้อย่างสมบูรณ์ ฝีในช่องปากเกิดจากการบุกรุกของแบคทีเรียในช่องฟันและอาจเป็นสาเหตุของอาการเจ็บในปากที่เต็มไปด้วยหนอง ในขณะที่เงื่อนไขสุขภาพประเภทนี้ไม่เป็นที่พึงพอใจ แต่มักจะถูกล้างออกด้วยขั้นตอนการผ่าตัดตามปกติและการใช้ยาปฏิชีวนะ
