โดยปกติปัสสาวะจะเจือจางมากพอที่จะไม่มีกลิ่นหรือมีกลิ่นจาง ๆ การเปลี่ยนแปลงในกลิ่นของปัสสาวะมักเกี่ยวข้องกับอาหารที่เพิ่งบริโภคไปเช่นหน่อไม้ฝรั่งหรือเครื่องเทศเช่นกระเทียมหรือแกงและไม่ก่อให้เกิดการเตือนภัย ในกรณีอื่นปัสสาวะที่มีกลิ่นแรงรสหวานหรือแอมโมเนียอาจบ่งบอกถึงอาการป่วย
กลิ่นปัสสาวะเข้มข้นที่มีลักษณะคล้ายกับผลิตภัณฑ์ทำความสะอาดในครัวเรือนทั่วไปแอมโมเนียอาจแนะนำปัญหาการกักเก็บกระเพาะปัสสาวะหรือภาวะขาดน้ำ การเก็บรักษากระเพาะปัสสาวะคือการไร้ความสามารถหรือลดความสามารถในการปัสสาวะ เงื่อนไขนี้อาจส่งผลให้ส่วนประกอบในปัสสาวะเช่นแอมโมเนียมีความเข้มข้นมากพอที่จะสร้างกลิ่นปัสสาวะที่รุนแรงเมื่อปล่อยออกมา การคายน้ำเกิดขึ้นเมื่อปริมาณน้ำไม่เพียงพอ น้ำเป็นองค์ประกอบที่สำคัญของปัสสาวะและการขาดน้ำอาจส่งผลให้ปัสสาวะที่มีของเสียที่มีความเข้มข้นสูงและมีกลิ่นรุนแรง
เมื่อปัสสาวะมีกลิ่นตามปกติ แต่กลิ่นแรงกว่าปกติก็มักจะอธิบายว่าฉุน กลิ่นปัสสาวะฉุนสามารถส่งสัญญาณการคายน้ำหรือการติดเชื้อทางเดินปัสสาวะหากแบคทีเรียจากการติดเชื้อจะถูกหยิบขึ้นมาโดยปัสสาวะและส่งกลิ่นเหม็นให้กับขยะ การติดเชื้อในทางเดินปัสสาวะนั้นเป็นที่ทราบกันดีว่าก่อให้เกิดกลิ่นเหม็นหรือแม้กระทั่งปัสสาวะที่เหม็นอับ
ปัสสาวะที่มีกลิ่นหอมหวานสามารถส่งสัญญาณโรคเบาหวานหรือ ketoacidosis เบาหวาน หากปัสสาวะมีกลิ่นหอมอย่างสม่ำเสมอควรพบแพทย์เพื่อประเมินว่าเบาหวานมีการพัฒนาหรือไม่ โรคเบาหวาน ketoacidosis เกิดขึ้นเมื่ออินซูลินไม่ได้รับการควบคุมอย่างเหมาะสมและกรดไขมันจะถูกย่อยสลายแทนอินซูลิน ในสถานการณ์เช่นนี้กระบวนการเมแทบอลิซึมของกรดไขมันจะทำให้เลือดเป็นกรดและในที่สุดก็ผลิตปัสสาวะที่มีกลิ่นหอม
ปัสสาวะที่มีกลิ่นเหมือนน้ำเชื่อมเมเปิ้ลสามารถส่งสัญญาณโรคปัสสาวะน้ำเชื่อมเมเปิ้ล ความผิดปกติของการเผาผลาญทางพันธุกรรมนี้เกิดขึ้นเมื่อร่างกายไม่สามารถสลายโปรตีนบางส่วนทำให้เกิดกลิ่นปัสสาวะหวาน โรคปัสสาวะน้ำเชื่อมเมเปิ้ลรับการรักษาด้วยอาหารปลอดโปรตีนพิเศษ
อาหารและเครื่องเทศจำนวนมากสามารถส่งผ่านกลิ่นลักษณะของพวกเขาไปยังปัสสาวะ หน่อไม้ฝรั่งเป็นที่รู้จักกันดีในการผลิตปัสสาวะที่มีกลิ่นกะหล่ำปลีแปลก ๆ อาหารอื่น ๆ เช่นกาแฟแกงกะหรี่กระเทียมและแม้กระทั่งซีเรียลอาหารเช้าก็เป็นที่รู้กันว่าให้กลิ่นปัสสาวะที่ชัดเจน กลิ่นแปลก ๆ เหล่านี้เป็นเพียงชั่วคราวและควรกระจายไปหลังจากที่อาหารถูกย่อยและผ่านไป
