ปรสิตในสมองเป็นสิ่งมีชีวิตที่เป็นอันตรายที่อาศัยอยู่และบางครั้งก็ทวีคูณในสมองให้กินเลือดและของเหลวอื่น ๆ ที่พบในสมอง ในขณะที่สิ่งมีชีวิตที่เป็นอันตรายส่วนใหญ่ไม่สามารถเจาะทะลุสิ่งกีดขวางเลือดสมอง แต่มีปรสิตสองประเภทที่บางครั้งพบในสมอง พยาธิตัวตืดเนื้อหมูเรียกว่า taenia solium และอะมีบารู้จัก naegleria fowleri เป็นสองประเภทหลักของปรสิตสมองที่อาจติดเชื้อในมนุษย์ ปรสิตในสมองนั้นค่อนข้างแปลกโดยเฉพาะในส่วนที่พัฒนาแล้วของโลก แต่ผู้ที่ได้รับผลกระทบต้องได้รับการรักษาทางการแพทย์อย่างเข้มข้นเพื่อป้องกันความเสียหายของสมองถาวรหรือแม้แต่ความตาย
อุปสรรคเลือดสมองเป็นสถานะที่ทำหน้าที่ในการปกป้องสมองโดยการไม่อนุญาตให้สารที่เป็นอันตรายเพื่อเข้าถึงสมองผ่านทางกระแสเลือด สิ่งกีดขวางนี้ช่วยปกป้องสมองจากสิ่งมีชีวิตที่อาจเป็นอันตรายรวมถึงปรสิตด้วย แม้ว่าการเข้าถึงสมองเป็นไปได้ยาก แต่บางครั้งปรสิตเหล่านี้ก็สามารถเข้าถึงสมองได้ ปรสิตสมองนั้นพบได้บ่อยในประเทศด้อยพัฒนาซึ่งสภาพความเป็นอยู่นั้นไม่ถูกสุขลักษณะ แต่เป็นไปได้ที่ปรสิตจะติดเชื้อทุกคน
พยาธิตัวตืดเนื้อหมูมีหน้าที่รับผิดชอบในกรณีส่วนใหญ่ของการติดเชื้อพยาธิในสมอง ในความเป็นจริงการติดเชื้อชนิดนี้เป็นสาเหตุที่พบบ่อยที่สุดของอาการชักในสมองทั่วโลก สาเหตุที่พบบ่อยที่สุดของการติดเชื้อนี้คือการกินเนื้อหมูที่เป็นโรคที่ติดเชื้อพยาธิตัวตืด พยาธิตัวตืดจะอยู่ในลำไส้เล็กจนกระทั่งครบกำหนดแล้วจะเดินทางไปยังสมองที่ยาวนานและนี่คือจุดเริ่มต้นของปัญหาที่แท้จริง
พยาธิตัวตืดเนื้อหมูจะสร้างซีสต์ขนาดเล็กเมื่อมันยึดติดกับเนื้อเยื่อสมอง อาการอาจแตกต่างกันไปขึ้นอยู่กับตำแหน่งที่แน่นอนของซีสต์ อาการทั่วไปของปรสิตสมองเหล่านี้รวมถึงอาการปวดหัวอาการชักและวิงเวียนศีรษะ ดวงตากล้ามเนื้อและไขสันหลังอาจได้รับผลกระทบด้วย เมื่อเวลาผ่านไปของเหลวที่พบในสมองอาจถูกปิดกั้นนำไปสู่การบวมของสมองและสมองเสียหายถาวรหรือแม้กระทั่งเสียชีวิต
ปรสิตในสมองที่รู้จักกันในชื่ออะมีบานั้นพบได้น้อยกว่าพยาธิตัวตืดของหมูแม้ว่าจะมีเพียงไม่กี่คนเท่านั้นที่ได้รับความทุกข์ทรมานจากการติดเชื้อปรสิตชนิดนี้ อะมีบาอาศัยอยู่ในน้ำที่ปนเปื้อนและติดเชื้อโฮสต์โดยการย้ายเข้าไปในจมูกก่อนที่จะเดินทางไปยังสมอง อะมีบานั้นกินเซลล์ประสาทของสมองทำให้สมองเสียหายทันทีและโดยตรง ความตายจากปรสิตชนิดนี้โดยทั่วไปค่อนข้างเร็ว การรักษาโรคติดเชื้อปรสิตในสมองอาจจำเป็นต้องใช้ยาเพื่อลดอาการบวมในสมองหรือในบางกรณีการผ่าตัดเพื่อเอาปรสิตอาจจำเป็น
