ปรสิตในลำไส้มีสองกลุ่มหลักคือหนอนพยาธิและโปรโตซัว โดยรวมสิ่งมีชีวิตเหล่านี้ก่อให้เกิดการติดเชื้อหลายล้านคนทั่วโลกทุกปีในภูมิภาคที่แตกต่างกันไปตั้งแต่เมืองในสหรัฐอเมริกาไปจนถึงพื้นที่ห่างไกลของแอฟริกา การทิ้งปรสิตในลำไส้ที่ไม่ได้รับการรักษาอาจทำให้เกิดปัญหาสุขภาพในระยะยาวหรือแม้กระทั่งเสียชีวิตในผู้ป่วยและผู้ป่วยสามารถทำหน้าที่เป็นพาหะในการแพร่กระจายปรสิตไปยังสมาชิกคนอื่น ๆ
ปรสิตในลำไส้สามารถติดเชื้อได้หลายวิธีโดยหนึ่งในวิธีการส่งผ่านทางอุจจาระที่สัมผัสกับช่องปากอันเนื่องมาจากสุขอนามัยไม่ดี การติดเชื้อสามารถเกิดขึ้นได้เมื่อปรสิตเป็นอาณานิคมของน้ำหรือดินหรือในกรณีของปรสิต zoonotic ที่ติดเชื้อสัตว์ที่มนุษย์บริโภค ในทุกกรณีปรสิตจะกินร่างกายเพื่อให้ได้รับความเสียหายจากผู้ป่วยรบกวนการดูดซึมสารอาหารและทำให้เกิดอาการต่าง ๆ
ผู้คนอาจมีอาการในทันทีหรืออาจติดเชื้อมานานหลายปีโดยที่ไม่รู้ตัว เมื่อมีอาการปรากฏอาการปวดท้องคลื่นไส้อาเจียนท้องเสียและตะคริวเป็นเรื่องธรรมดามาก การปรากฏตัวของปรสิตในลำไส้สามารถวินิจฉัยได้โดยใช้ตัวอย่างอุจจาระซึ่งตรวจสอบหาร่องรอยของสิ่งมีชีวิตที่อาจก่อให้เกิดการติดเชื้อ ผู้ป่วยควรทราบว่าบางครั้งตัวอย่างอาจให้ผลลัพธ์ที่เป็นลบหรือสรุปไม่ได้
Helminths หรือเวิร์มเป็นสิ่งมีชีวิตหลายเซลล์ซึ่งมักพบในอาหารที่ไม่สุกแม้ว่าจะเป็นไปได้ที่จะติดเชื้อผ่านทางน้ำหรือดินที่ปนเปื้อน พยาธิตัวตืดพยาธิตัวกลมและพินormอยู่ในหมู่ที่มีชื่อเสียงที่สุดและแพร่หลาย หนึ่งในสัญญาณคลาสสิกของการติดเชื้อเวิร์มคือการปรากฏตัวของเวิร์มหรือส่วนในอุจจาระ
โพรโทซัวเช่นอะมีบา giardia และ cryptosporidium เป็นสิ่งมีชีวิตเซลล์หนึ่งที่สามารถคูณได้อย่างอิสระในทางเดินลำไส้ บางครั้งมันอาจเป็นเรื่องยากที่จะระบุโปรโตซัวเพราะมันมีขนาดเล็กและยากที่จะระบุในอุจจาระ ผู้ที่เดินทางเมื่อเร็ว ๆ นี้ควรแจ้งเตือนแพทย์ถึงข้อเท็จจริงนี้เมื่อพวกเขาขอความช่วยเหลือทางการแพทย์สำหรับอาการที่แนะนำให้ติดเชื้อปรสิตในลำไส้เนื่องจากการเดินทางเป็นปัจจัยเสี่ยงที่สำคัญสำหรับการติดเชื้อ
ยาหลายชนิดสามารถใช้เพื่อกำจัดปรสิตในลำไส้ออกจากร่างกาย ยาเหล่านี้มักจะมีใบสั่งยาเท่านั้นเพื่อส่งเสริมให้ผู้ป่วยไปพบแพทย์เพื่อการวินิจฉัยเพื่อให้สามารถเลือกยาที่ถูกต้องเพื่อกำจัดสายพันธุ์เฉพาะที่ก่อให้เกิดการติดเชื้อ ผู้ป่วยบางรายยังประสบความสำเร็จกับการรักษาด้วยสมุนไพรและทางเลือกอื่น ๆ


