ปัญหาเกี่ยวกับระบบสืบพันธุ์ที่สามารถส่งผลกระทบต่อทั้งชายและหญิง ได้แก่ ภาวะมีบุตรยากโรคติดต่อทางเพศสัมพันธ์และมะเร็งของอวัยวะสืบพันธุ์ นอกจากนี้ยังมีปัญหาเกี่ยวกับการสืบพันธุ์ที่มีผลต่อเพศแต่ละคนโดยเฉพาะ ปัญหาที่พบบ่อยที่สุดเกี่ยวกับระบบสืบพันธุ์ที่มีผลต่อเพศชาย ได้แก่ สมรรถภาพทางเพศและการอักเสบของต่อมลูกหมาก ปัญหาเกี่ยวกับการสืบพันธุ์ของเพศหญิง ได้แก่ endometriosis, โรครังไข่ polycystic, และเนื้องอกในมดลูก หากมีปัญหาที่สงสัยว่าจะเกิดขึ้นกับระบบสืบพันธุ์ควรรายงานต่อแพทย์เพื่อรับการประเมินและพัฒนาแผนการรักษาเป็นรายบุคคล
ภาวะมีบุตรยากเป็นปัญหาที่พบบ่อยที่สุดในระบบสืบพันธุ์และอาจส่งผลกระทบต่อทั้งชายและหญิง ภาวะมีบุตรยากในเพศชายอาจเกิดจากจำนวนอสุจิต่ำผิดปกติทางพันธุกรรมหรือการสัมผัสกับสารพิษต่อสิ่งแวดล้อม ปัญหาภาวะเจริญพันธุ์ที่มีผลกระทบต่อผู้หญิงอาจเกิดจากปัจจัยต่าง ๆ เช่นความไม่สมดุลของฮอร์โมนรูปแบบการตกไข่ผิดปกติหรือความเสียหายทางกายภาพที่เกี่ยวข้องกับท่อนำไข่หรืออวัยวะสืบพันธุ์อื่น ๆ
โรคติดต่อทางเพศสัมพันธ์และมะเร็งของอวัยวะสืบพันธุ์เป็นปัญหาที่เป็นไปได้ของระบบสืบพันธุ์ โรคหนองในเทียมหนองในเทียมและซิฟิลิสเป็นโรคติดต่อทางเพศที่พบได้บ่อยที่สุดและอาจทำให้เกิดปัญหาเช่นภาวะมีบุตรยากปวดท้องหรือทำลายอวัยวะสืบพันธุ์ อัณฑะมะเร็งรังไข่และมดลูกเป็นมะเร็งที่เกี่ยวกับการสืบพันธุ์ซึ่งอาจทำให้เกิดภาวะมีบุตรยากชั่วคราวหรือถาวรขึ้นอยู่กับประเภทของการรักษาที่ใช้
หย่อนสมรรถภาพทางเพศและการอักเสบต่อมลูกหมากเป็นปัญหาที่พบบ่อยกับระบบสืบพันธุ์ ผู้ชายที่มีภาวะหย่อนสมรรถภาพทางเพศไม่สามารถบรรลุหรือรักษาความแข็งตัวของอวัยวะเพศได้นานพอที่จะมีเพศสัมพันธ์ที่มีความหมายและอาจประสบกับแรงขับทางเพศที่ลดลง การอักเสบของต่อมลูกหมากที่รู้จักกันในชื่อต่อมลูกหมากสามารถนำไปสู่อาการปวดในพื้นที่ท้องหรือขาหนีบเช่นเดียวกับความยากลำบากเมื่อพยายามปัสสาวะ
Endometriosis เป็นหนึ่งในปัญหาที่อาจเกิดขึ้นกับระบบสืบพันธุ์ที่มีผลกระทบต่อผู้หญิงเท่านั้น เนื้อเยื่อชนิดหนึ่งหรือที่รู้จักกันในชื่อเยื่อบุโพรงมดลูกมักเจริญเติบโตภายในมดลูก เมื่อเนื้อเยื่อนี้เริ่มเติบโตนอกมดลูกอาการเจ็บปวดที่อาจเกิดขึ้นเรียกว่า endometriosis พัฒนาทำให้เกิดภาวะมีบุตรยากและปัญหาสุขภาพอื่น ๆ
Polycystic ovarian syndrome หรือ PCOS เป็นภาวะทางการแพทย์ที่ทำให้ซีสต์หลายตัวเติบโตในหนึ่งหรือทั้งสองรังไข่ อาการปวดกระดูกเชิงกรานน้ำหนักที่เพิ่มขึ้นและการเจริญเติบโตของเส้นผมที่ผิดปกติเป็นอาการที่พบบ่อยของโรคนี้ เนื้องอกในมดลูกเป็นมวลที่พัฒนาขึ้นภายในมดลูกและมักจะนำไปสู่การมีประจำเดือนที่หนักและยาวขึ้น, ปวดกระดูกเชิงกรานและอาการท้องผูก ปัญหาที่อาจเกิดขึ้นทั้งคู่กับระบบสืบพันธุ์สามารถนำไปสู่ปัญหาการมีบุตรยาก
