โดยทั่วไปแล้วผลกระทบของเมทาโดนต่อทารกถูกจำแนกตามว่ามีการใช้ยาเสพติดเป็นระยะเวลาสั้น ๆ หรือถูกทำร้ายเรื้อรัง ในระยะสั้นเมธาโดนในเด็กทารกอาจทำให้เกิดปัญหาสุขภาพมากมายเช่นความดันโลหิตลดลงและอัตราการเต้นของหัวใจ ในทางกลับกันการใช้เมธาโดนในระยะยาวตรงกันข้ามมักส่งผลต่อน้ำหนักและขนาดของทารก ในหลายกรณีเด็กทารกที่เกิดกับแม่ที่ใช้เมธาโดนในทางที่ผิดมักจะประสบกับการถอนเมธาโดนหลังคลอด การศึกษาชี้ให้เห็นว่าอาการเหล่านี้สามารถย้อนกลับได้ด้วยการให้นมลูก
ในหลายกรณีการใช้เมทาโดนแม้สักครั้งก็สามารถนำไปสู่ผลกระทบที่ร้ายแรงมากต่อทารกในครรภ์ ผลทันทีของเมทาโดนต่อทารกอาจรวมถึงความดันโลหิตต่ำมาก อัตราการเต้นของหัวใจลดลงอย่างมาก; ความแห้งกร้านในดวงตาปากและจมูก ยกความดันในกะโหลกศีรษะ; และอาการที่คล้ายกันอื่น ๆ ในกรณีส่วนใหญ่ผลข้างเคียงของเมธาโดนที่ใช้กับเด็กทารกอาจเป็นอันตรายถึงชีวิตและต้องได้รับการรักษาพยาบาลทันที นอกจากนี้ผู้หญิงที่ใช้เมทาโดนแม้ในช่วงเวลาสั้น ๆ อาจมีอาการแท้งเนื่องจากการใช้ยานี้
ในระยะยาวการใช้เมธาโดนกับเด็กทารกสามารถนำไปสู่ภาวะที่รุนแรงได้ การใช้เมธาโดนในระยะยาวอาจส่งผลให้อัตราการเจริญเติบโตของทารกลดลงทั้งความสูงและน้ำหนัก นอกจากนี้เด็กทารกที่เกิดมาเพื่อแม่ที่มีประวัติยาวนานในการใช้เมธาโดนมักจะมีเส้นรอบวงศีรษะที่เล็กกว่าปกติ โชคดีที่เอฟเฟกต์เหล่านี้หายไปเมื่อทารกโตขึ้นและเข้าสู่วัยเด็ก ทารกที่เกิดกับผู้หญิงที่ใช้ยาเมธาโดนมักจะมีความสามารถทางจิตต่ำกว่าเด็กที่เกิดจากมารดาที่ไม่ใช้ยาและอาจได้คะแนนต่ำกว่าในการทดสอบทั้งพฤติกรรมและจิตใจ
ทารกที่ได้รับสารเมทาโดนในปริมาณสูงก็มักจะเกิดการถอนเมธาโดนหรือที่เรียกว่าดาวน์ซินโดรมในทารกแรกเกิด นี่เป็นเงื่อนไขที่ส่งผลกระทบต่อระบบต่าง ๆ ในร่างกายรวมถึงระบบหายใจและระบบประสาทส่วนกลางและระบบประสาทอัตโนมัติ ทารกที่เกิดมาพร้อมกับสภาพนี้มีความเสี่ยงเพิ่มขึ้นสำหรับการพัฒนาของโรคการตายของทารกอย่างกะทันหันหรือ SIDS เมื่อเทียบกับเด็กอื่น ๆ ที่มีสุขภาพดี อย่างไรก็ตามจากการศึกษาพบว่าอาการของภาวะนี้สามารถบรรเทาได้จากการให้นมจากแม่หรือตัวแทนอื่น อย่างไรก็ตามในหลายกรณีการเลี้ยงลูกด้วยนมแม่อาจเป็นเรื่องยากหรือเป็นไปไม่ได้
