ความกังวลเรื่องสุขภาพที่สำคัญที่เกี่ยวข้องกับค้างคาวค้างคาวคือฮิสโตพลาสโมซิส โรคในอากาศนี้มีต้นกำเนิดจากเชื้อราที่พบอยู่ในมูลค้างคาว มันสามารถส่งผลกระทบต่อระบบหายใจของมนุษย์คนใดก็ตามที่หายใจในอากาศที่สัมผัสกับมัน โดยทั่วไปร่างกายสามารถต่อสู้กับโรคนี้ได้อย่างไรก็ตามผู้ที่มีระบบภูมิคุ้มกันอ่อนแออาจต้องใช้ยาในการรักษา
ค้างคาวมักจะเลือกที่จะพักในห้องใต้หลังคาและจันทันเปิดบ้านและโรงนา พวกมันนอนหลับตอนกลางวันตามล่าในตอนกลางคืนและสามารถสร้างรังได้อย่างกว้างขวางโดยการผสมพันธุ์และแบกลูกหลังจากฤดูกาลสองสาม ค้างคาวค้างคาวพวกเขาทิ้งไว้ข้างหลังทั้งในพื้นที่ด้านบนของบ้านและบนพื้นดินข้างนอกเป็นพิษต่อมนุษย์ถ้าถูกรบกวน
ฮีสโตพลาสโมซิสสามารถอยู่บนยอดค้างคาวค้างคาวหรือในดินที่สัมผัสกับมูลสัตว์ เมื่อกวนถูกกวนในทางใด ๆ เชื้อราจะกลายเป็นอากาศอย่างรวดเร็ว มันสามารถไหลเวียนไปในอากาศที่ระบายอากาศได้ของบ้านหรืออาคารและติดเชื้อปอดของบุคคลใด ๆ ที่หายใจเข้า
โดยทั่วไปแล้วโรคนี้ต้องใช้ระยะเวลาประมาณสิบวันในการงอกและเริ่มแสดงอาการ ผู้ประสบภัยมักจะบ่นว่ามีไข้ปวดหน้าอกไอปวดศีรษะและเบื่ออาหาร ระบบภูมิคุ้มกันของร่างกายโดยทั่วไปมีความสามารถในการต่อสู้กับโรคและประสบกับการกู้คืนเต็มในเวลาไม่กี่สัปดาห์ ผู้ที่มีระบบภูมิคุ้มกันที่ถูกบุกรุกเช่นบุคคลที่ป่วยจากโรคอื่นหรือติดเชื้อเอดส์แล้วอาจต้องได้รับการรักษารวมถึงยาและการรักษาในโรงพยาบาล
หลายประเทศรวมถึงสหรัฐอเมริกาปกป้องค้างคาวในฐานะสัตว์ใกล้สูญพันธุ์และไม่อนุญาตให้มีการกำจัดพวกมันในระหว่างกระบวนการกำจัด เจ้าของบ้านอาจต้องการติดต่อกับผู้ทำลายล้างมืออาชีพที่สามารถกำจัดการติดเชื้อได้โดยไม่ต้องฆ่าสัตว์ พวกเขาควรปิดผนึกช่องว่างที่เหลืออยู่ในห้องใต้หลังคาหรือจันทันของบ้านทันทีเมื่อสิ่งนี้เสร็จสิ้นเพื่อป้องกันไม่ให้สัตว์กลับมา บริการเหล่านี้บางแห่งคิดค่าธรรมเนียมสำหรับการกำจัดขยะของสัตว์ด้วย
Bat guano เป็นพิษต่อเมื่อถูกรบกวนและจะหายไปเองในอากาศหากปล่อยทิ้งไว้โดยไม่ถูกแตะต้องหลังจากสองถึงสามปี หากการรบกวนเกิดขึ้นในส่วนหนึ่งของบ้านที่สามารถปิดผนึกจากผู้อยู่อาศัยหรือในอาคารนอกบ้านที่ไม่ค่อยได้ใช้งานก็อาจเป็นประโยชน์ที่จะไม่เอาขยะออกเลย กรณีส่วนใหญ่ของการเจ็บป่วยจากการสัมผัสกับขยะประเภทนี้เกิดขึ้นหลังจากรังหรือดินใกล้รังได้รับการทำความสะอาดและลบออก หากเจ้าของบ้านชอบที่จะทำความสะอาดพื้นที่เขาควรสวมหน้ากากที่สามารถกรองอนุภาคขนาดเล็กเป็นหนึ่งในพันไมครอน เขาควรใช้เครื่องดูดฝุ่นที่มีตัวกรองอากาศประสิทธิภาพสูงเพื่อกำจัดของเสียและทิ้งมันทันทีในถุงขยะที่ปิดผนึก
