สาเหตุที่พบบ่อยที่สุดของการมีประจำเดือนล่าช้าคือความไม่สมดุลของฮอร์โมนการเจ็บป่วยการเปลี่ยนแปลงของยาและวัยหมดประจำเดือนหรือการตั้งครรภ์ การออกกำลังกายมากเกินไปการเปลี่ยนแปลงน้ำหนักอย่างรวดเร็วการมีน้ำหนักตัวมากเกินหรือต่ำกว่าเกณฑ์และอาหารที่ไม่ดีก็สามารถทำให้เกิดการมีประจำเดือนผิดปกติได้เช่นกัน รอบประจำเดือนปกติจะแตกต่างกันไปสำหรับผู้หญิงแต่ละคนเพราะผู้หญิงบางคนมีประจำเดือนบ่อยเท่าทุก ๆ 20 วันและคนอื่น ๆ มีประจำเดือนทุก ๆ 35 วัน ความยาวของวงจรก็แตกต่างกันไปสำหรับผู้หญิงแต่ละคนและสามารถอยู่ได้นานสามถึงเจ็ดวัน
ความไม่สมดุลของฮอร์โมนเป็นสาเหตุของรอบประจำเดือนที่ล่าช้า ความผิดปกติของฮอร์โมนทั่วไปเรียกว่า polycystic ovarian syndrome และสามารถนำไปสู่การมีประจำเดือนที่ผิดปกติ ความเครียดทางอารมณ์ความวิตกกังวลความเหนื่อยล้าและการบำบัดทดแทนฮอร์โมนเป็นปัจจัยที่พบได้บ่อยที่สุดที่รบกวนการทำงานของระดับฮอร์โมน การรบกวนอาจเกิดจากสารแปลกปลอมในร่างกายเช่นมลภาวะต่อสิ่งแวดล้อมสารเคมีควันบุหรี่และการใช้เครื่องสำอางบางชนิดมากเกินไป การตั้งครรภ์และให้นมบุตรก็เป็นสาเหตุของการมีประจำเดือนที่ล่าช้า
อาหารที่ไม่ดีที่มีไขมันอิ่มตัวสูงอาหารแปรรูปและอาหารขยะจำนวนมากสามารถกีดกันร่างกายของสารอาหารที่จำเป็นที่จำเป็นเพื่อปรับสมดุลระดับฮอร์โมน การเปลี่ยนแปลงที่ไม่ดีต่อสุขภาพของอาหารและความผิดปกติของการรับประทานอาหารสามารถนำไปสู่การลดน้ำหนักอย่างรวดเร็วหรือการเพิ่มของน้ำหนักอย่างรวดเร็วซึ่งทั้งสองอย่างนี้อาจรบกวนวงจรการมีประจำเดือน น้ำหนักส่วนเกินโดยทั่วไปมีแนวโน้มที่จะรบกวนฮอร์โมนและเป็นปัจจัยเสี่ยงที่สำคัญสำหรับการมีประจำเดือนที่ล่าช้า การออกกำลังกายสามารถช่วยรักษาน้ำหนักให้แข็งแรง แต่ก็ควรทำอย่างพอเหมาะเพราะการออกกำลังกายอย่างหนักจะรบกวนวงจรด้วยเช่นกัน
การมีประจำเดือนล่าช้าอาจเกิดจากยาบางชนิดเช่นยาคุมกำเนิด, ยากล่อมประสาทและ corticosteroids อาจใช้เวลาหลายรอบร่างกายในการปรับฮอร์โมนใหม่ในร่างกายเมื่อผู้หญิงคนหนึ่งกำลังเกิดขึ้นหรือออกมาจากยาคุมกำเนิด การเปลี่ยนแปลงในยาอื่น ๆ อาจส่งผลให้ประจำเดือนล่าช้า สาเหตุทั่วไปอื่น ๆ ได้แก่ การเจ็บป่วยเฉียบพลันหรือระยะยาวเช่นโรคต่อมไทรอยด์สมองหรือเนื้องอกต่อมใต้สมองการติดเชื้อและความล้มเหลวของรังไข่ก่อนวัยอันควร
Perimenopause เป็นระยะก่อนวัยหมดประจำเดือนที่ร่างกายเริ่มลดการผลิตฮอร์โมน ในช่วงเวลานี้รอบเริ่มเปลี่ยน ซึ่งมักจะส่งผลให้เกิดวงจรเบาหรือหนักรอบระยะเวลาที่ล่าช้าหรือรอบประจำเดือนที่ยาวนาน
