ผู้ที่มีอาการแพ้กลูเตนมักจะแสดงอาการที่แตกต่างกันหลายประการทำให้เป็นเรื่องสำคัญที่พวกเขาจะต้องรับประทานผลิตภัณฑ์อาหารที่ปราศจากกลูเตนเท่านั้นเพื่อกำจัดปัญหา อาการแพ้กลูเตนที่พบมากที่สุด ได้แก่ อาการซึมเศร้าหงุดหงิดอ่อนเพลียและการเปลี่ยนแปลงน้ำหนักอย่างฉับพลัน ปัญหาทางเดินอาหารยังพบได้ทั่วไปในบรรดาผู้ที่ทุกข์ทรมานจากโรคภูมิต้านทานผิดปกตินี้รวมถึงอาการปวดท้องท้องอืดท้องผูกและตะคริว ในที่สุดการติดเชื้อที่บ่อยครั้งอาจเป็นสัญญาณของการแพ้กลูเตนได้เช่นกันเนื่องจากระบบภูมิคุ้มกันของร่างกายมักถูกบุกรุก เนื่องจากอาการเหล่านี้หลายอย่างสามารถส่งสัญญาณความผิดปกติต่าง ๆ การแพ้กลูเตนมักจะได้รับการวินิจฉัยเมื่อผู้ป่วยเกือบทั้งหมดสังเกตเห็นได้
หนึ่งในอาการแพ้กลูเตนที่พบบ่อยที่สุดที่ผู้คนอาจบ่นเกี่ยวกับความเหนื่อยล้าอย่างมาก ไม่น่าแปลกใจเนื่องจากอาการนี้เป็นหนึ่งในสิ่งที่บ่นมากที่สุดเมื่อมันมาถึงความเจ็บป่วยใด ๆ แต่การแพ้กลูเตนยังมาพร้อมกับโฮสต์ของสัญญาณเพิ่มเติมเช่นภาวะซึมเศร้าและหงุดหงิด อาการแพ้กลูเตนที่พบบ่อยที่สุดอีกอย่างหนึ่งคือการเพิ่มน้ำหนักโดยไม่อธิบายเมื่อทำตามอาหารที่มีอาหารที่มีกลูเตนแม้ว่าบางคนจะประสบกับการลดน้ำหนักอย่างกะทันหัน
อาการแพ้กลูเตนที่พบมากที่สุดบางส่วนเกี่ยวข้องกับระบบย่อยอาหารซึ่งอาจไม่น่าแปลกใจเนื่องจากผู้ร้ายหลักของความผิดปกตินี้เป็นผลิตภัณฑ์อาหาร อาการท้องผูกและอาการท้องอืดที่ตามมามักจะปรากฏขึ้นในความทุกข์ทรมานจากความไวตัง ในทางกลับกันอาการท้องเสียและปวดท้องมักพบในผู้ที่มีอาการแพ้กลูเตน บางคนอาจมีอาการท้องเสียและท้องผูกในวันที่สลับกันนำไปสู่อาการตะคริวปวดท้องและไม่สบายทั่วไป
ในขณะที่การไร้ความสามารถในการต่อสู้กับการติดเชื้อจำนวนมากอาจดูเหมือนไม่เกี่ยวข้องกับเงื่อนไขทางการแพทย์นี้เป็นที่คาดว่าจริง ๆ แล้วเนื่องจากการแพ้กลูเตนส่งผลให้เกิดการทำลายของเยื่อบุลำไส้เล็ก เนื่องจากนี่เป็นที่ตั้งของระบบภูมิคุ้มกันของร่างกายส่วนใหญ่จึงไม่น่าแปลกใจเลยว่าแอนติบอดีที่ปกติจะต่อสู้กับการติดเชื้อจะหายาก สิ่งนี้จะทำให้เยื่อเมือกเช่นดวงตาปากไซนัสและช่องคลอดอยู่ในความเมตตาของเชื้อโรคมักจะนำไปสู่โรคหวัดบ่อยและการติดเชื้อที่มีผลต่อไซนัสช่องคลอดตาและทางเดินปัสสาวะ นอกจากนี้ทางเดินหายใจและทางเดินอาหารยังได้รับผลกระทบอย่างมากจากความขาดแคลนของแอนติบอดีที่นำไปสู่ปัญหากระเพาะอาหารที่พบบ่อยรวมถึงแผลในลำไส้และอารมณ์เสียในลำไส้ อาการแพ้กลูเตนอื่น ๆ ที่ดูเหมือนไม่เกี่ยวข้องอื่น ๆ ได้แก่ ภาวะมีบุตรยากในชายและหญิง, การขาดวิตามิน, โรคโลหิตจาง, การแพ้แลคโตส, ปวดหัว, อารมณ์แปรปรวนและปวดกระดูกและข้อต่อ
