หนึ่งในข้อดีของการใช้อาณานิคมคือกระบวนการนี้ช่วยทำความสะอาดเยื่อบุลำไส้ใหญ่ของอุจจาระที่ได้รับผลกระทบ สิ่งนี้สามารถส่งเสริมการเคลื่อนไหวของลำไส้ให้แข็งแรงและสามารถเพิ่มการสกัดน้ำที่มีคุณค่าสารอาหารและเกลือจากของเสียที่เดินทางผ่านลำไส้ใหญ่ โคโลนียังสามารถช่วยปลดปล่อยแบคทีเรียที่ไม่ดีออกจากลำไส้ใหญ่ ข้อเสียของวารีบำบัดลำไส้ใหญ่คือขั้นตอนอาจไม่สบายใจและบางครั้งผู้ป่วยอาจมีปฏิกิริยาไม่พึงประสงค์ต่อของเหลวทำความสะอาด ขั้นตอนนี้อาจทำให้ร่างกายขาดน้ำและไม่แนะนำสำหรับผู้ป่วยที่มีอาการป่วยบางอย่าง
ลำไส้ใหญ่ชลประทานบังคับให้น้ำผ่านท่อเข้าไปในลำไส้ใหญ่ผ่านไส้ตรง ไอพ่นของน้ำกัดตัวอุจจาระที่สะสมอยู่ตามผนังลำไส้ใหญ่ ประโยชน์อย่างหนึ่งที่ผู้ป่วยมักสังเกตเห็นเป็นอันดับแรกหลังจากที่ลำไส้ใหญ่เป็นความรู้สึกของความสว่างในบริเวณลำไส้ รูปแบบของการรักษานี้ยังช่วยในการขจัดหรือลดปัญหาเกี่ยวกับอาการท้องผูก
หน้าที่ของลำไส้ใหญ่คือการแยกเกลือสารอาหารและน้ำออกจากอุจจาระก่อนที่มันจะถูกกำจัดออกโดยร่างกาย เมื่อผนังลำไส้ใหญ่เต็มไปด้วยอุจจาระการดูดซึมของส่วนประกอบที่สำคัญเหล่านี้จะถูกขัดขวาง ข้อดีอีกอย่างของการชลประทานลำไส้ใหญ่ก็คือมันช่วยปลดปล่อยผนังของลำไส้ใหญ่ให้ดีขึ้นซึ่งช่วยเพิ่มการสูญเสียน้ำสารอาหารและเกลือจากของเสีย
อุจจาระที่เต็มไปด้วยผนังของลำไส้ใหญ่อาจเป็นแหล่งกักเก็บและกระตุ้นการเติบโตของแบคทีเรียที่เป็นอันตราย เมื่อกำจัดของเสียที่เป็นของแข็งแบคทีเรียที่เป็นอันตรายก็จะถูกกำจัดออกและลำไส้ใหญ่ก็จะถูกทำความสะอาดทำให้แบคทีเรียที่ไม่ดีสามารถกลับลำไส้ใหญ่ได้ยาก แบคทีเรียที่มีประโยชน์ส่วนใหญ่อาศัยอยู่ในลำไส้เล็กดังนั้นลำไส้ใหญ่จะไม่กำจัดร่างกายของแบคทีเรียที่ดีที่จำเป็นสำหรับการย่อยอาหารที่เหมาะสม
มีรายการของเงื่อนไขทางการแพทย์มากมายที่อ้างว่าได้รับการบรรเทาจากการล้างลำไส้ใหญ่ สาเหตุที่พบบ่อยที่สุดสำหรับการรับ colonic คือการบรรเทาปัญหาการย่อยอาหารและอาการท้องผูก เหตุผลทั่วไปอื่น ๆ สำหรับการใช้อาณานิคมคือการรักษาอาการปวดหัวความดันโลหิตสูงและโรคข้ออักเสบ ชาวอาณานิคมยังได้รับการขนานนามว่าเป็นโรคสะเก็ดเงินและเส้นผมที่เปราะบาง
อันตรายและปัญหาเล็กน้อยเกี่ยวข้องกับอาณานิคม วารีบำบัดลำไส้ใหญ่ไม่ได้ถูกควบคุมและวิธีการรักษาอาจแตกต่างกันอย่างกว้างขวาง ในบางกรณีผู้ป่วยอาจมีปฏิกิริยากับสมุนไพรทำความสะอาดที่เพิ่มลงในน้ำล้าง ผู้ป่วยรายอื่นอาจกลายเป็นขาดน้ำหลังจากการรักษาลำไส้ใหญ่หรือจากยาระบายบางครั้งรวมอยู่ในการรักษา หากการขาดน้ำไม่ได้รับการแก้ไขอย่างเหมาะสมความสมดุลของอิเล็กโทรไลต์ของผู้ป่วยอาจลดลงซึ่งอาจนำไปสู่ปัญหาเกี่ยวกับไตหรือหัวใจ
การชลประทานในลำไส้ใหญ่ยังไม่แนะนำสำหรับผู้ป่วยที่เพิ่งได้รับการผ่าตัดลำไส้, ริดสีดวงทวารหรือเนื้องอกทางทวารหนัก วารีบำบัดลำไส้ใหญ่อาจทำให้สภาพเหล่านี้แย่ลงหรือก่อให้เกิดการติดเชื้ออย่างรุนแรง ในที่สุดการขับของเสียที่เป็นของเหลวตามโคโลนิกอาจทำให้รู้สึกเจ็บปวดและอึดอัด
