การติดเชื้อเรื้อรังหมายถึงกรณีที่ไม่ตอบสนองต่อการรักษาที่เป็นเวลาหลายสัปดาห์หรือที่กลับมาแม้จะรักษา นอกจากนี้การติดเชื้อเรื้อรังสามารถสร้างความเจ็บปวดให้กับระบบใด ๆ ในร่างกายมนุษย์เช่นระบบทางเดินหายใจทางเดินหายใจทางเดินอาหารและระบบไหลเวียนโลหิต ตัวอย่างของการติดเชื้อเรื้อรัง ได้แก่ การติดเชื้อที่หูเรื้อรังการติดเชื้อทางเดินปัสสาวะเรื้อรังและการติดเชื้อที่ผิวหนังเรื้อรัง
การรักษาสำหรับการติดเชื้อเรื้อรังอาจรวมถึงยาปฏิชีวนะ หากการติดเชื้อเรื้อรังถูกกำหนดให้สัมพันธ์กับสิ่งมีชีวิตที่เป็นแบคทีเรียการรักษาทางเลือกอาจเป็นการใช้ยาปฏิชีวนะ อย่างไรก็ตามหากการติดเชื้อเรื้อรังเกี่ยวข้องกับสิ่งมีชีวิตจากเชื้อไวรัสยาปฏิชีวนะจะไม่กำจัดการติดเชื้อ แพทย์จำเป็นต้องประเมินการติดเชื้อและแหล่งที่มาก่อนที่จะสั่งยาปฏิชีวนะเพื่อหลีกเลี่ยงการติดเชื้อดื้อยาในอนาคต
การติดเชื้ออย่างต่อเนื่องอาจเป็นผลมาจากระบบภูมิคุ้มกันที่ซึมเศร้าความเครียดหรือเชื้อแบคทีเรียที่มีความรุนแรงสูง นอกจากนี้การติดเชื้อเรื้อรังสามารถเกิดขึ้นได้เมื่อยาปฏิชีวนะที่กำหนดไม่แข็งแรงพอหรือเมื่อผู้ป่วยล้มเหลวในการสั่งยาทั้งหมดของเขา ในการพิจารณาว่ายาปฏิชีวนะชนิดใดที่เหมาะสมสำหรับการติดเชื้อบางครั้งแพทย์อาจสั่งการทดสอบทางการแพทย์ที่เรียกว่าการทดสอบวัฒนธรรมและความไว
ยาบางชนิดยังสามารถทำให้ติดเชื้อเรื้อรัง ตัวอย่างเช่นการติดเชื้อทางเดินปัสสาวะเรื้อรังอาจเกิดจากการเก็บปัสสาวะ เมื่อปัสสาวะถูกบังคับให้อยู่ในกระเพาะปัสสาวะเป็นเวลานานแบคทีเรียสามารถเจริญเติบโตและทำให้เกิดการติดเชื้อ ยาที่สามารถนำไปสู่การเก็บปัสสาวะ ได้แก่ antihistamines, ยาต้านความวิตกกังวลและบรรเทาอาการปวดตามใบสั่งแพทย์
เมื่อแพทย์พยายามตรวจสอบว่าผู้ป่วยมีการติดเชื้อเฉียบพลันหรือติดเชื้อเรื้อรังเขาจะพิจารณาปัจจัยสองสามอย่าง หนึ่งในปัจจัยเหล่านี้คือเส้นเวลาของการติดเชื้อ หากการติดเชื้อมีระยะเวลานานกว่าสองสามสัปดาห์มีโอกาสเกิดขึ้นที่เรื้อรัง นอกจากนี้หากการติดเชื้อมีความต้านทานต่อยาปฏิชีวนะโดยเฉพาะหรือการรักษาอื่น ๆ ก็อาจจะพิจารณาเป็นเรื้อรัง
โดยทั่วไปการรักษาสำหรับการติดเชื้อเรื้อรังและการติดเชื้อเฉียบพลันจะคล้ายกัน อย่างไรก็ตามหนึ่งในความแตกต่างอาจเป็นระยะเวลาที่ผู้ป่วยได้รับการรักษา สำหรับการติดเชื้อเฉียบพลันยาปฏิชีวนะมักจะถูกกำหนดเป็นเวลา 10 วัน สำหรับการติดเชื้อเรื้อรังอาจแนะนำให้ใช้ยาปฏิชีวนะสองครั้งหรืออาจให้กลับไปด้านหลัง ยาปฏิชีวนะสามารถทำให้เกิดอาการท้องเสียคลื่นไส้และอาเจียนอย่างไรก็ตามแพทย์สามารถแนะนำวิธีแก้ไขเพื่อลดความเสี่ยงของผลข้างเคียง
