เบราว์เซอร์จีโนมคืออะไร?

เบราว์เซอร์จีโนมเป็นเว็บอินเตอร์เฟสที่ใช้ในการดูแผนที่ทางกายภาพของโครโมโซมแผนที่นี้แสดงให้เห็นว่า DNA แยกยีนสองตัวเท่าที่วัดเป็นคู่ฐานโครโมโซมของมนุษย์มีขนาดตั้งแต่ 50 ล้านถึง 250 ล้านคู่ฐานเบราว์เซอร์จีโนมแสดงการแสดงแผนผังของโครโมโซมทั้งหมดเช่นเดียวกับการซูมในแผนผังของยีนเดี่ยวและแม้กระทั่งลำดับคู่ฐานจริง

เบราว์เซอร์จีโนมช่วยให้ผู้ใช้สามารถเลื่อนโครโมโซมและซูมในบางสถานที่เบราว์เซอร์จีโนมจำนวนมากอนุญาตให้ผู้ใช้ซูมเข้าในระดับของการดูลำดับดีเอ็นเอจริงแม้ว่ายูทิลิตี้จริงของเบราว์เซอร์จะอยู่ในความสามารถในการดูยีนในบริบทที่ใหญ่กว่าแทนที่จะดูลำดับดีเอ็นเอในระดับนิวคลีโอไทด์ขนาดเฉลี่ยของยีนคือ 3,000 คู่ฐานดังนั้นเมื่อซูมเข้าที่ระดับคู่ฐานผู้ใช้จะเห็นน้อยกว่ายีนทั้งหมดDystrophin ยีนที่ใหญ่ที่สุดของมนุษย์มีความยาวฐาน 2.4 ล้านคู่

นอกเหนือจากการดูการแสดงแผนผังของยีนเบราว์เซอร์จีโนมอาจแสดงข้อมูลที่เป็นประโยชน์อื่น ๆซึ่งอาจรวมถึงส่วนของยีนที่แปลเป็นโปรตีนเรียกว่า mRNA และลำดับดีเอ็นเอที่มีฟังก์ชั่นอื่นนอกเหนือจากการเข้ารหัสสำหรับโปรตีนเบราว์เซอร์จีโนมอาจแสดงให้เห็นว่าส่วนใดของ DNA ที่ใช้ในกระบวนการจัดลำดับจีโนม

สิ่งมีชีวิตจำนวนมากมีจีโนมลำดับไม่มีเบราว์เซอร์เดี่ยวที่เป็นมาตรฐานในสาขาจีโนมดังนั้นเบราว์เซอร์จีโนมอาจแตกต่างกันระหว่างจีโนมที่เรียงลำดับเบราว์เซอร์จีโนมมีหน้าที่ของความสามารถในการค้นหายีนหรือลำดับที่น่าสนใจทำให้ผู้ใช้สามารถกระโดดจากที่ตั้งจีโนมหนึ่งไปยังอีกที่หนึ่งมันจะไม่มีประสิทธิภาพในการเลื่อนโครโมโซมเพื่อไปยังสถานที่ที่น่าสนใจเนื่องจากมีขนาดใหญ่มากของโครโมโซมส่วนใหญ่

เบราว์เซอร์จีโนมบางตัวมีเครื่องมือที่เรียกว่า Gene Sortersเครื่องมือนี้แสดงตารางของยีนที่เกี่ยวข้องซึ่งกันและกันความสัมพันธ์สามารถเป็นหนึ่งในหลายประเภท: ลำดับความคล้ายคลึงกันโปรไฟล์การแสดงออกที่คล้ายกันหรือความใกล้ชิดจีโนมผู้ใช้ค้นหายีนโดยใช้คำหรือวลีเลือกประเภทของความสัมพันธ์ที่เขาหรือเธอต้องการและตัวเรียงลำดับยีนแสดงผลลัพธ์ของการค้นหา