การทดสอบอุจจาระเป็นขั้นตอนทางการแพทย์ซึ่งตัวอย่างอุจจาระขนาดเล็กจะถูกรวบรวมและทดสอบสำหรับความผิดปกติเช่นการติดเชื้อหรือการปรากฏตัวของเลือด พยาธิลำไส้, มะเร็งลำไส้ใหญ่, หรือการแพ้แลคโตสสามารถวินิจฉัยได้จากการตรวจอุจจาระ ในกรณีส่วนใหญ่ตัวอย่างจะถูกรวบรวมที่บ้านแล้วส่งไปยังสำนักงานแพทย์หรือห้องปฏิบัติการแม้ว่าสมาชิกในทีมแพทย์อาจเก็บตัวอย่างบางครั้ง หากต้องเก็บตัวอย่างที่บ้านเจ้าหน้าที่การแพทย์จะให้คำแนะนำโดยละเอียดเกี่ยวกับวิธีการรวบรวมและจัดเก็บตัวอย่างอย่างถูกต้อง คำถามหรือข้อสงสัยใด ๆ เกี่ยวกับการทดสอบอุจจาระควรปรึกษากับแพทย์ผู้ดูแล
ในหลายกรณีแพทย์จะสั่งการตรวจอุจจาระหากมีคนสงสัยว่าเป็นโรคอาหารเป็นพิษ หากตัวอย่างอุจจาระมีแบคทีเรียบางประเภทและสามารถตรวจสอบย้อนกลับไปยังอาหารชนิดใดประเภทหนึ่งได้อาหารสามารถถูกลบออกจากการไหลเวียนเพื่อให้คนอื่นไม่ป่วย การติดเชื้อปรสิตสามารถวินิจฉัยได้ด้วยการทดสอบอุจจาระ เมื่อชนิดของปรสิตถูกระบุการรักษาที่เหมาะสมสามารถเริ่มต้น
หากการตรวจอุจจาระพบเลือดในอุจจาระพบว่าอาจมีการฉีกขาดในบริเวณทวารหนักความเสียหายที่เกี่ยวข้องกับกระเพาะอาหารหรือลำไส้หรือมะเร็งลำไส้ใหญ่ การทดสอบเพิ่มเติมเช่น ultrasounds หรือ biopsies อาจดำเนินการตามผลลัพธ์จากการทดสอบนี้ การตรวจอุจจาระบางอย่างโดยเฉพาะการทดสอบที่ออกแบบมาเพื่อตรวจหามะเร็งลำไส้ใหญ่มักจะทำที่บ้านและส่งไปยังห้องปฏิบัติการภายนอก ผลลัพธ์จะถูกส่งกลับไปยังผู้ป่วยภายในไม่กี่วันหรือสัปดาห์ ผลลัพธ์ที่ผิดปกติใด ๆ ควรแจ้งให้แพทย์ไปพบแพทย์เพื่อติดตามผล
ตัวอย่างอุจจาระที่เก็บที่บ้านมักจะวางลงในภาชนะพลาสติกที่แพทย์สั่ง ตัวอย่างจะถูกส่งไปที่สำนักงานแพทย์หรือห้องปฏิบัติการตามคำสั่งของเจ้าหน้าที่ทางการแพทย์ หากไม่สามารถส่งตัวอย่างได้ทันทีหลังจากเก็บรวบรวมควรเก็บในตู้เย็นจนกว่าจะพร้อมนำออกมา ในกรณีที่แพทย์ให้คำแนะนำเฉพาะในการรวบรวมและจัดเก็บตัวอย่างสำหรับการทดสอบอุจจาระควรปฏิบัติตามอย่างระมัดระวัง หลังจากที่แพทย์มีผลการทดสอบแผนการรักษาเป็นรายบุคคลสามารถพัฒนาขึ้นอยู่กับความต้องการเฉพาะของผู้ป่วย


