โปรไฟล์การแสดงออกของยีนคืออะไร?

การทำโปรไฟล์การแสดงออกของยีนเป็นวิธีการวัดระดับกิจกรรมของยีนหลายพันยีนในเวลาเดียวกันการระบุรูปแบบการแสดงออกของยีนในสิ่งมีชีวิตเป็นขั้นตอนต่อไปหลังจากจีโนมของสิ่งมีชีวิตได้รับการจัดลำดับการทดลองทำโปรไฟล์การแสดงออกของยีนมักจะดำเนินการกับจีโนมทั้งหมดของสิ่งมีชีวิตในครั้งเดียวการวัดระดับการแสดงออกของยีนในสิ่งมีชีวิตให้ภาพว่าเซลล์ของสิ่งมีชีวิตทำงานอย่างไรในระหว่างวัฏจักรเซลล์หรือในการตอบสนองต่อสิ่งเร้าเฉพาะ

ยีนของสิ่งมีชีวิตสามารถอยู่ในหนึ่งในสองสถานะ: เปิดหรือปิดเมื่อเปิดยีนเปิดมันจะถูกถอดความเป็น Messenger RNA ซึ่งให้คำแนะนำในการสร้างโปรตีนซึ่งถูกเข้ารหัสโดยยีนเมื่อยีนเปิดใช้งานพวกเขาจะถูกกล่าวว่ามีการแสดงออกเมื่อยีนถูกปิดมันจะไม่ถูกถอดความเป็น mRNA และไม่ได้แสดงออกมา

DNA ของสิ่งมีชีวิตเซลล์เดียวมียีนหลายพันตัว แต่มีเพียงส่วนหนึ่งของยีนเหล่านั้นที่เปิดใช้งานได้ตลอดเวลารูปแบบของการแสดงออกของยีนภายในเซลล์ ณ เวลาใดเวลาหนึ่งเรียกว่าโปรไฟล์ยีนของมันการดูประเภทของยีนที่เปิดอยู่ในเซลล์สามารถให้ข้อมูลที่สำคัญจำนวนมากเกี่ยวกับเซลล์และสิ่งมีชีวิต

ในการทดลองทำโปรไฟล์การแสดงออกของยีนเทคโนโลยี DNA microarray ใช้เพื่อรับการวัดกิจกรรมสัมพัทธ์ของยีนที่จัดลำดับก่อนหน้านี้การทดลองเหล่านี้มักเกี่ยวข้องกับการวัดปริมาณ mRNA ในการตั้งค่าการควบคุมและในการตั้งค่าการทดลองเพื่อกำหนดผลกระทบของตัวแปรหนึ่งตัวหรือมากกว่าต่อการแสดงออกของยีนการใช้การควบคุมเป็นสิ่งสำคัญเนื่องจากจะสร้างระดับ mRNA พื้นฐานสำหรับสภาวะเซลล์ปกติ

ดูว่าระดับ mRNA เปลี่ยนแปลงไปอย่างไรในการตอบสนองต่อสิ่งเร้าแสดงให้เห็นว่าความต้องการของเซลล์สำหรับโปรตีนเปลี่ยนแปลงอย่างไรในการตอบสนองต่อสภาพแวดล้อมใหม่ข้อมูลนี้มีประโยชน์สำหรับวัตถุประสงค์ในการวิจัยที่บริสุทธิ์ แต่อาจมีความสำคัญในการแพทย์ตัวอย่างเช่นหากใช้เซลล์มะเร็งเต้านมใน DNA microanalysis โปรไฟล์อาจแสดงให้เห็นว่าในเซลล์เต้านมมะเร็งตัวรับบางประเภทจะทำงานซึ่งปกติจะไม่ทำงานหากตัวรับแสดงให้เห็นว่าเป็นมะเร็งเฉพาะมันอาจพิสูจน์ได้ว่าเป็นเป้าหมายของยาที่มีประสิทธิภาพ

การจัดทำโปรไฟล์การแสดงออกของยีนในความเป็นจริงถูกนำมาใช้เป็นมาตรการพยากรณ์โรคสำหรับมะเร็งเต้านมสิ่งนี้มีประโยชน์เพราะผู้หญิงในระยะเดียวกันของโรคสามารถตอบสนองต่อการรักษาที่แตกต่างกันมากและมีการพยากรณ์โรคที่แตกต่างกันมากการใช้ DNA microanalysis เพื่อสร้างโปรไฟล์การแสดงออกของยีนได้แสดงให้เห็นในการศึกษาอย่างน้อยหนึ่งครั้งว่าโปรไฟล์การแสดงออกของยีนบางอย่างในเซลล์มะเร็งเต้านมมีความสัมพันธ์กับการพยากรณ์โรคที่ไม่ดีการประยุกต์ใช้เทคโนโลยีการทำโปรไฟล์การแสดงออกของยีนนี้ช่วยระบุผู้หญิงที่อาจได้รับประโยชน์จากการรักษาที่ก้าวร้าวมากขึ้น