แบคทีเรียซัลโมเนลลาเป็นกลุ่มจุลินทรีย์ที่สามารถทำให้เกิดอาหารเป็นพิษอย่างร้ายแรง พวกเขาถูกฆ่าตายด้วยความร้อนและเป็นอันตรายมากขึ้นในอาหารดิบ ถั่วงอกกรอบอัลฟัลฟาถั่วงอกหรือรูปแบบอื่น ๆ ที่มักจะเสิร์ฟถั่วงอกดิบแทนที่จะปรุงสุก ต้นกล้าและซาลโมเนลล่าเกี่ยวข้องกับประเด็นต่าง ๆ เช่นปุ๋ยจากสัตว์ที่ติดเชื้อในพืชหรือจากเครื่องจักรที่ปนเปื้อนที่ใช้ในการแปรรูปพืช
ถั่วงอกและซัลโมเนลล่านั้นมีความสัมพันธ์กันอย่างใกล้ชิดในหลายประเทศทั่วโลกไม่ว่าต้นถั่วของพืชใด ๆ จะถูกนำไปบริโภค ตัวอย่างของถั่วงอกที่เกี่ยวข้องกับโรคอาหารเป็นพิษของซัลโมเนลล่า ได้แก่ อัลฟัลฟาถั่วเขียวและถั่วงอกหัวไชเท้า ต้นไม้เล็กเหล่านี้ปลูกจากเมล็ดในฟาร์มที่แตกหน่อ
ในหลาย ๆ กรณีเมล็ดของตัวเองจะถูกปนเปื้อนด้วยเชื้อแบคทีเรียซัลโมเนลลา เมล็ดเหล่านี้อาจปนเปื้อนจากสัตว์หรือมูลนก เครื่องจักรกลการเกษตรที่ดำเนินการเมล็ดอาจปนเปื้อนด้วย ปุ๋ยที่ใช้ในการผสมพันธุ์พืชหรือน้ำชลประทานที่มีแบคทีเรียสามารถฝากเชื้อ Salmonella ไว้ในเมล็ดได้
กระบวนการที่ฆ่าสิ่งปนเปื้อนใด ๆ บนเมล็ดนั้นมีไว้สำหรับเกษตรกรผู้ปลูก แต่อาจมีราคาแพงสำหรับฟาร์มที่มีการแตกหน่อ เทคนิคเหล่านี้รวมถึงการอาบเมล็ดในสารละลายแคลเซียมไฮโปคลอไรต์หรือการฉายรังสีเมล็ด ฟาร์มออร์แกนิกอาจปฏิเสธเทคนิคที่ขัดต่อจริยธรรมออร์แกนิก
ฟาร์มที่งอกแล้วมักจะปลูกเมล็ดในสภาพแวดล้อมในร่มที่เก็บไว้ที่อุณหภูมิอบอุ่นด้วยความชื้นสูง เงื่อนไขเหล่านี้เหมาะอย่างยิ่งสำหรับถั่วงอกและแบคทีเรียซัลโมเนลล่าที่จะเติบโต ซัลโมเนลลาติดเชื้อมนุษย์และสัตว์อื่น ๆ และชอบที่จะเติบโตที่อุณหภูมิของร่างกายและในสภาพที่มีน้ำมากเช่นมีอยู่ในร่างกายมนุษย์ แม้ว่าในตอนแรกเมล็ดมีการปนเปื้อนของแบคทีเรียในระดับต่ำ แต่เมล็ดเหล่านี้สามารถเจริญเติบโตและเพิ่มจำนวนถึงระดับที่เป็นอันตรายในระหว่างกระบวนการแตกหน่อ
สำนักงานคณะกรรมการอาหารและยาของสหรัฐอเมริกาแนะนำว่าคนบางกลุ่มหลีกเลี่ยงการรับประทานถั่วงอกดิบเนื่องจากเสี่ยงต่อการติดเชื้อ คนที่อ่อนแอ ได้แก่ ผู้สูงอายุสตรีมีครรภ์เด็กและผู้ที่มีปัญหาระบบภูมิคุ้มกัน การปรุงถั่วงอกเป็นวิธีการเดียวที่ชัดเจนในการขจัดความเสี่ยงของการติดเชื้อถึงแม้ว่าบางคนอาจยังคงชอบที่จะกินถั่วงอกดิบหรือสุกเล็กน้อยสำหรับพื้นผิวกรุบ
นอกเหนือจากการเชื่อมต่อระหว่างถั่วงอกและซาลโมเนลลาแล้วถั่วงอกดิบยังสามารถเก็บเชื้อแบคทีเรียที่เป็นพิษต่ออาหาร E coli และ Listeria monocytogenes แม้ว่าถั่วงอกจะเป็นแหล่งของอาหารเป็นพิษ แต่ก็ไม่ได้เป็นเพียงแหล่งเดียว อาหารใด ๆ ที่อาจสัมผัสกับอุจจาระที่ปนเปื้อนเช่นมูลสัตว์และจากนั้นไม่ได้รับการปรุงอาหารเป็นแหล่งที่มาของความเจ็บป่วย
