ฝีที่เกิดจากหนองรวมตัวกันในเนื้อเยื่อของร่างกายที่เกิดช่องเนื่องจากการติดเชื้อ พยาธิสรีรวิทยาของฝีเป็นชุดของการตอบสนองของระบบภูมิคุ้มกันเริ่มต้นด้วยการโยกย้ายของเซลล์เม็ดเลือดขาวเพื่อการติดเชื้อและการแยกของโพรงที่เต็มไปด้วยของเหลวจากเนื้อเยื่อรอบที่มีสุขภาพดี ฝีบางอย่างเป็นผลมาจากท่ออุดตันในต่อมในขณะที่คนอื่น ๆ เกิดจากการบาดเจ็บติดเชื้อบ่อยครั้งโดยแบคทีเรีย Staphylococcus aureus บ่อย
พยาธิสรีรวิทยาของฝีเริ่มต้นในเนื้อเยื่อที่เสียหายเมื่อระบบภูมิคุ้มกันป้องกันสารแปลกปลอมและจุลินทรีย์ที่อาจเป็นอันตรายจากการแพร่กระจาย ในระหว่างการติดเชื้อเซลล์เม็ดเลือดขาวจำนวนมากโดยเฉพาะนิวโทรฟิลจะอพยพไปยังเนื้อเยื่อที่ถูกบุกรุก พวกเขาทำสิ่งนี้ตามสัญญาณจากไซโตไคน์ที่เตือนพวกเขาถึงการตายของเซลล์และการบาดเจ็บ หนองซึ่งเป็นส่วนผสมของเซลล์ที่ตายแล้วและผู้ไกล่เกลี่ยทางเคมีของการตอบสนองของภูมิคุ้มกันจะเติมพื้นที่รอบ ๆ ไซต์ซึ่งถูกแยกออกจากเนื้อเยื่อที่มีสุขภาพโดยการก่อตัวของผนังฝี พยาธิสรีรวิทยาของฝีสามารถทำให้เกิดผลกระทบที่คุกคามต่อชีวิตหากฟันผุเกิดขึ้นในอวัยวะเช่นตับ
ในฝีแก้ปวดหนองสะสมอยู่เหนือเยื่อหุ้มชั้นนอก Dural ที่ครอบคลุมสมองและกระดูกสันหลัง, บวมกับกะโหลกหรือกะโหลก การติดเชื้อที่หายากเหล่านี้มีความคล้ายคลึงกว่าไขสันหลังมากกว่าในกะโหลกศีรษะ พยาธิสรีรวิทยาของฝีในกะโหลกหรือกระดูกสันหลังมักมีความซับซ้อนเนื่องจากความเสียหายที่เกิดขึ้นกับเนื้อเยื่อของระบบประสาทโดยความดันของเหลวเมื่อบวมเพิ่มขึ้น ฝีฟันมาจากการติดเชื้อในท้องถิ่นในบริเวณรอบ ๆ เส้นประสาทที่ทำขึ้นรากฟัน มันทำให้เกิดอาการปวดอย่างรุนแรงและถ้าแตกสามารถส่งเชื้อแบคทีเรียเข้าสู่กระแสเลือดเสี่ยงต่อการติดเชื้อในระบบ
การอุดตันของต่อมสามารถปิดพื้นที่ของเนื้อเยื่อที่ทำให้ฝีในรูปแบบหากติดเชื้อ จุลินทรีย์ต่าง ๆ สามารถกระตุ้นพยาธิสรีรวิทยาของฝีของ Bartholin ซึ่งเป็นอาการบวมที่เจ็บปวดในต่อมของ Bartholin ในช่องคลอด หากต่อมมีความรับผิดชอบต่อการหลั่งในช่องคลอดที่มีสุขภาพดีพัฒนาท่อที่ถูกปิดกั้นของเหลวสามารถสะสมในช่วงเวลา แบคทีเรียอาจติดเชื้อที่ต่อมบวมจนถึงจุดที่มันไวมาก ในทำนองเดียวกันฝีในผิวหนังหรือฝีสามารถเกิดขึ้นได้จากต่อมเหงื่อที่อุดตันซึ่งติดเชื้อ
ความแตกต่างในพยาธิสรีรวิทยาของฝีไม่มีผลต่อการรักษาขั้นพื้นฐานอย่างมาก เนื่องจาก เชื้อ Staphylococcus aureus เป็นสาเหตุของฝีการรักษาด้วยยาปฏิชีวนะแบบดั้งเดิมจึงมาพร้อมกับการผ่าตัดในฐานะเป็นแกนนำหลักของการดูแลทางการแพทย์ แต่เมื่อสิ่งมีชีวิตนี้พัฒนากลายเป็น Staphylococcus aureas ที่ ทนต่อ methicillin (MRSA) ช่วงของยาปฏิชีวนะที่ใช้ในการลดภาวะแทรกซ้อนได้เพิ่มขึ้น ฝีจำนวนมากโดยเฉพาะอย่างยิ่งที่มีขนาดใหญ่จะต้องมีการผ่าตัดรักษาเพื่อระบายหนองที่มีอยู่จากแผลเพื่อการรักษาที่เหมาะสม สิ่งนี้มักเป็นจริงโดยไม่คำนึงถึงสาเหตุของการติดเชื้อ
