Skip to main content

กราฟิกโมเลกุลคืออะไร?

คำว่ากราฟิกหมายถึงภาพวาดหรือรูปภาพที่สร้างขึ้นตามกฎคณิตศาสตร์โมเลกุลหมายถึงโมเลกุลและส่วนประกอบของพวกเขาดังนั้นความหมายอย่างหนึ่งของกราฟิกโมเลกุล (MG) คือการศึกษาโมเลกุลผ่านการสร้างภาพของโมเลกุลของตัวเองและชิ้นส่วนส่วนประกอบของพวกเขากราฟิกโมเลกุลยังหมายถึงการพรรณนาสามมิติของโมเลกุลที่ทำเพื่อตรวจสอบและเข้าใจการตอบสนองของพวกเขาในระหว่างการตอบสนองและการโต้ตอบ

กราฟิกโมเลกุลมีข้อได้เปรียบบางอย่างมากกว่าแบบจำลองทางกายภาพแบบจำลองทางกายภาพอาจทำให้เกิดปัญหาได้เนื่องจากโครงสร้างถูกบดบังมีความประทับใจที่ผิดพลาดของความยืดหยุ่นการซ้อนทับแทบจะเป็นไปไม่ได้หรือเป็นเรื่องยุ่งยากเกินไปที่จะทำงานด้วยปัญหาทั้งหมดเหล่านี้สามารถเอาชนะได้ด้วยกราฟิกคอมพิวเตอร์

การใช้กราฟิกระดับโมเลกุลหนึ่งครั้งคือการศึกษาโปรตีนและกรดนิวคลีอิกการวิจัยการทำงานร่วมกันสำหรับ Bioinformatics โครงสร้าง (RCSB) Protein Data Bank (PDB) ซึ่งข้อมูลที่กำหนดไว้ในการทดลองเกี่ยวกับโครงสร้างของกรดนิวคลีอิกโปรตีนและชุดประกอบที่ซับซ้อนจะถูกเก็บไว้เพื่อการเข้าถึงทั่วไปณ วันที่ 27 เมษายน 2010 มีโครงสร้าง 64,932 โครงสร้างในฐานข้อมูลRCSB เป็นที่นิยมในการทำงานของพวกเขาด้วยคำเชิญให้ผู้เยี่ยมชมสร้างโมเดลไวรัส 3 มิติที่ Rutgers University ในวัน RutgersRCSB ยังสนับสนุนการทดลองแบบจำลองโปรตีนที่โอลิมปิกวิทยาศาสตร์ระดับภูมิภาคในสหรัฐอเมริกาธนาคารข้อมูลโปรตีนทั่วโลก (WWPDB) เป็นองค์กรระหว่างประเทศที่กลุ่มเช่น RCSB;PDBE คู่หูชาวยุโรปและ PDBJ คู่ของญี่ปุ่นเป็นของ.

พื้นที่อื่นที่กราฟิกโมเลกุลมีความสำคัญอย่างยิ่งคือการออกแบบยาโมเลกุลกราฟิกช่วยออกแบบยา mdash;หรือที่เรียกว่าการออกแบบยาที่ใช้คอมพิวเตอร์ช่วย (CADD), การออกแบบโมเลกุลคอมพิวเตอร์ช่วย (CAMD) หรือการออกแบบยาตามโครงสร้าง (SBDD) MDASH;เป็นหนึ่งในความสนใจด้านการวิจัยที่สำคัญของคณะที่เกี่ยวข้องกับความเชี่ยวชาญด้านเคมียาของมหาวิทยาลัยเวอร์จิเนียในเวอร์จิเนียในหลักสูตรบัณฑิตศึกษาด้านเภสัชศาสตร์

ซอฟต์แวร์พิเศษในการสร้างกราฟิกโมเลกุลที่เรียกว่า

ซอฟต์แวร์การออกแบบโมเลกุล

มีอยู่ในแพ็คเกจเชิงพาณิชย์จำนวนมากมีรุ่นเฉพาะที่อุทิศให้กับการออกแบบยาที่ใช้โมเลกุลกราฟิกเช่นกันในการออกแบบยาคุณลักษณะของการเชื่อมต่อ - ความสามารถในการเชื่อมต่อโมเลกุลที่แสดงกับตัวรับ - เป็นหนึ่งในคุณลักษณะที่สำคัญที่แยกแยะซอฟต์แวร์การออกแบบยาแบบฟอร์มซอฟต์แวร์การออกแบบโมเลกุลอื่น ๆ