การจำลองและการสร้างแบบจำลองด้วยคอมพิวเตอร์เกือบจะไปพร้อมกันเสมอกันเนื่องจากคอมพิวเตอร์ใช้รูปแบบต่าง ๆ เพื่อจำลองสถานการณ์ แบบจำลองสองแบบที่ใช้กันโดยทั่วไปในการจำลองด้วยคอมพิวเตอร์คือแบบจำลองทางคณิตศาสตร์และแบบจำลองสามมิติ การจำลองด้วยคอมพิวเตอร์สามารถใช้แบบจำลองหนึ่งหรือสองแบบเพื่อสร้างสถานการณ์ที่เป็นนามธรรมซึ่งผลลัพธ์จะเป็นส่วนสำคัญของการวิจัยและพัฒนา ซอฟต์แวร์การจำลองจะดำเนินการเปลี่ยนแปลงที่แตกต่างกันของแบบจำลองคอมพิวเตอร์เพื่อกำหนดผลกระทบของการกระทำเหล่านี้ การประยุกต์ใช้การจำลองด้วยคอมพิวเตอร์และการสร้างแบบจำลองมีอยู่ในเกือบทุกสาขาวิทยาศาสตร์ที่สำคัญรวมถึงชีววิทยาเคมีและฟิสิกส์
พลวัตของการจำลองด้วยคอมพิวเตอร์และการสร้างแบบจำลองนั้นง่าย - ผู้พัฒนาสร้างแบบจำลองตามความต้องการและแบบจำลองการออกแบบเพื่อใช้ในการจำลอง การจำลองเป็นโปรแกรมคอมพิวเตอร์ที่เขียนขึ้นเพื่อสร้างสถานการณ์และเงื่อนไขบางอย่างในขณะที่แบบจำลองเป็นวัตถุที่ใช้ในการจำลอง นักวิจัยมักอาศัยการจำลองและการสร้างแบบจำลองด้วยคอมพิวเตอร์เพื่อศึกษาสภาพที่อาจไม่น่าเป็นไปได้แม้จะเป็นไปไม่ได้ที่จะสังเกตการณ์ทางร่างกาย ยกตัวอย่างเช่นนักฟิสิกส์อาจใช้แบบจำลองเพื่อพิจารณาผลกระทบของซุปเปอร์โนวาบนดาวเคราะห์ใกล้เคียง นักพัฒนาและนักการตลาดอาจต้องจำลองสถานการณ์เพื่อแสดงความสามารถของผลิตภัณฑ์ที่ไม่ได้มีอยู่จริง
แบบจำลองมักแสดงถึงวัตถุที่ถูกดัดแปลงในการจำลอง วัตถุเหล่านี้จะถูกดำเนินการที่แตกต่างกันโดยมีผลกระทบที่บันทึกไว้เพื่อการตรวจสอบและการนำเสนอ ยกตัวอย่างเช่นนักวิจัยสามารถสร้างแบบจำลองเพื่อพิจารณาผลกระทบของการพังทลายของลมบนหิน จากนั้นเขาจะสร้างแบบจำลองการคำนวณสำหรับหินโดยใช้การคำนวณทางคณิตศาสตร์ของความหนาแน่นรูปร่างและลักษณะอื่น ๆ เมื่อการจำลองดำเนินไปนักวิจัยจะนำแบบจำลองหินไปยังโปรแกรมลมที่ออกแบบมาเพื่อกัดเซาะหิน
นอกจากนี้ยังสามารถสร้างแบบจำลองสำหรับวัตถุคงที่ในการจำลอง - วัตถุที่ไม่ได้จัดการโดยโปรแกรมในทางใดทางหนึ่ง เหล่านี้มักจะใช้เพื่อกำหนดค่าคงที่และข้อ จำกัด ด้านสิ่งแวดล้อม ตัวอย่างเช่นบุคคลที่ใช้การจำลองสำหรับเลเซอร์สามารถสร้างแบบจำลองสำหรับอนุภาคในอากาศที่อาจอยู่ในเส้นทางของเลเซอร์และอาจส่งผลกระทบต่อผลลัพธ์สุดท้ายของการจำลอง ในกรณีที่มีการใช้การจำลองและการสร้างแบบจำลองคอมพิวเตอร์เป็นหลักสำหรับการนำเสนอด้วยภาพตัวแบบคงที่อาจแสดงถึงตำแหน่งที่ตัวแบบอื่นเคลื่อนที่หรือทำหน้าที่เป็นวัตถุที่ไม่สามารถเคลื่อนย้ายได้
