ในการเลือกโหมดการช่วยหายใจที่ดีที่สุดจำเป็นต้องพิจารณาสภาพทางการแพทย์พื้นฐานของผู้ป่วยระดับจิตสำนึกและประเภทของเครื่องช่วยหายใจที่ใช้ เนื่องจากโหมดการระบายอากาศมักจะปรับตามการตอบสนองของผู้ป่วยจึงต้องทำการประเมินผู้ป่วยอย่างต่อเนื่อง โหมดการระบายอากาศสามารถเปลี่ยนแปลงได้หลังจากได้รับก๊าซเลือดแดงซึ่งช่วยวัดการตอบสนองทางกายภาพของบุคคลต่อเครื่องช่วยหายใจ
ต้องพิจารณาประเภทของลูกหมุนระบายอากาศที่ใช้ เครื่องช่วยหายใจหลายประเภทสามารถให้การระบายอากาศได้หลายโหมดให้เลือกเช่นการควบคุมช่วยการซิงโครไนซ์การบังคับที่ต่อเนื่องเป็นระยะ (SIMV) และความดันทางเดินหายใจบวกอย่างต่อเนื่อง (CPAP) เครื่องช่วยหายใจบางตัวอาจไม่มีตัวเลือกสำหรับทุกโหมด ตัวอย่างเช่นเครื่องช่วยหายใจแบบพกพาอาจมีตัวเลือกน้อยลงเนื่องจากมักใช้ระยะสั้นในการขนส่ง เครื่องช่วยหายใจในบ้านซึ่งมีไว้สำหรับการใช้งานในระยะยาวอาจไม่มีโหมดทั้งหมด
โหมดให้การสนับสนุนในระดับที่แตกต่างกันและอาจส่งอากาศในปริมาณที่กำหนดหรือความดันที่กำหนดเข้าไปในปอด ด้วยความดันที่กำหนดส่งปริมาณอาจเปลี่ยนแปลง เมื่อปริมาตรที่ตั้งไว้ถูกส่งออกไปความดันอาจเปลี่ยนแปลงไปตามลมหายใจแต่ละครั้ง เมื่อเลือกโหมดการระบายอากาศที่ดีที่สุดสิ่งสำคัญคือต้องพิจารณาสิ่งที่ต้องควบคุมเพิ่มเติมความดันปอดหรือปริมาณอากาศที่เข้าไปในปอด
ขึ้นอยู่กับโหมดการช่วยหายใจที่ใช้การตั้งค่าเครื่องช่วยหายใจต่างๆจะต้องเริ่มต้นขึ้น ระดับออกซิเจนถูกกำหนดด้วยการระบายอากาศทุกโหมด ในบางโหมดอัตราการหายใจก็ถูกกำหนดเช่นกัน นอกจากนี้ยังสามารถตั้งค่าความเร็วในการหายใจส่วนที่หายใจได้ด้วย
ระดับจิตสำนึกของผู้ป่วยควรเป็นปัจจัยในการเลือกโหมดการช่วยหายใจที่ดีที่สุด บางโหมดทำให้ผู้ป่วยหายใจได้สะดวกขึ้นเมื่อเขาตื่นขึ้นมาอย่างสมบูรณ์ หากผู้ป่วยไม่สามารถหายใจได้ด้วยตนเองต้องใช้โหมดที่ให้การสนับสนุนอย่างเต็มที่ โหมดเช่น SIMV สามารถเลือกได้ว่าเครื่องจะส่งลมหายใจได้อย่างไร แต่ผู้ป่วยก็เริ่มหายใจด้วยตัวเอง โหมดนี้อาจจะดีที่สุดหากผู้ป่วยไม่ได้รับการกระตุ้นเต็มที่
เมื่อผู้ป่วยตื่นตัวมากขึ้นและเริ่มหายใจด้วยตนเองควรพิจารณาโหมดเช่น CPAP ในระหว่างการระบายอากาศในโหมด CPAP จะไม่มีการส่งลมหายใจตามจำนวนที่กำหนดไว้ ผู้ป่วยกำลังหายใจทั้งหมดด้วยตัวเอง มีเพียงชุดรองรับแรงดันและออกซิเจนที่ตั้งค่าไว้เท่านั้น มักใช้ CPAP เมื่อผู้ป่วยกำลังหย่านมจากเครื่องช่วยหายใจ
