การเลือกผลิตภัณฑ์ต้านเชื้อแบคทีเรียตามธรรมชาติที่ดีที่สุดมักเป็นเรื่องของการลองผิดลองถูกและส่วนใหญ่ขึ้นอยู่กับวิธีการใช้งานและความชอบส่วนบุคคล สมุนไพรเช่นยูคาลิปตัสน้ำมันทีทรีและมะนาวสามารถใช้อย่างเดียวหรือใช้ร่วมกับผลิตภัณฑ์เครื่องสำอางหรือน้ำยาทำความสะอาดเพื่อให้ผลต้านเชื้อแบคทีเรีย อาหารเช่นกระเทียมและวาซาบิอาจช่วยทำลายแบคทีเรียในกระแสเลือดหรือทางเดินอาหารเมื่อบริโภคภายใน น้ำส้มสายชูและไฮโดรเจนเปอร์ออกไซด์เป็นผลิตภัณฑ์ต้านเชื้อแบคทีเรียตามธรรมชาติที่มีการใช้งานที่หลากหลายเช่นกัน ผลข้างเคียงเชิงลบที่เกี่ยวข้องกับการใช้ผลิตภัณฑ์ต้านเชื้อแบคทีเรียตามธรรมชาตินั้นค่อนข้างหายากแม้ว่าแพทย์ควรได้รับคำปรึกษาหากมีคำถามหรือข้อสงสัยใด ๆ
ยูคาลิปตัสถูกเติมเข้าไปในผลิตภัณฑ์ต้านเชื้อแบคทีเรียตามธรรมชาติหลายชนิดเนื่องจากมีคุณสมบัติต้านเชื้อแบคทีเรียตามธรรมชาติ น้ำมันที่สกัดจากต้นไม้นี้มีการใช้มานานหลายศตวรรษเพื่อรักษาสภาพทางการแพทย์เช่นความแออัดของหน้าอกโรคข้ออักเสบและสภาพผิวที่อักเสบ พืชชนิดนี้ไม่ปลอดภัยต่อการบริโภคในช่องปากและควรใช้เป็นเพียงยาทา ผลข้างเคียงที่เป็นไปได้ของยูคาลิปตัสรวมถึงการระคายเคืองผิวและลดระดับน้ำตาลในเลือด
น้ำมันทีทรีมักถูกใช้เป็นส่วนเสริมจากผลิตภัณฑ์ต้านเชื้อแบคทีเรียตามธรรมชาติเช่นสบู่น้ำยาทำความสะอาดและครีมเครื่องสำอาง น้ำมันนี้ได้รับการพิจารณาอย่างกว้างขวางว่าเป็นหนึ่งในสารต้านเชื้อแบคทีเรียตามธรรมชาติที่ดีที่สุดที่มีอยู่และสามารถใช้ในการรักษาโรคติดเชื้อแบคทีเรียหรือเชื้อราที่ผิวหนัง เมื่อใช้ในแชมพูน้ำมันทีทรีจะฆ่าหนังศีรษะและเส้นผมและอาจรักษารังแคและฆ่าปรสิตเช่นเหาหรือหิด เมื่อเติมลงในน้ำน้ำมันนี้สามารถเทลงในขวดสเปรย์และใช้เป็นยาฆ่าเชื้อในครัวเรือน การระคายเคืองผิวหนังเล็กน้อยถึงปานกลางอาจเกิดขึ้นเมื่อใช้น้ำมันทีทรีเต็มกำลังจึงแนะนำให้เจือจาง
มะนาวถูกเพิ่มเข้ากับผลิตภัณฑ์ทำความสะอาดเป็นเวลาหลายปีเนื่องจากฤทธิ์ต้านเชื้อแบคทีเรีย น้ำมะนาวสดยังสามารถใช้ฆ่าเชื้อโรคในมือและป้องกันการปนเปื้อนของแบคทีเรีย พร้อมกับอาหารเช่นวาซาบิและกระเทียมมะนาวสามารถเพิ่มเข้าไปในอาหารเพื่อทำความสะอาดเลือดของเชื้อโรคที่เป็นอันตราย
ไฮโดรเจนเปอร์ออกไซด์และน้ำส้มสายชูสามารถใช้คนเดียวหรือใช้ร่วมกับสารอื่น ๆ เพื่อสร้างผลิตภัณฑ์ต้านเชื้อแบคทีเรียตามธรรมชาติ เมื่อนำไปใช้กับการตัดหรือถลอกไฮโดรเจนเปอร์ออกไซด์ช่วยฆ่าเชื้อโรคที่ทำให้เกิดการติดเชื้อ ผลิตภัณฑ์นี้ยังสามารถใช้เป็นสารทำความสะอาดในครัวเรือนได้แม้ว่าอาจมีผลการฟอกสีบนผ้าหรือพรม น้ำส้มสายชูสามารถใช้ได้อย่างสมบูรณ์หรือเจือจางด้วยน้ำและใช้เป็นน้ำยาทำความสะอาดในครัวเรือนน้ำยาซักผ้าและน้ำยาทำความสะอาดหน้าต่าง ผู้ที่ชื่นชอบคุณสมบัติต้านเชื้อแบคทีเรียของน้ำส้มสายชู แต่ไม่ชอบกลิ่นอาจต้องการเพิ่มน้ำมันหอมระเหยสักสองสามหยด
