อาจใช้ยาอีซาฟารินในระหว่างตั้งครรภ์เพื่อลดความเสี่ยงของการอุดตันของเลือดในผู้หญิงที่มีแนวโน้มที่จะเป็นโรคนี้ ยานี้มักจะถือว่าปลอดภัยสำหรับใช้ในระหว่างตั้งครรภ์และเป็นที่ทราบกันดีว่าอาจป้องกันการแท้งบุตรที่เกิดจากเลือดอุดตันซึ่งเป็นสาเหตุที่อาจมีการกำหนดไว้ สำนักงานคณะกรรมการอาหารและยาแห่งสหรัฐอเมริกา (FDA) ได้จัดให้อยู่ในหมวดการตั้งครรภ์ B เนื่องจากการศึกษาในสัตว์ไม่แสดงผลกระทบใด ๆ ต่อทารกในครรภ์หรือแม่ แม้ว่าจะไม่ได้มีการศึกษาเกี่ยวกับมนุษย์อย่างเพียงพอ แต่ยานี้ไม่ได้ผ่านรกไปยังทารกดังนั้นการใช้ยาอกซีฟารินในการตั้งครรภ์ก็ถือว่าปลอดภัยสำหรับมนุษย์ ข้อยกเว้นหลัก ได้แก่ การบริหารให้กับผู้หญิงที่มีลิ้นหัวใจกลและการใช้ขวดหลายขนาดเนื่องจากทั้งสองรูปแบบได้ก่อให้เกิดปัญหาทางการแพทย์และแม้กระทั่งความตายในหญิงตั้งครรภ์บางคน
การตั้งครรภ์ประเภท B มักจะสงวนไว้สำหรับยาที่ได้รับการทดสอบกับสัตว์และไม่แสดงผลที่เป็นอันตรายหรือแสดงผลอันตรายในสัตว์ แต่ไม่ใช่มนุษย์ในระหว่างการศึกษา ในกรณีของ enoxaparin การศึกษาในสัตว์ไม่ได้แสดงถึงอันตรายที่เพิ่มขึ้นของการเกิดข้อบกพร่องแม้ว่ายาจะได้รับในปริมาณที่สูงผิดปกติ แม้ว่ายานี้ยังไม่ได้มีการศึกษากันอย่างแพร่หลายในมนุษย์ แต่นักวิจัยก็มีเหตุผลที่เชื่อได้ว่ามันไม่ได้เป็นอันตรายต่อทารกในครรภ์เพราะมันจะไม่ผ่านรก ด้วยเหตุนี้ยา enoxaparin ในการตั้งครรภ์อาจถูกกำหนดโดยแพทย์ที่เชื่อว่าประโยชน์ของการอุดตันในเลือดมีค่ามากกว่าความเสี่ยงเพียงเล็กน้อยของยา
การศึกษาบางอย่างแสดงให้เห็นว่าผู้หญิงบางคนไม่ควรได้รับยา enoxaparin ในการตั้งครรภ์ มีรายงานการตายของทารกในครรภ์และมารดาในสตรีที่มีลิ้นหัวใจเทียมที่ใช้ยานี้เพื่อหยุดการอุดตันน่าจะเป็นเพราะยานี้ไม่แข็งแรงพอ ผู้หญิงดังกล่าวอาจดีกว่าการทานเฮปารินซึ่งถือว่ามีประสิทธิภาพมากกว่าในการป้องกันการอุดตัน แต่ไม่ปลอดภัยเท่าที่ควรในระหว่างตั้งครรภ์ แพทย์ควรชั่งน้ำหนักข้อดีข้อเสียของยาแต่ละตัวก่อนสั่งยาเหล่านี้
อันตรายที่เป็นไปได้อีกประการหนึ่งของการใช้ยา enoxaparin ในการตั้งครรภ์นั้นใช้ได้กับขวดที่ใช้ยาหลายขนาดเท่านั้น นี่เป็นเพราะพวกเขามีเบนซิลแอลกอฮอล์สารกันบูดซึ่งเป็นที่รู้จักกันในการข้ามรกไปยังทารกในครรภ์ ผลที่ได้คือความเป็นไปได้ของปัญหาทางการแพทย์หลังคลอดของทารกที่มีอาการหอบเป็นหนึ่งในเงื่อนไขที่พบบ่อยที่สุด สิ่งนี้มีแนวโน้มที่จะเกิดขึ้นมากที่สุดในทารกที่คลอดก่อนกำหนดและอาจถึงแก่ชีวิตได้ เข็มฉีดยาขนาดครั้งเดียวของยานี้ไม่มีเบนซิลแอลกอฮอล์ดังนั้นผู้หญิงที่วางแผนที่จะใช้ยา enoxaparin ในการตั้งครรภ์ควรใช้ตัวเลือกนี้
