ยาปฏิชีวนะธรรมชาติเป็นกลุ่มของสารต่าง ๆ ที่มาจากธรรมชาติที่มีคุณสมบัติต่อต้านแบคทีเรีย พวกเขารวมถึงสารสกัดจากพืชและแร่ธาตุที่เกิดขึ้นตามธรรมชาติ ผู้ปฏิบัติงานการแพทย์ทางเลือกหลายคนและแพทย์บางคนพิจารณาทางเลือกธรรมชาติในการใช้ยาปฏิชีวนะที่สำคัญเนื่องจากการใช้ยาปฏิชีวนะธรรมชาติเป็นทางเลือกในการใช้ยาปฏิชีวนะทางเคมีแบบดั้งเดิมซึ่งอาจกระตุ้นให้เกิดการแพร่กระจายของแบคทีเรียที่ดื้อต่อยาปฏิชีวนะ
ยาปฏิชีวนะธรรมชาติที่รู้จักกันดีบางตัว ได้แก่ กระเทียมวิตามินซีซิลเวอร์คอลลอยด์และ Citricidal สารปฏิชีวนะธรรมชาติจากกระเทียมใช้มานานหลายปีแล้ว กระเทียมถูกใช้ในสงครามโลกครั้งที่หนึ่งเพื่อรักษาแผลเปิดและเป็นที่รู้จักในการป้องกันการติดเชื้อ หลายคนใช้เพื่อรักษาโรคติดเชื้อที่หูและคอเล็กน้อย กระเทียมมีคุณสมบัติคล้ายกับยาเพนิซิลินและสามารถฆ่าเชื้อแบคทีเรียที่ดื้อยาได้
วิตามินซีถูกใช้ในปริมาณสูงเป็นยาปฏิชีวนะตามธรรมชาติในการรักษาจำนวนชนิดของการติดเชื้อรวมถึง Acquired Immune Deficiency Syndrome (AIDS) มันยังถูกใช้ในการรักษาโรคโปลิโอโรคบาดทะยักไอกรนและโรคคอตีบ คุณสมบัติต้านแบคทีเรียของวิตามินซีอาจเป็นเพราะหน้าที่ในการผลิตเซลล์เม็ดเลือดขาวซึ่งโจมตีแบคทีเรียในเลือด
ซิลเวอร์คอลลอยด์เป็นวิธีการแก้ปัญหาของอนุภาคเงินที่ละเอียดมากกระจายตัวในของเหลว การใช้เงินโดยทั่วไปอยู่ในเครื่องกรองน้ำซึ่งมักจะชุบด้วยเงินเพื่อชะลอการเจริญเติบโตของแบคทีเรีย งานวิจัยบางชิ้นชี้ให้เห็นว่าคุณสมบัติต่อต้านแบคทีเรียของเงินเกิดจากความสามารถในการทำลายระบบเอนไซม์ของแบคทีเรียหลายชนิด
Citricidal เป็นยาปฏิชีวนะสมุนไพรธรรมชาติที่สกัดจากเมล็ดส้มโอ มันถูกระบุว่าเป็นยาปฏิชีวนะตามธรรมชาติครั้งแรกโดยดร. หลุยส์แพริชในปี 1976 ซึ่งพบว่ามันยับยั้งการเจริญเติบโตของแบคทีเรียไม่เพียง แต่ยังรวมถึงเชื้อราและเชื้อไวรัสอีกด้วย Citricidal บางครั้งใช้โดยค่ายเป็นสารเติมแต่งในการทำความสะอาดน้ำดื่ม แอปพลิเคชั่นอื่น ๆ ในการรักษาผื่นผ้าอ้อมในเด็กทารก
ในขณะที่มีหลักฐานพอสมควรมากและการวิจัยทางวิทยาศาสตร์บางอย่างเพื่อสนับสนุนการใช้และประสิทธิภาพของยาปฏิชีวนะธรรมชาติเป็นเขตของการศึกษาพื้นที่นี้มีแนวโน้มที่จะถูกทอดทิ้งเมื่อเทียบกับจำนวนของการวิจัยที่ดำเนินการเกี่ยวกับยาปฏิชีวนะยา โดยทั่วไปถือว่าเป็นเพราะสารธรรมชาติไม่สามารถจดสิทธิบัตรในลักษณะเดียวกับยาที่ผลิตขึ้นมา เนื่องจากศักยภาพในการทำกำไรของยาปฏิชีวนะธรรมชาติโดยทั่วไปจะน้อยกว่ายาปฏิชีวนะทางเภสัชกรรมจึงใช้เงินน้อยลงในการค้นคว้าผลของพวกเขา
