มีภาวะแทรกซ้อนหลายอย่างในการผ่าตัดนิ่วในถุงน้ำ ภาวะแทรกซ้อนเหล่านี้แบ่งออกเป็นสองประเภท: ภาวะแทรกซ้อนที่สามารถเกิดขึ้นได้ในการผ่าตัดและภาวะแทรกซ้อนใด ๆ โดยเฉพาะการผ่าตัดนิ่วในถุงน้ำดีและถุงน้ำดี ในกรณีส่วนใหญ่สามารถรักษาโรคแทรกซ้อนได้ การรักษาภาวะแทรกซ้อนจำเป็นต้องกลับเข้ารักษาในโรงพยาบาลและในกรณีส่วนใหญ่การผ่าตัดครั้งที่สอง การพยากรณ์โรคสำหรับการกู้คืนแม้หลังจากภาวะแทรกซ้อนยังคงเป็นบวกอย่างท่วมท้น
การผ่าตัดนิ่วในถุงน้ำดีหมายถึงการกำจัดนิ่วและการกำจัดนิ่วในถุงน้ำดีซึ่งเป็นอวัยวะที่เกิดนิ่ว ในฐานะที่คน ๆ หนึ่งสามารถมีชีวิตอยู่ได้โดยไม่มีถุงน้ำดีศัลยแพทย์ส่วนใหญ่ตัดสินใจที่จะเอามันออกไปแทนที่จะต้องเอานิ่วใหม่ออกมาในภายหลัง ภาวะแทรกซ้อนสามารถเกิดขึ้นได้กับการผ่าตัดทั้งสองอย่าง แต่เนื่องจากเป็นการผ่าตัดที่ซับซ้อนกว่าพวกเขาจึงมีแนวโน้มที่จะพัฒนามากขึ้นหลังจากการผ่าตัดเอาถุงน้ำดีออก แม้ว่าจะมีภาวะแทรกซ้อนการผ่าตัดนิ่วในถุงน้ำเฉพาะจำนวนมาก แต่ผู้ป่วยทุกรายที่เข้ารับการผ่าตัดก็มีความเสี่ยงเช่นเดียวกัน: การติดเชื้อ
การติดเชื้อหลังการผ่าตัดสามารถเกิดขึ้นได้หลังการผ่าตัดใด ๆ แนวโน้มดังกล่าวเพิ่มขึ้นในช่วงไม่กี่ปีที่ผ่านมาเนื่องจากเชื้อแบคทีเรียดื้อยาปฏิชีวนะเช่น MRSA ได้พัฒนาขึ้นภายในโรงพยาบาลทั่วโลก ส่วนหนึ่งของการวางแผนการผ่าตัดนิ่วในถุงน้ำควรรวมถึงการขอข้อมูลจากโรงพยาบาลท้องถิ่นเกี่ยวกับอัตราการติดเชื้อหลังการผ่าตัด แม้ว่าใครจะเลือกโรงพยาบาลที่สะอาดการป้องกันการติดเชื้อจะกลายเป็นความรับผิดชอบของผู้ป่วยหลังจากที่ถูกปล่อยออกมา ทำความสะอาดบริเวณที่ถูกต้องและทำตามกฎอื่นใดที่ศัลยแพทย์กำหนดไว้เป็นสิ่งจำเป็นในการป้องกันการติดเชื้อ
อาการที่เกิดจากการติดเชื้อที่โรงพยาบาลได้รับมักจะปรากฏขึ้นก่อนที่ผู้ป่วยจะออกจากโรงพยาบาล บริเวณที่เกิดแผลจะแดงและบวมและผู้ป่วยอาจมีไข้ แพทย์จะให้ยาปฏิชีวนะแก่ผู้ป่วยทันที แม้ว่าการติดเชื้อในโรงพยาบาลส่วนใหญ่สามารถรักษาได้ แต่ MRSA ดังกล่าวมีอัตราการตายประมาณ 10% หากผู้ป่วยเริ่มแสดงอาการของการติดเชื้อหลังจากกลับบ้านมันเป็นความรับผิดชอบของเขาหรือเธอในการแจ้งให้แพทย์ของเขาหรือเธอติดเชื้อทันที การรักษาที่เริ่มต้นโดยเร็วที่สุดเท่าที่เป็นไปได้จะเพิ่มโอกาสในการฟื้นตัวอย่างเต็มที่โดยไม่มีผลข้างเคียงยาวนาน
นอกจากการติดเชื้อแล้วภาวะแทรกซ้อนในการผ่าตัดนิ่วในถุงน้ำชนิดอื่นนั้นเป็นสิ่งที่เกิดขึ้นเนื่องจากลักษณะของการผ่าตัด การผ่าตัดนิ่วในถุงน้ำดีและการกำจัดถุงน้ำดีมีความเสี่ยงของการรั่วไหลของน้ำดีและการบาดเจ็บที่ท่อน้ำดี ภาวะแทรกซ้อนทั้งสองอย่างนี้ทำให้น้ำดีซึ่งปกติเก็บไว้ในถุงน้ำดีรั่วซึมในลำไส้เล็กหรือตับอ่อนทำให้เกิดอาการปวดอย่างรุนแรง ภาวะแทรกซ้อนการผ่าตัดนิ่วในถุงน้ำเหล่านี้เป็นเรื่องปกติและไม่มีการผ่าตัดรักษาที่ชัดเจนตัวเลือกการรักษาส่วนใหญ่มักจะทุเลา
จากภาวะแทรกซ้อนการผ่าตัดนิ่วในถุงน้ำการลื่นของคลิปเป็นสิ่งที่หายากที่สุด ในตอนท้ายของการผ่าตัดเอาถุงน้ำดีออกศัลยแพทย์จะวางคลิปไว้เหนือท่อน้ำดีเพื่อป้องกันการรั่วไหลของน้ำดี หากคลิปควรหลุดจากตำแหน่งน้ำดีเริ่มรั่วและทำให้เกิดอาการตามที่อธิบายไว้ข้างต้น การผ่าตัดครั้งที่สองจำเป็นต้องใส่คลิปกลับเข้าที่ ผู้ป่วยสามารถกลับมาใช้ชีวิตตามปกติได้โดยไม่ต้องเจ็บปวดหลังจากการฟื้นตัว
