ยาหยอดตามีหลายประเภทไม่มากเกินไปสำหรับเด็กที่ได้รับการพิจารณาว่าปลอดภัยจากชุมชนแพทย์ ผู้ปกครองควรตรวจสอบกับแพทย์ของเด็กหากติดเชื้อที่ตาหรือระคายเคืองเกิดขึ้น ผู้ให้บริการดูแลสุขภาพโดยทั่วไปกำหนดยาปฏิชีวนะในปริมาณที่จะกำจัดการติดเชื้อในขณะที่การผลิตจำนวนน้อยที่สุดของผลข้างเคียง แม้แต่ยาหยอดตาสำหรับเด็กก็ยังมีสูตรที่แข็งแรงเกินไปสำหรับทารกเล็ก ๆ กุมารแพทย์บางคนแนะนำให้ใช้น้ำนมแม่สักสองหยดกับดวงตาที่ระคายเคือง
ในไม่กี่ชั่วโมงหลังคลอดผู้เชี่ยวชาญด้านสุขภาพใช้ยาหยอดตาสำหรับเด็กเพื่อป้องกันการติดเชื้อใด ๆ ที่อาจเกิดขึ้นกับทารกในครรภ์ ซิลเวอร์ไนเตรทเป็นยาที่ถูกเลือกมานานหลายสิบปี แต่แพทย์เปลี่ยนไปเป็นอีรีโทรมัยซินเพราะมันมีผลกระทบที่น่ารำคาญน้อยกว่า บางครั้งทารกพัฒนาสิ่งที่ดูเหมือนจะติดเชื้อที่ตาเรียกว่าตาสีชมพูที่ทำให้เกิดผื่นแดงและการระบายน้ำดื้อ ผู้ปกครองควรปรึกษากับแพทย์ก่อนที่จะใส่สารใด ๆ เข้าไปในดวงตาของทารกเป็นยาจำนวนมากครอบงำทารกเล็ก ๆ ผู้ให้บริการด้านการดูแลสุขภาพอาจสั่งยา tobramycin หรือยาปฏิชีวนะอื่น ๆ ที่ถือว่าปลอดภัยสำหรับใช้กับเด็กทารก
จักษุแพทย์หลายคนเสนอการตรวจตาเด็กเพื่อประเมินว่าดวงตาของเด็กทำหน้าที่ร่วมกันและรองรับการเปลี่ยนแปลงของแสงหรือไม่ จักษุแพทย์อาจใช้ยาหยอดตาที่ขยายรูม่านตาทำให้แพทย์ตรวจตาข้างในเพื่อดูอาการตาพร่าหรือสายตาสั้น ผลกระทบของยาหยอดตามักจะรวมถึงการมองเห็นภาพซ้อนซึ่งใช้เวลานานถึง 90 นาทีหลังจากการตรวจ บางครั้งทารกพัฒนาต้อกระจกหรือต้อหิน แต่ไม่มียาหยอดตาที่ปลอดภัยสำหรับทารกที่รักษาอาการเหล่านี้และทารกอาจต้องได้รับการผ่าตัดแก้ไข
ยาหยอดตาแบบแพ้ยาทั่วไปมักใช้ในเด็กอายุหกขวบขึ้นไป หากทารกเกิดอาการระคายเคืองตาที่ดูเหมือนจะไม่เกี่ยวข้องกับการติดเชื้อในระบบทางเดินหายใจพ่อแม่ไม่ควรใช้ยาหยอดตาสำหรับทารกเว้นแต่แพทย์จะได้รับคำแนะนำ อาจใช้ยาหยอดตาแบบพิเศษสำหรับโรคภูมิแพ้หรือผู้ให้บริการด้านสุขภาพสามารถแนะนำวิธีการอื่น ๆ ของการระคายเคืองตา ไม่แนะนำให้ใช้ยาหยอดตาที่มีคอร์ติโซนหรืออนุพันธ์ของสเตียรอยด์เนื่องจากสูตรอาจทำให้กระดูกข้อต่อหรือเอ็นกล้ามเนื้ออ่อนแรงและความผิดปกติ
