แม้ว่าจะมีข้อเสียที่อาจเกิดขึ้นได้หลายคนและหลายคนรู้สึกไม่แน่ใจว่าการปฏิบัตินี้ถูกต้องหรือไม่ แต่ข้อดีของการโคลนนิ่งนั้นมีมากมาย การโคลนบางประเภทอาจใช้เพื่อสร้างแหล่งอาหารที่มีคุณค่าทางโภชนาการสูงขึ้นในขณะที่บางชนิดอาจใช้ในการสร้างยาหรือการรักษา ข้อดีอย่างหนึ่งที่รู้จักกันดีของการโคลนนิ่งคือการปลูกถ่ายอวัยวะซึ่งอาจช่วยชีวิตผู้ประสบอุบัติเหตุและผู้ที่รอการบริจาคอวัยวะ
ข้อได้เปรียบทางการแพทย์ของการโคลนอาจเริ่มต้นด้วยการบำรุงจริงของร่างกาย ไม่เพียง แต่โคลนวัวและไก่สามารถผลิตไข่และนมได้มากขึ้นเท่านั้น แต่นักวิทยาศาสตร์ยังสามารถเปลี่ยนคุณค่าทางโภชนาการของอาหารเหล่านี้ได้ ทารกที่ไม่สามารถให้นมบุตรอาจได้รับประโยชน์จากการโคลนนิ่งสัตว์บางประเภท ตัวอย่างเช่นวัวที่มีการจัดการรหัสพันธุกรรมอาจผลิตนมที่มีโปรตีนคล้ายกับที่พบในน้ำนมแม่
ภาวะเจริญพันธุ์เป็นอีกหนึ่งข้อได้เปรียบของการโคลน สำหรับผู้ที่เป็นหมันวิธีนี้อาจให้ความหวังในกรณีที่ตัวเลือกอื่นล้มเหลว หนึ่งในกระบวนการที่พบมากที่สุดของการโคลนการสืบพันธุ์เริ่มต้นโดยการฉีดสารพันธุกรรมของผู้ปกครองคนหนึ่งเข้าไปในไข่ เมื่อทำเสร็จแล้วไข่จะถูกกระตุ้นด้วยไฟฟ้าหรือสารเคมีจากนั้นวางลงในมดลูก แม้ว่ากระบวนการนี้จะประสบความสำเร็จในระดับหนึ่งในสัตว์ แต่จำเป็นต้องมีการวิจัยเพิ่มเติมเพื่อดูว่ามันจะใช้ได้กับมนุษย์หรือไม่
นอกจากคุณค่าทางโภชนาการและความอุดมสมบูรณ์แล้วข้อดีของการโคลนนิ่งก็ยังสามารถรักษาและรักษาปัญหาทางการแพทย์ได้หลายอย่าง การปลูกถ่ายอวัยวะเป็นวิธีการทางการแพทย์ที่ดีที่สุดสำหรับการโคลนนิ่ง บางครั้งอวัยวะที่ได้รับการปลูกถ่ายนั้นถูกเก็บเกี่ยวมาจากสัตว์ซึ่งผู้รับของมนุษย์ปฏิเสธอย่างสม่ำเสมอ อย่างไรก็ตามสัตว์ที่ลอกแบบมาอาจมียีนของมนุษย์ซึ่งอาจทำให้การปฏิเสธน้อยลง การโคลนอาจมีประโยชน์ในการทดแทนกระดูกกระดูกอ่อนและผิวหนังในผู้ที่ถูกไฟลวกและผู้ประสบอุบัติเหตุ
ข้อดีทางการแพทย์อื่น ๆ ของการโคลนประกอบด้วยการสร้างยาขั้นสูง ยาเหล่านี้อาจใช้ในการรักษาโรคหัวใจและไขกระดูกเพื่อควบคุมโรคเบาหวานและโรคไขข้ออักเสบและอาจช่วยรักษาโรคไตและโรคพาร์กินสัน นอกจากนี้การโคลนนิ่งอาจสามารถรักษามะเร็งบางชนิดได้โดยแทนที่ยีนที่กลายพันธุ์ด้วยยีนที่มีสุขภาพดีและปกติ กระบวนการนี้มักจะประกอบด้วยเซลล์ภูมิคุ้มกันจากร่างกายของผู้ป่วยทำซ้ำและวางกลับเข้าไปในระบบ
