การผ่าตัดหูรูดภายในเป็นลักษณะของการผ่าตัดที่ใช้ในการรักษาสภาพที่เรียกว่าร่องทวารเรื้อรัง รอยแยกทางทวารหนักเกิดขึ้นเมื่อผิวหนังซับน้ำตาทางทวารหนักทำให้เกิดอาการปวดอย่างรุนแรงและบางครั้งมีเลือดออกเมื่อผ่านอุจจาระ ในบางคนมีการป้องกันการรักษาเนื่องจากวาล์วหรือกล้ามเนื้อหูรูดที่ช่องเปิดทวารหนักเข้าสู่กล้ามเนื้อกระตุกลดปริมาณเลือดไปยังบริเวณที่เสียหาย เมื่อการรักษาที่ไม่ผ่าตัดล้มเหลวอาจแนะนำให้ใช้กล้ามเนื้อหูรูดด้านข้าง ในระหว่างขั้นตอนกล้ามเนื้อหูรูดจะถูกตัดเพื่อบรรเทาอาการกระตุกและช่วยให้การรักษาเกิดขึ้น
รอยแยกทางทวารหนักสามารถทำให้เกิดอาการปวดมากมักทำให้เกิดอาการท้องผูกในขณะที่ผู้ป่วยลังเลที่จะผ่านอุจจาระ โดยทั่วไปแล้วจะเห็นเลือดไหลลงบนกระดาษชำระหลังจากการเคลื่อนไหวของลำไส้และเลือดเป็นสีแดงสด รอยแยกทางทวารหนักจำนวนมากคิดว่าเกิดจากการผ่านอุจจาระแข็งและมักจะรักษาด้วยตนเอง ในคนที่ไม่มีการรักษาเกิดขึ้นก็คิดว่าอาจจะมีความผิดปกติของกล้ามเนื้อหูรูดทวารหนักภายในซึ่งจะช่วยลดปริมาณเลือดที่ไหลไปยังบริเวณรอยแยก ความดันกล้ามเนื้อหูรูดมักจะสูงเกินไปและกล้ามเนื้อหูรูดภายในด้านข้างสามารถลดแรงกดดันให้อยู่ในระดับปกติได้
สำหรับผู้ป่วยส่วนใหญ่การรักษารอยแยกทางทวารหนักทางการแพทย์ก็ประสบความสำเร็จโดยการใช้มาตรการเช่นน้ำยาปรับอุจจาระและอาหารที่มีเส้นใยสูง มันคือเมื่อการรักษาดังกล่าวล้มเหลวที่ผู้ป่วยอาจได้รับขั้นตอนด้านกล้ามเนื้อหูรูดภายใน การผ่าตัดสามารถทำได้ภายใต้ยาชาทั่วไปดังนั้นผู้ป่วยจึงหมดสติหรือเป็นยาชาที่กระดูกสันหลัง
ศัลยแพทย์ใช้มีดผ่าตัดเพื่อทำการตัดในกล้ามเนื้อหูรูดทวารหนักแบบวงกลมภายใน มันเป็นสิ่งสำคัญที่จะไม่ทำลายกล้ามเนื้อหูรูดทวารหนักภายนอกที่ล้อมรอบมัน การผ่าตัดใช้เวลาประมาณ 15 นาทีและผู้ป่วยสามารถกลับบ้านได้ในวันเดียวกัน คนส่วนใหญ่ทำการกู้คืนเต็มและพบว่าความเจ็บปวดรอยแยกทางทวารหนักของพวกเขาดีขึ้นอย่างรวดเร็ว
ภาวะแทรกซ้อนกล้ามเนื้อหูรูดภายในด้านข้างนั้นหายาก แต่อาจรวมถึงการติดเชื้อความเจ็บปวดและเลือดออก บางครั้งผู้ป่วยจะมีระดับความมักมากในกามซึ่งอาจเกี่ยวข้องกับการผ่านอุจจาระร่วมกับก๊าซหรือสกปรกเล็กน้อยโดยไม่สมัครใจ บ่อยครั้งปัญหาเหล่านี้จะปรากฏขึ้นทันทีหลังการผ่าตัด แต่จะแก้ไขในภายหลัง ในผู้ป่วยไม่กี่คนรอยแยกทางทวารหนักไม่ได้รักษาตาม sphincterotomy ด้านข้างภายในหรือรอยแยกเกิดขึ้นอีก ประมาณครึ่งหนึ่งของกรณีที่รอยแยกล้มเหลวในการรักษามีความสัมพันธ์กับสภาพการอักเสบของลำไส้ที่เรียกว่าโรคของ Crohn
