มีวิธีการรักษาที่เป็นไปได้หลายอย่างสำหรับถุงใส่เข่าโดยการบำบัดที่เลือกขึ้นอยู่กับประเภทของถุงที่เกี่ยวข้อง ถุงเป็นถุงหรือกระเป๋าซึ่งอาจเต็มไปด้วยของเหลวหรือสารหนา ซีสต์เข่าที่เกิดจากเงื่อนไขเช่นการบาดเจ็บ, โรคไขข้ออักเสบหรือโรคเกาต์อาจได้รับการรักษาด้วยยาและซีสต์ที่ติดเชื้อมักตอบสนองต่อยาปฏิชีวนะ มันเป็นสิ่งสำคัญในการรักษาสาเหตุใด ๆ หรือถุงอาจมีแนวโน้มที่จะเกิดขึ้นอีก ถุงเข่าที่ทำให้เกิดอาการและไม่สามารถรักษาด้วยยาอาจต้องผ่าตัด
ซีสต์ส่วนใหญ่ที่เกิดขึ้นที่หัวเข่าพัฒนาจากสิ่งที่รู้จักกันในชื่อเบอร์ซา Bursae เป็นถุงที่ตั้งอยู่ในส่วนของข้อต่อที่เกิดการเสียดสี หากการใช้ข้อต่อมากเกินไปทำให้เกิดการบาดเจ็บ Bursae เหล่านี้อาจเติมด้วยของเหลวทำให้เกิดซีสต์
การรักษาถุงใต้เข่าชนิดนี้มักจะใช้ทางการแพทย์โดยมีการพักรวมผ้าพันแผลบีบอัดและสิ่งที่เรียกว่ายาต้านการอักเสบที่ไม่ใช่สเตียรอยด์ (NSAIDs) ในกรณีที่โรคที่มีอยู่เช่นโรคเกาต์ทำให้ Bursa พัฒนาเป็นถุงเข่าการรักษาด้วยยาจะมุ่งเน้นไปที่อาการที่อยู่ข้างใต้ หากถุงน้ำติดเชื้อการรักษาด้วยยาปฏิชีวนะอาจไม่ได้ผลเต็มที่จนกว่าถุงจะหมดโดยใช้การสำลักด้วยเข็มซึ่งมีการใช้หลอดฉีดยาเพื่อดึงเนื้อหาของถุง
หนึ่งในประเภทที่พบบ่อยที่สุดของถุงเข่าเรียกว่าถุง popliteal หรือถุงของ Baker ซึ่งพัฒนาจาก Bursa ที่ด้านหลังของข้อเข่า โดยปกติถุงน้ำของ Baker เกิดขึ้นเมื่อโครงสร้างภายในข้อเข่าได้รับบาดเจ็บ แต่ก็สามารถเกิดขึ้นได้ในผู้ป่วยที่มีโรคต่าง ๆ เช่นโรคข้อเข่าเสื่อมและโรคไขข้ออักเสบ อาจมีอาการปวดและของเหลวบริเวณข้อต่อหัวเข่า การรักษาถุงใต้เข่าชนิดนี้อาจดำเนินการที่บ้านโดยใช้การรวมกันของ NSAIDs ส่วนที่เหลือน้ำแข็งและผ้าพันแผลบีบอัด หากอาการยังคงอยู่แพทย์อาจฉีดยาเสพติดคอร์ติโคสเตอรอยด์ลงบนหัวเข่าเพื่อบรรเทาอาการบวมและปวด
ในขณะที่ถุงของ Baker ไม่ได้ถูกเอาออกโดยการผ่าตัด แต่การผ่าตัดอาจต้องซ่อมแซมความเสียหายที่ข้อเข่าซึ่งอาจทำให้ถุงน้ำเกิดขึ้น อุปกรณ์ที่บางและยาวที่เรียกว่าอาร์โธสโคปซึ่งสามารถถ่ายรูปภายในข้อต่อได้ถูกเสียบเข้าที่หัวเข่า สิ่งนี้ทำให้ศัลยแพทย์สามารถค้นพบสิ่งก่อสร้างที่ได้รับบาดเจ็บและซ่อมแซมโดยใช้เครื่องมือที่เกี่ยวข้องกับ arthroscope โดยทั่วไปแล้วถุงซิสต์ที่ไม่ได้พัฒนาจากเบอร์ซาและมีอาการที่ไม่บรรเทาด้วยวิธีอื่นมักจะต้องผ่าตัดเอาออก


