หนึ่งในวัคซีนที่เร็วที่สุดที่แพทย์แนะนำสำหรับทารกคือหนึ่งในไวรัสโรตาไวรัส โรต้าไวรัสเป็นสาเหตุที่พบบ่อยที่สุดของการท้องเสียอย่างรุนแรงในทารกและเด็กและเด็กเกือบทั้งหมดจะติดเชื้อเมื่ออายุห้าขวบ ความไม่สมดุลของการขาดน้ำและอิเล็กโทรไลต์ที่เกิดจากเชื้อไวรัสโรต้าไวรัสอาจเป็นปัญหาได้มากที่สุดในเด็กอายุน้อยและขอแนะนำให้วัคซีนโรตาไวรัสให้เริ่มตั้งแต่อายุหกถึงสิบสองสัปดาห์ ให้ยาอีกสองครั้งในช่วงเวลาประมาณแปดสัปดาห์ ไม่ควรให้วัคซีนโรตาไวรัสก่อนอายุหกสัปดาห์หรือหลังอายุ 32 สัปดาห์
ศูนย์ควบคุมโรค (CDC) ระบุว่าโรตาไวรัสทำให้เกิดการเสียชีวิต 20 ถึง 60 ต่อปีในสหรัฐอเมริกาและ 500,000 รายทั่วโลก ความแตกต่างที่น่าตกใจในการเสียชีวิตส่วนใหญ่เกิดจากสภาพสกปรกการขาดการดูแลทางการแพทย์และทรัพยากรที่มีอยู่น้อย ๆ สำหรับการรักษาภาวะขาดน้ำในประเทศด้อยพัฒนา
ไม่ทราบระยะเวลาของการให้วัคซีนโดยไวรัสโรตาไวรัส เชื่อกันว่าจะคงอยู่อย่างต่อเนื่องเป็นเวลาอย่างน้อยสองฤดูกาลไวรัสไวรัสส่วนใหญ่จะทำสัญญาในช่วงอากาศหนาว - แม้ว่าผู้เชี่ยวชาญจะทราบว่าประสิทธิภาพของวัคซีนจะลดลงในช่วงฤดูที่สองมากกว่าในช่วงแรก หลังจากได้รับยาทั้งสามขนาดประสิทธิภาพของวัคซีนโรตาไวรัสจะอยู่ที่ 74% ต่อการติดเชื้อไวรัสโรตาไวรัสและ 98% ต่อการติดเชื้อรุนแรง
วัคซีนโรต้าไวรัสตัวแรก Rotashield ได้รับใบอนุญาตในเดือนสิงหาคม 2541 แต่ถูกถอนออกในปีหน้าเนื่องจากความสัมพันธ์ระหว่างวัคซีนกับภาวะลำไส้กลืนกันหรือการอุดตันของลำไส้ในทารกที่ได้รับวัคซีน RotaTeq ได้รับใบอนุญาตในปี 2549 และแม้ว่ารายงานของภาวะลำไส้กลืนกันไม่เกินจำนวนที่คาดไว้ของ CDC วัคซีนโรตาไวรัสนี้จะมีป้ายกำกับพร้อมเตือนให้ระวังสัญญาณลำไส้อุดตัน ไม่มีข้อมูลความปลอดภัยสำหรับวัคซีนนี้สำหรับทารกที่มีระบบภูมิคุ้มกันอ่อนแอหรือมีประวัติผิดปกติของระบบทางเดินอาหาร
ผลข้างเคียงที่พบบ่อยมากขึ้นของวัคซีนโรตาไวรัสรวมถึงอาการท้องร่วงและอาเจียนซึ่งส่งผลต่อทารกที่ได้รับวัคซีนมากถึง 24% ไวรัสดังกล่าวยังพบว่ามีการหลั่งอุจจาระของเด็กทารกและเด็กที่ได้รับการฉีดวัคซีนมากถึง 8.9% และอาจต้องหลั่งต่อไปอีกถึงสิบห้าวัน เนื่องจากโรตาไวรัสเข้าสู่ร่างกายผ่านทางปากและแพร่กระจายผ่านการสัมผัสทางปาก - ปากผู้ดูแลจึงควรขยันโดยเฉพาะอย่างยิ่งเกี่ยวกับการล้างมือเมื่อดูแลเด็กที่ได้รับวัคซีนโรตาไวรัสเพื่อป้องกันการแพร่กระจายของไวรัสโรตาไวรัสไปสู่ผู้อื่น
เป็นที่ถกเถียงกันอยู่ว่าวัคซีนโรตาไวรัสมักจะให้ผลที่ดีในการป้องกันทารก ในความเป็นจริงทารกที่อายุน้อยกว่าสามเดือนแทบจะไม่ติดเชื้อโรตาไวรัสเนื่องจากแอนติบอดีของมารดาที่แฝงอยู่และถ้ามีก็จะใช้แอนติบอดีที่ได้รับจากน้ำนมแม่ ทารกเหล่านี้จะยังคงสัมผัสกับไวรัสโรตาไวรัสที่ยังมีชีวิตอยู่ในช่วงเวลาที่มีภูมิคุ้มกันตามธรรมชาติหากได้รับวัคซีนตามตารางเวลา นอกจากนี้เด็กอาจจะติดเชื้อไวรัสโรตาไวรัสในเวลาต่อมาเมื่อประสิทธิภาพของวัคซีนลดลง หลังจากการติดเชื้อไวรัสโรตาไวรัสครั้งแรกเด็ก ๆ ร้อยละ 88 กลายเป็นภูมิคุ้มกันต่ออาการรุนแรงและภูมิคุ้มกันจะเพิ่มความเข้มแข็งเฉพาะการติดเชื้อครั้งต่อไป
ข้อกังวลอื่น ๆ อาจเกิดขึ้นจากคำแถลงของผู้ผลิตแผนกวัคซีนของเมอร์คว่า“ RotaTeq ยังไม่ได้รับการประเมินสำหรับศักยภาพในการก่อมะเร็งหรือการก่อกลายพันธุ์หรือศักยภาพในการลดความอุดมสมบูรณ์” เมอร์คยังกล่าวด้วยว่า ได้รับการยอมรับแล้ว” อีกนัยหนึ่งก็คือพวกเขาไม่ได้พิสูจน์ความสัมพันธ์ระหว่างวัคซีนและภูมิคุ้มกันกับไวรัส
โรตาไวรัสได้รับการรักษาด้วยการพักผ่อนของเหลวและอาหารที่อ่อนโยนจนกว่าเด็กจะหยุดอาเจียน ในกรณีที่รุนแรงอาจจำเป็นต้องใช้ IV เพื่อช่วยป้องกันการขาดน้ำ เนื่องจากไวรัสนี้เป็นอันตรายถึงชีวิตในประเทศพัฒนาแล้วและสามารถป้องกันได้ด้วยการล้างมืออย่างเหมาะสมผู้ปกครองและผู้ดูแลอาจหยุดการพิจารณาความเสี่ยงเมื่อเทียบกับประโยชน์ของวัคซีนโรตาไวรัสก่อนที่จะยินยอม เช่นเดียวกับวัคซีนใด ๆ ความเสี่ยงของการเกิดอาการไม่พึงประสงค์อาจลดลงได้โดยเลือกที่จะให้ยาแยกต่างหากจากวัคซีนอื่น ๆ
