เพื่อความเรียบง่ายระบบสืบพันธุ์เพศชายสามารถแบ่งออกเป็นส่วนภายในและภายนอก ภายนอกระบบประกอบด้วยอวัยวะเพศชายและถุงอัณฑะ ภายในถุงอัณฑะมีลูกอัณฑะ, หลอดน้ำอสุจิและรถตู้ ส่วนอื่น ๆ ภายในของระบบสืบพันธุ์เพศชายรวมถึงต่อมลูกหมาก, ต่อม bulbourethral และท่อปัสสาวะ
อวัยวะเพศชายเป็นส่วนที่รู้จักมากที่สุดของระบบสืบพันธุ์เพศชายและมีสองส่วนหลัก ลึงค์หรือหัวของอวัยวะเพศชายเป็นส่วนหนึ่งที่เชื่อกันว่ามีส่วนสำคัญต่อความสุขของประสบการณ์ทางเพศและมันมีเนื้อสัตว์ในทางเดินปัสสาวะซึ่งเป็นช่องเปิดที่ช่วยให้ปัสสาวะและน้ำอสุจิหนีออกจากร่างกาย ส่วนที่สองของอวัยวะเพศชายคือเพลาซึ่งเป็นส่วนที่ทรงกระบอกของอวัยวะเพศชายที่แข็งและยาวในระหว่างการเร้าอารมณ์ทางเพศ
ด้านล่างของอวัยวะเพศชายมีโครงสร้างคล้ายถุงที่เรียกว่าถุงอัณฑะ มันมีสองส่วนรูปไข่ที่รู้จักกันเป็นลูกอัณฑะซึ่งมีหน้าที่ในการผลิตและการเก็บรักษาของสเปิร์มและการผลิตของฮอร์โมนเพศชาย ถุงอัณฑะยังเป็นที่อยู่ของท่อน้ำอสุจิและรถตู้ deferens ซึ่งทำหน้าที่เป็นเครือข่ายท่อสำหรับระบบสืบพันธุ์เพศชาย หน้าที่สำคัญอีกอย่างหนึ่งของถุงอัณฑะคือการช่วยควบคุมอุณหภูมิของลูกอัณฑะด้วยการขยายและหดตัวโดยการให้ความร้อนในร่างกายมากหรือน้อย
ถุงน้ำเชื้อตั้งอยู่ใกล้กับฐานของกระเพาะปัสสาวะ สิ่งก่อสร้างที่มีรูปร่างคล้ายถุงเล็ก ๆ เหล่านี้เชื่อมต่อกับรถตู้ น้ำเชื้อส่วนใหญ่ผลิตโดยโครงสร้างเหล่านี้ การมีส่วนร่วมของฟรักโทสที่อุดมไปด้วยจึงให้เชื้อเพลิงสเปิร์มที่จะต้องมีมือถือ
ต่อมลูกหมากเป็นส่วนหนึ่งของระบบสืบพันธุ์เพศชาย มันตั้งอยู่ใต้กระเพาะปัสสาวะและมีบทบาทในการผลิตน้ำอสุจิโดยมีส่วนร่วมในของเหลวที่ช่วยบำรุงอสุจิ ท่อปัสสาวะเป็นทางเดินที่อุ้มปัสสาวะจากกระเพาะปัสสาวะไปยังกระเพาะปัสสาวะของสัตว์ ทางเดินนี้ซึ่งเดินทางผ่านต่อมลูกหมากยังมีน้ำอสุจิ ท่อปัสสาวะมีโครงสร้างเพื่อไม่อนุญาตให้มีการผสมหรือการขนส่งน้ำอสุจิและปัสสาวะพร้อมกัน
ที่ด้านข้างของท่อปัสสาวะเป็นต่อมกระเปาะวงแหวนซึ่งบางครั้งเรียกว่าต่อมของ Cowper โครงสร้างเหล่านี้ผลิตของเหลวใสที่มักจะหลั่งจากอวัยวะเพศชายในช่วงเวลาที่ผู้ชายถูกกระตุ้นทางเพศ แต่ก่อนที่จะพุ่งออกมา ความจริงที่ว่ามีการผลิตของเหลวก่อนที่จะพุ่งออกมาอย่างมีนัยสำคัญเพราะเชื่อว่าหนึ่งในวัตถุประสงค์ของมันคือการทำหน้าที่เป็นสารหล่อลื่น ขณะที่ท่อระบายน้ำเข้าไปในท่อปัสสาวะก็เชื่อว่าจะแก้ความเป็นกรดที่อาจเกิดจากปัสสาวะ
