ขณะที่อาหารดำเนินไปทั่วร่างกายมันจะเคลื่อนผ่านกล้ามเนื้อหูรูดที่แตกต่างกันในระบบย่อยอาหาร โดยรวมแล้วมีกล้ามเนื้อหูรูดหกตัวในระบบย่อยอาหารซึ่งมีบทบาททั่วไปในการควบคุมทิศทางและการเคลื่อนไหวของวัสดุ เช่นเดียวกับกล้ามเนื้อหูรูดทั้งหกที่แตกต่างกันนอกจากนี้ยังมีกล้ามเนื้อหูรูดที่เรียงแถวทั้งหลอดอาหารและลำไส้เพื่อช่วยผลักดันวัสดุ
ในมนุษย์ระบบย่อยอาหารเริ่มต้นที่ปากและสิ้นสุดที่ทวารหนักซึ่งมีการปล่อยของเสียออกจากร่างกาย กล้ามเนื้อหูรูดหกชนิดที่แตกต่างกันในระบบย่อยอาหารคือกล้ามเนื้อหูรูดของหลอดอาหารส่วนบน (UES), กล้ามเนื้อหูรูดของหัวใจ, กล้ามเนื้อหูรูด pyloric, กล้ามเนื้อหูรูดของ ileocecal และกล้ามเนื้อหูรูดทวารหนักโดยสมัครใจและอาสาสมัคร นักวิทยาศาสตร์บางคนรู้สึกว่ากล้ามเนื้อหูรูดของหัวใจไม่ใช่วาล์วกล้ามเนื้อหูรูดที่แท้จริงดังนั้นจึงอาจไม่รวมไว้ในรายการของกล้ามเนื้อหูรูดที่แตกต่างกันในระบบย่อยอาหาร
การย่อยจะเริ่มขึ้นในปากโดยมีการเพิ่มเอ็นไซม์ย่อยอาหารลงในอาหารขณะที่เคี้ยว จากปากอาหารจะเคลื่อนเข้าสู่หลอดอาหารเพื่อลำเลียงลงสู่กระเพาะอาหาร อาหารถูกผลักผ่าน UES ระหว่างการกลืน กล้ามเนื้อหูรูดนี้ช่วยให้อาหารผ่านและป้องกันไม่ให้อากาศเข้าสู่หลอดอาหารในเวลาเดียวกัน
กล้ามเนื้อหูรูดของหัวใจก็จะเรียกว่ากล้ามเนื้อหูรูดหลอดอาหารส่วนล่าง (LES) และพบที่ฐานของหลอดอาหารที่ตรงกับกระเพาะอาหาร บทบาทของกล้ามเนื้อหูรูดของหัวใจคือการหยุดการไหลของวัสดุกลับสู่หลอดอาหาร เนื้อหาในกระเพาะอาหารมีความเป็นกรดสูงและสามารถทำให้หลอดอาหารไหม้ซึ่งเป็นสาเหตุของอาการอิจฉาริษยา
ภายในกระเพาะอาหารจะถูกปั่นและผสมกับน้ำย่อยในรูปแบบเพื่อผสมครีม ส่วนผสมนี้เรียกว่า chyme และมันย้ายจากกระเพาะอาหารไปยังลำไส้เล็กผ่านทางกล้ามเนื้อหูรูด pyloric กล้ามเนื้อหูรูดนี้ป้องกันการไหลกลับของ chyme จากลำไส้เล็กส่วนต้นเข้าไปในกระเพาะอาหาร นอกจากนี้ยังควบคุมอัตราการปล่อย chyme เพื่อให้มีการไหลเวียนของอาหารอย่างต่อเนื่องในลำไส้เล็กเป็นเวลาหลายชั่วโมงหลังรับประทานอาหาร สิ่งนี้ทำให้เกิดการย่อยได้สูงสุด
การย่อยและการดูดซึมสารอาหารเกิดขึ้นภายในลำไส้เล็ก จากนั้นสิ่งที่เหลืออยู่ของ chyme จะส่งผ่านกล้ามเนื้อหูรูดของ ileocecal เข้าไปในลำไส้ใหญ่ นี่คือที่น้ำถูกดูดซึมกลับเข้าไปในร่างกายเมื่อ chyme เคลื่อนที่ผ่านมันไปยังไส้ตรง กล้ามเนื้อหูรูดทวารหนักโดยไม่สมัครใจผลิตกระตุ้นให้ถ่ายอุจจาระในขณะที่กล้ามเนื้อหูรูดทวารหนักโดยสมัครใจมีความรับผิดชอบในการถ่ายอุจจาระและขับไล่อุจจาระที่ยังคงอยู่หลังจากการย่อยและการดูดซึมที่เกิดขึ้น


