ผลกระทบพื้นฐานของอะไมเลสต่อการย่อยอาหารคือการสลายพันธะในแป้งลงในไดแซ็กคาไรด์มอลโตสที่มีขนาดเล็กลงซึ่งจะถูกย่อยสลายต่อไปในลำไส้เล็กสู่กลูโคสที่ร่างกายสามารถดูดซึมได้ หากปราศจากอะไมเลสคาร์โบไฮเดรตส่วนใหญ่ที่คนบริโภคจะไม่ได้รับการประมวลผลและปริมาณพลังงานที่ผู้คนจะได้รับจะถูก จำกัด อย่างมาก สิ่งนี้ทำให้อะไมเลสเป็นหนึ่งในเอนไซม์ย่อยอาหารที่สำคัญที่สุด
เพื่อให้เข้าใจถึงบทบาทของอะไมเลสต่อการย่อยอาหารจำเป็นต้องเข้าใจก่อนว่าแป้งเป็นโพลิเมอร์กลูโคสที่ใหญ่เกินกว่าที่ร่างกายจะดูดซึมได้อย่างง่ายดาย ในการใช้งานแป้งซึ่งเป็นคาร์โบไฮเดรตจะต้องถูกแบ่งย่อยออกเป็นส่วนย่อย ๆ นั่นคือน้ำตาลที่ง่ายกว่า อะไมเลสทำสิ่งนี้ในสองส่วนของร่างกาย
ผลของอะไมเลสต่อการย่อยจะเริ่มขึ้นทันทีในปาก เมื่อคนเคี้ยวอาหารต่อมน้ำลายของเขาจะปลดปล่อยอะไมเลส อะไมเลสผสมกันทั่วทั้งอาหารโดยฟันและลิ้นอะไมเลสเริ่มทำลายแป้งลงในไดแซ็กคาไรด์มอลโตสซึ่งเป็นโมเลกุลกลูโคสสองโมเลกุลติดกัน ทุกอย่างที่บรรจุอยู่ในอาหารที่ถูกกัดรวมทั้งมอลโตสและอะไมเลสจะเดินทางลงหลอดอาหารไปที่กระเพาะอาหาร
ศักยภาพของระดับไฮโดรเจน (pH) ในกระเพาะอาหารนั้นมีความเป็นกรดมากเกินกว่าที่จะทำให้อะไมเลสสลายพันธะในแป้งที่ยังคงต้องสลายตัวต่อไป ณ จุดนี้บทบาทของอะไมเลสในคอกย่อย กรดในกระเพาะอาหารจะทำงานควบคู่กับเอ็นไซม์เช่นอะไมเลสเพื่อดำเนินการกระบวนการย่อยอาหารทำให้อาหารเป็นของเหลวที่สามารถผ่านเข้าไปในลำไส้เล็กได้ง่าย
คนส่วนใหญ่ที่กินแป้งไม่ได้ถูกย่อยสลายอย่างสมบูรณ์โดยอะไมเลสน้ำลายหรือกรดในกระเพาะอาหาร - อาหารไม่ได้อยู่ในปากนานพอที่พันธะทั้งหมดจะแตกตัวและกรดในกระเพาะอาหารจะดีกว่าในการกำหนดเป้าหมายโปรตีนแทนที่จะเป็นคาร์โบไฮเดรต ต่อจากนั้นตับอ่อนก็หลั่งอะไมเลสซึ่งเดินทางไปยังลำไส้เล็ก อะไมเลสในตับอ่อนมีเป้าหมายที่แป้งที่เหลืออยู่ทำให้เกิดมอลโตสมากขึ้น
เมื่ออะไมเลสในตับอ่อนสลายแป้งลงได้มากที่สุดเท่าที่จะสามารถเป็นมอลโตสได้ผลของอะไมเลสต่อการย่อยจะสมบูรณ์ มอลโตสยังคงไม่ถูกดูดซึมได้ง่ายอย่างไรก็ตามเอนไซม์อื่นที่ผลิตในลำไส้เล็กมอลเตสเสร็จสิ้นการสลายตัวของพันธะในไดแซ็กคาไรด์ ผลที่ได้คือกลูโคสซึ่ง villi ในลำไส้เล็กสามารถดูดซึมได้ ร่างกายใช้กลูโคสเป็นแหล่งพลังงานหลัก
