ฐานดอกและฐานเป็นทั้งชื่อของโครงสร้างในสมอง ในขณะที่ hypothalamus เป็นรูปทรงกรวยฐานดอกประกอบด้วยสองกลีบเชื่อมต่อหนึ่งอันอยู่ในแต่ละซีกโลก มลรัฐจะควบคุมกระบวนการเผาผลาญอาหารที่สำคัญของร่างกายซึ่งมีผลต่ออุณหภูมิความดันโลหิตความหิวกระหายและการนอนหลับ มันควบคุมระบบต่อมไร้ท่อโดยส่งผลกระทบต่อการผลิตฮอร์โมนของต่อมใต้สมอง ฐานดอกใช้ข้อมูลจากส่วนต่าง ๆ ของสมองและถ่ายทอดไปยังสมองส่วนนอกชั้นนอกของวัตถุสีเทาซึ่งมีการทำงานของสมองในระดับที่สูงขึ้น
ในทั้งโครงสร้างและการทำงานฐานดอกและฐานดอกมีความแตกต่างกันมาก แต่ชื่อนั้นดูคล้ายกันอย่างสับสน ชื่อมีความคล้ายคลึงกันเพราะ hypo หมายถึงภายใต้และ hypothalamus ได้รับการตั้งชื่อตามตำแหน่งซึ่งอยู่ต่ำกว่าฐานดอก ฐานดอกทั้งสองและส่วนฐานเป็นส่วนหนึ่งของพื้นที่ของสมองที่เรียกว่า diencephalon
ฟังก์ชั่นของมลรัฐในการรักษาสภาพปกติของร่างกายเป็นที่รู้จักกันในนามสภาวะสมดุล น้ำหนักของบุคคลอุณหภูมิความดันโลหิตและความสมดุลของของเหลวถูกควบคุมโดยเป็นส่วนหนึ่งของกระบวนการนี้ hypothalamus ได้รับข้อมูลเกี่ยวกับส่วนต่าง ๆ ของร่างกายผ่านระบบประสาททำให้สามารถกระตุ้นการเปลี่ยนแปลงที่ทำให้ระบบกลับสู่สมดุล
ข้อมูลเกี่ยวกับปัจจัยต่าง ๆ เช่นความดันโลหิตอุณหภูมิของผิวหนังความสมบูรณ์ของลำไส้และความเข้มข้นของสารต่าง ๆ ในเลือดที่ได้รับจากมลรัฐซึ่งอาจกระตุ้นระบบประสาทอัตโนมัติหรือระบบต่อมไร้ท่อ ผ่านระบบประสาทอัตโนมัติการตอบสนองที่เกี่ยวข้องกับการทำงานหนักอัตราการเต้นของหัวใจการย่อยอาหารและการตีบของหลอดเลือดสามารถนำมาใช้เพื่อเปลี่ยนสถานะของร่างกาย hypothalamus ควบคุมระบบต่อมไร้ท่อผ่านต่อมใต้สมองกระตุ้นให้สร้างฮอร์โมนที่ส่งผลต่อมต่างๆเช่นต่อมไทรอยด์และต่อมหมวกไต สิ่งนี้ช่วยให้มันเปลี่ยนแปลงเมแทบอลิซึมความดันโลหิตและการปล่อยอะดรีนาลีน
ทั้งประสาทสัมผัสซึ่งหมายถึงจากประสาทสัมผัสและมอเตอร์หรือการเคลื่อนไหวข้อมูลจะถูกส่งผ่านโดยฐานดอกไปยังเยื่อหุ้มสมอง ความรู้สึกเช่นความเจ็บปวดข้อมูลจากอุทรและอารมณ์ล้วนส่งผ่านฐานดอก ข้อมูลเกี่ยวกับความรู้สึกของกลิ่นแตกต่างจากความรู้สึกอื่น ๆ เพราะมันถึงฐานดอกหลังจากที่เยื่อหุ้มสมองได้รับ วงจร Circadian เช่นวงจรการตื่นจากการนอนหลับได้รับการควบคุมโดยฐานดอก ในฐานะที่เป็นไฮโปทาลามัสยังเกี่ยวข้องกับวงจรการนอนหลับนี้เป็นหนึ่งในพื้นที่ที่มีข้อมูลจากทั้งฐานดอกและฐานดอกมีส่วนเกี่ยวข้อง
