ระบบย่อยอาหารเกี่ยวข้องกับอวัยวะต่างๆที่ทำงานร่วมกันในกระบวนการสลายอาหารให้เป็นโมเลกุลที่ร่างกายใช้หรือกำจัดทิ้ง เส้นทางของระบบย่อยอาหารเริ่มต้นที่ปากที่ใส่อาหารและสิ้นสุดที่ทวารหนักซึ่งมีของเสียถูกขับออก ในระหว่างนั้นอวัยวะอื่น ๆ แต่ละคนมีบทบาทของตัวเองที่จะเล่นในกระบวนการย่อยอาหาร
เมื่ออาหารเข้าไปในปากและถูกเคี้ยวมันจะเข้าไปในหลอดลมซึ่งนำไปสู่หลอดอาหาร ในเส้นทางของระบบย่อยอาหารหลอดอาหารเป็นอวัยวะที่มีลักษณะคล้ายหลอดที่ทำหน้าที่เป็นทางเดินอาหารเพื่อไปยังกระเพาะอาหาร อาหารถูกเคลื่อนย้ายผ่านหลอดอาหารโดยกล้ามเนื้อ peristalsis และเก็บรักษาหล่อลื่นโดยเมือกที่หลั่งในเยื่อบุของหลอดอาหาร จุดเริ่มต้นและจุดสิ้นสุดของหลอดอาหารมีกล้ามเนื้อหูรูดซึ่งช่วยให้อาหารเข้ามาจากหลอดลมและออกสู่กระเพาะอาหาร
กระเพาะอาหารเป็นอวัยวะสำคัญในเส้นทางของระบบย่อยอาหารและตำแหน่งเริ่มต้นของการย่อยอาหาร กระเพาะอาหารจะหลั่งน้ำย่อยซึ่งประกอบด้วยกรดไฮโดรคลอริกที่ฆ่าแบคทีเรียและเตรียมโปรตีนสำหรับการย่อยสลายโดยเอนไซม์เปปซิน กรดในน้ำย่อยมีความแรงมากจนกระเพาะอาหารต้องผลิตเยื่อบุเมือกที่ย่อยอาหารเอง เมื่ออาหารถูกย่อยบางส่วนแล้วมันจะดำเนินต่อไปตามเส้นทางของระบบย่อยอาหารไปยังลำไส้เล็ก
ลำไส้เล็กประกอบด้วยสามส่วน ได้แก่ duodenum, jejunum และ ileum ลำไส้เล็กวัดความยาวเฉลี่ยที่น่าประหลาดใจประมาณหกเมตร (19.6 ฟุต) และเป็นที่ที่การย่อยของเอนไซม์ส่วนใหญ่เกิดขึ้น อวัยวะต่างๆเช่นตับตับอ่อนและถุงน้ำดีหลั่งสารเคมีเข้าไปในลำไส้เล็กซึ่งยังช่วยให้ร่างกายย่อยคาร์โบไฮเดรตและไขมัน เมื่ออาหารพร้อมที่จะออกจากลำไส้เล็กและเข้าไปในลำไส้ใหญ่มันจะผ่านลิ้น ileocecal
ลำไส้ใหญ่ที่เรียกว่าลำไส้ใหญ่มีบทบาทในการย่อยอาหารโดยดูดน้ำและช่วยในการดูดซึมสารอาหารขั้นสุดท้าย เมื่อถึงลำไส้ใหญ่เนื้อหาในกระเพาะอาหารที่ไม่ได้ถูกย่อยรวมทั้งโมเลกุลอาหารที่ร่างกายไม่ได้ใช้จะกลายเป็นของเสีย ของเสียนี้เป็นที่รู้จักกันในนามของสสารและถูกเก็บไว้ในไส้ตรงซึ่งเป็นจุดสิ้นสุดของลำไส้ใหญ่ ของเสียจะถูกขับออกทางทวารหนักในระหว่างการถ่ายอุจจาระกระบวนการทางร่างกายควบคุมโดยกล้ามเนื้อหูรูดแบบไม่สมัครใจและแบบสมัครใจ
ใช้เวลาเฉลี่ย 24 ถึง 48 ชั่วโมงเพื่อให้อาหารเสร็จสิ้นการเดินทางทั้งหมดในเส้นทางของระบบย่อยอาหาร แบคทีเรียไวรัสและอาหารที่ไม่ได้รับสารอาหารจำนวนมากเกินไปสามารถเปลี่ยนการทำงานของระบบย่อยอาหารได้ ความไม่สมดุลในการผลิตสารเคมีทางเดินอาหารอาจรบกวนการทำงานของระบบย่อยอาหารและอาจเร่งหรือกำจัดของเสียได้เร็วขึ้น
