Skip to main content

ในชีววิทยาลำดับฉันทามติคืออะไร?

ลำดับฉันทามติคือชุดของโปรตีนหรือนิวคลีโอไทด์ในกรด deoxyribonucleic (DNA) ที่ปรากฏเป็นประจำกรดอะมิโน adenine, guanine, cytosine และ thymine ประกอบไปด้วยลำดับทางพันธุกรรมใน DNAนักชีววิทยาระดับโมเลกุลมักใช้สถิติเพื่อทำนายว่าลำดับของพวกเขาจะอยู่ที่ไหนหรือเพื่อทำความเข้าใจว่าโมเลกุลเฉพาะมักจะผูกมัดในกรณีที่ลำดับกรดอะมิโนยังคงเหมือนเดิมและที่ที่พวกเขามีแนวโน้มที่จะแตกต่างกันสามารถแสดงด้วยสูตรในกรณีของลำดับโปรโมเตอร์ฉันทามติเอนไซม์ชนิดใดชนิดหนึ่งสามารถผูกกับไซต์ที่มีโปรตีนที่จัดลำดับในทำนองเดียวกัน

พันธุศาสตร์เช่นนักวิจัยในสาขาวิทยาศาสตร์หลายแห่งมักใช้การทดแทนเพื่อทำให้ระบบที่ซับซ้อนง่ายขึ้นมีฐานกรดอะมิโนและยีนจำนวนมากในร่างกายที่นักวิทยาศาสตร์ไม่สามารถนับได้เว้นแต่จะมีระบบทั่วไปบางอย่างสำหรับการทำเช่นนั้นลำดับฉันทามติสามารถปรากฏในหลาย ๆ สถานที่ใน DNA เช่นกันในสิ่งมีชีวิตที่หลากหลายความเหมือนและความแตกต่างที่มีแนวโน้มที่จะเกิดขึ้นสามารถระบุได้ด้วยสูตร

สถิตินักวิทยาศาสตร์สามารถจำแนกลำดับทางพันธุกรรมเพื่อค้นหารูปแบบรูปแบบการทำซ้ำที่เรียกว่าลวดลายลำดับมักใช้เพื่อเป็นตัวแทนของพื้นที่ทางพันธุกรรมที่ควบคุมกระบวนการทางชีวภาพเฉพาะลำดับฉันทามติยังสามารถนำเสนอข้อมูลเชิงลึกเกี่ยวกับวิธีการสังเคราะห์โปรตีนหรือวิธีการชี้นำโมเลกุลภายในเซลล์

ในสัญกรณ์ของลำดับฉันทามติที่ตั้งของนิวคลีโอไทด์บางแห่งสามารถแสดงให้เห็นว่าพวกเขาอยู่ในตำแหน่งที่เป็นตัวแทนเสมอนอกจากนี้ยังสามารถระบุได้ว่าหนึ่งนิวคลีโอไทด์หรืออื่น ๆ สามารถอยู่ที่นั่นได้ในกรณีนี้ความถี่ที่กรดอะมิโนปรากฏขึ้นในสถานที่อื่นโดยทั่วไปไม่ได้ระบุไว้บางครั้งรูปแบบกราฟิกถูกใช้เพื่อระบุความถี่นี้โดยการเพิ่มหรือลดขนาดของสัญลักษณ์โปรแกรมซอฟต์แวร์บางโปรแกรมสามารถสร้างโลโก้ลำดับโดยอัตโนมัติ

บ่อยครั้งลำดับฉันทามติตรงกับไซต์ที่มีผลผูกพันโปรตีนที่ได้รับการยอมรับเพื่อแสดงลำดับของจีโนมอย่างถูกต้องมักใช้สูตรทางคณิตศาสตร์เหล่านี้รวมถึงสูตรทางสถิติเช่นลอการิทึมและค่าตัวเลขซึ่งอาจเป็นบวกหรือลบเพื่อแสดงตำแหน่งของข้อมูลทางพันธุกรรมกระบวนการในจีโนมสำหรับฟังก์ชั่นทางชีวภาพปกติเช่นเดียวกับกระบวนการที่เกี่ยวข้องกับโรคสามารถวิเคราะห์ด้วยวิธีนี้

การเป็นตัวแทนทางคณิตศาสตร์ของลำดับฉันทามติโดยทั่วไปจะให้แบบจำลองของรูปแบบ DNA และกรดอะมิโนโดยทั่วไปแล้วภาพที่แน่นอนจะไม่ได้รับอย่างไรก็ตามลำดับสามารถช่วยให้นักวิทยาศาสตร์เชื่อมโยงแง่มุมการทำงานของส่วนต่าง ๆ ของจีโนมกับรูปแบบวิวัฒนาการของสิ่งมีชีวิต