ปัจจัยหลายประการสามารถมีบทบาทในเงินเดือนที่นักชีวเคมีได้รับ ปัจจัยเหล่านี้บางอย่างสามารถควบคุมได้โดยนักชีวเคมีในขณะที่ปัจจัยอื่น ๆ อาจมีอิทธิพลต่อทั้งอุตสาหกรรมซึ่งนักชีวเคมีไม่สามารถควบคุมได้ ช่วงเงินเดือนชีวเคมีอาจแตกต่างกันไปอย่างกว้างขวางและเป็นสิ่งสำคัญที่จะต้องพิจารณาอิทธิพลของเงินเดือนเมื่อประเมินข้อเสนอการจ้างงานเพื่อพิจารณาว่าเงินเดือนเหมาะสมหรือไม่
หนึ่งในปัจจัยที่กำหนดที่ใหญ่ที่สุดในเงินเดือนนักชีวเคมีคือที่นักชีวเคมีทำงาน แต่ละประเทศมีระดับการจ่ายเงินและค่าครองชีพที่แตกต่างกันอย่างสิ้นเชิง ยกตัวอย่างเช่นนักชีวเคมีที่ทำงานในสหราชอาณาจักรอาจทำมากกว่านักชีวเคมีที่ทำงานในอินเดียเพียงเพราะมีค่าครองชีพที่แตกต่างกัน นักชีวเคมีที่ทำงานให้กับ บริษัท ระหว่างประเทศอาจได้รับมากกว่าหนึ่งคนที่ทำงานในประเทศ ประเภทของ บริษัท ที่นักชีวเคมีทำงานก็สำคัญเช่นกัน บริษัท ยามักจ่ายเงินเดือนที่สูงมากในขณะที่หน่วยงานของรัฐมีเงินทุนน้อยสำหรับเงินเดือน
ปัจจัยอีกประการหนึ่งของเงินเดือนนักชีวเคมีก็คือปริมาณการฝึกอบรมที่นักชีวเคมีได้รับ ยิ่งระดับวิทยาลัยสูงขึ้นเท่าใดเงินเดือนก็จะสูงขึ้นตามกฎทั่วไป ประสบการณ์มากขึ้นในฐานะนักชีวเคมีที่ทำงานสามารถเพิ่มเงินเดือนนักชีวเคมีได้เช่นเดียวกับการรับรองและการฝึกอบรมพิเศษ ตัวอย่างเช่นนักชีวเคมีที่ทำงานในห้องปฏิบัติการระดับสูงและมีความปลอดภัยสูงจะถูกมองว่าเป็นผู้สมัครงานที่น่าสนใจมากกว่านักชีวเคมีที่ไม่ได้ทำงานซึ่งหมายความว่านักชีวเคมีที่มีประสบการณ์มากขึ้นสามารถเรียกร้องและรับเงินเดือนสูงขึ้น
ขนาดของ บริษัท อาจมีความสำคัญเมื่อเทียบกับเงินเดือนนักชีวเคมีเช่นเดียวกับลักษณะของ บริษัท องค์กรไม่หวังผลกำไรจ่ายเงินน้อยลงขณะที่องค์กรที่ทำกำไรจ่ายมากขึ้น ในส่วนนี้เกิดจากการระดมทุนที่มีอยู่และส่วนหนึ่งเป็นเพราะลักษณะขององค์กร ประเภทของงานที่มีการปฏิบัติก็มีความสำคัญเช่นกัน การวิจัยขั้นสูงจะส่งผลให้เงินเดือนชีวเคมีที่สูงขึ้นในขณะที่การประมวลผลตามปกติของวัสดุห้องปฏิบัติการจะจ่ายน้อยลง ประวัติของการตีพิมพ์ในวารสารการวิจัยจะเพิ่มเงินเดือนนักชีวเคมีเช่นเดียวกับการมีส่วนร่วมในการประชุมและการพัฒนาวิชาชีพอื่น ๆ
ตำแหน่งงานก็มีความสำคัญเช่นกัน ยิ่งตำแหน่งงานสูงขึ้นเท่าใดเงินเดือนก็ยิ่งสูงขึ้นแม้ว่าคนสองคนที่มีตำแหน่งต่างกันจะทำงานเดียวกันมาก นี่คือเหตุผลหนึ่งที่ว่าทำไมผู้คนระมัดระวังเป็นอย่างมากเมื่อพูดถึงการเจรจาต่อรองตำแหน่งงานการเอาใจใส่เรื่องอื่น ๆ ที่ใช้ใน บริษัท และภายในห้องปฏิบัติการ ภาระผูกพันตามสัญญาอาจมีความสำคัญ หากนักชีวเคมีลงนามในข้อตกลงซึ่งบ่งชี้ว่าเขาหรือเธอจะใช้เวลานานกับ บริษัท และจะไม่ทำงานให้กับ บริษัท คู่แข่ง บริษัท จะจ่ายเงินมากขึ้นเพื่อรับทราบถึงความมุ่งมั่นในระดับสูงของพนักงาน
