contig คืออะไร?

A contig สั้นสำหรับต่อเนื่องหมายถึงส่วน deoxyribonucleic acid (DNA) หรือผลิตภัณฑ์ของกลุ่มที่ทับซ้อนกันซึ่งเป็นลำดับดีเอ็นเอที่ต่อเนื่องและไม่หยุดชะงักโดยการศึกษาแผนที่ของเซ็กเมนต์เหล่านี้เป็นไปได้ที่จะค้นพบลำดับของส่วนที่ประกอบด้วยลำดับต่าง ๆ และสามารถเพิ่ม contigs ลบหรือจัดเรียงใหม่เพื่อสร้างลำดับใหม่การทำแผนที่ DNA contig และห้องสมุดช่วยให้นักวิจัยสามารถระบุการจัดตำแหน่งที่อาจทำให้เกิดโรคให้ความเข้าใจที่ดีขึ้นว่าเซลล์มีปฏิกิริยาอย่างไรภายใต้เงื่อนไขบางประการและเปิดใช้งานความสามารถในการโคลนลักษณะที่ดีในสิ่งมีชีวิตซ้อนทับของชุดการจับคู่ที่ติดแท็กหรือโดยการจับคู่แท็กลำดับที่แสดงโดยการทำความเข้าใจกระบวนการสร้างบล็อกนี้ที่ใช้โดยฐานของเซ็กเมนต์ DNA contigs อาจทำซ้ำหรือโคลนเป็นลำดับที่ต้องการเพิ่มหรือกำจัดส่วนที่เป็นที่นิยมน้อยลงนักวิจัยมองว่าลำดับเหล่านี้เป็นแผนที่ในโปรแกรม DNA ที่มีรายละเอียดสูงและคอมพิวเตอร์โปรแกรมให้การแยกส่วนของฐานที่ใช้ในการสร้างเซ็กเมนต์และเซ็กเมนต์ที่ใช้ในการสร้างลำดับโดยเฉพาะการใช้โทนสีที่แตกต่างกันโปรแกรม contig ต่างๆจะแสดงข้อมูลนี้เป็นลำดับต่ำปานกลางและคุณภาพสูง

การทำแผนที่ contig มักจะให้แสงสว่างกับสาเหตุของความผิดปกติทางพันธุกรรมตัวอย่างเช่น Williams Syndrome สร้างอาการหลายระบบในเด็กรวมถึงปัญหาหัวใจและหลอดเลือดระดับแคลเซียมในเลือดสูงและความล้มเหลวในการเจริญเติบโตนักวิจัยค้นพบการลบวงที่มีผลต่อยีนบางชนิดซึ่งอาจเกิดจากการทับซ้อนที่ไม่เหมาะสมของ contigsความผิดปกติในวัยเด็กทางพันธุกรรมอีกกลุ่มหนึ่งคือ Cri-du-Chat syndrome ยังก่อให้เกิดอาการหลายอย่างซึ่งนักวิทยาศาสตร์แต่ละคนเชื่อว่ามีความสัมพันธ์กับการลบและการวางตำแหน่งที่ผิดปกติ

นักวิจัยยังวิเคราะห์ลำดับ contig ในสายพันธุ์พืชพืชแต่ละแห่งมีการเรียงลำดับที่ไม่ซ้ำกันกับพืชนั้นและโดยการได้รับแผนที่ของพืชแต่ละชนิดนักวิทยาศาสตร์ค้นพบลักษณะที่คล้ายกันและแตกต่างกันซึ่งอาจนำไปสู่สุขภาพหรือการเสื่อมสภาพของพืชชนิดใดชนิดหนึ่งโดยการวิเคราะห์กลุ่ม contig และลำดับในโรคที่มีสิ่งมีชีวิตแพทย์สามารถกำหนดลักษณะที่สามารถใช้ในการพัฒนาการรักษาการทำแผนที่ให้ข้อมูลเชิงลึกเกี่ยวกับการจัดการทางพันธุกรรมที่เป็นไปได้ผ่านการลบลำดับหรือการโคลนนิ่ง

นักวิทยาศาสตร์อาจเติบโตตัวอย่างดีเอ็นเอที่ถูกโคลนในโครโมโซมเทียมแบคทีเรียโครโมโซมเทียมยีสต์หรือใน P1 หรือสื่อโครโมโซมเทียม phageโครโมโซมเหล่านี้มีฐานตั้งแต่ 50 ถึงหลายแสนฐานซึ่งรวบรวมเซ็กเมนต์ contigหลังจากช่วงเวลาของการล่าอาณานิคมตัวอย่างจะถูกสกัดโดยใช้เข็มฉีดยาและวางในเจลลำดับดีเอ็นเอซึ่งผ่านอิเล็กโทรโฟเรซิสและแห้งautoradiograph อ่านตัวอย่างและลายนิ้วมือลำดับจากนั้นนักวิจัยจะสแกนลายนิ้วมือลงในไฟล์รูปภาพซึ่งอาจถูกโหลดลงในโปรแกรม contig ในภายหลัง