ปฏิสัมพันธ์ของยีนเป็นการทำงานร่วมกันระหว่างยีนต่าง ๆ ที่มีผลกระทบต่อการแสดงออกของฟีโนไทป์ของสิ่งมีชีวิต ในขณะที่การแสดงออกของลักษณะทางกายภาพมักจะอธิบายว่าเป็นผลมาจากการสืบทอดสองยีนหนึ่งที่แต่ละอัลลีลจากผู้ปกครองแต่ละคนมันเป็นจริงที่ซับซ้อนมากขึ้น กลุ่มของยีนมีปฏิสัมพันธ์ซึ่งกันและกันอธิบายว่าทำไมฟีโนไทป์จึงแปรปรวนระหว่างสมาชิกแต่ละคนของสปีชีส์ การทำความเข้าใจปฏิสัมพันธ์ของยีนเป็นสิ่งสำคัญในการทำความเข้าใจการสืบทอดโดยเฉพาะอย่างยิ่งการสืบทอดลักษณะที่เป็นอันตราย
ปฏิกิริยาของยีนอาจส่งผลให้เกิดการเปลี่ยนแปลงหรือการยับยั้งฟีโนไทป์ สิ่งนี้สามารถเกิดขึ้นได้เมื่อสิ่งมีชีวิตสืบทอดพันธุกรรมที่แตกต่างกันสองตัวอย่างเช่นทำให้เกิดการปกครองที่ไม่สมบูรณ์ นี่เป็นเรื่องปกติที่เห็นในดอกไม้การผสมพันธุ์ของดอกไม้สองดอกที่ผ่านยีนที่โดดเด่นอาจส่งผลให้ดอกไม้ที่มีสีผิดปกติเกิดจากการครอบงำที่ไม่สมบูรณ์ หากสีแดงและสีขาวมีความโดดเด่นเช่นลูกอาจเป็นสีชมพูหรือลายสีเนื่องจากการปฏิสัมพันธ์ของยีน
บางครั้งลักษณะทางพันธุกรรมจะถูกระงับโดยสิ้นเชิง คนที่มีอาการเผือกอาจมียีนสำหรับลักษณะที่ไม่ได้แสดงในฟีโนไทป์ของพวกเขาเพราะเผือกทำหน้าที่เพื่อปิดยีนเหล่านั้น นี่ก็เห็นได้ในรูปแบบการระบายสีในสัตว์เช่นแมวกระดองเต่าที่สีขนที่ผิดปกตินั้นเป็นผลมาจากการคัดเลือกยีนที่มีปฏิสัมพันธ์กับยีนที่ถูกปิดในบางสถานที่และเปิดในที่อื่น ๆ
แมลงวันผลไม้ได้รับการศึกษาอย่างกว้างขวางในด้านพันธุศาสตร์และมีความเข้าใจอย่างถ่องแท้ว่าการปฏิสัมพันธ์ของยีนนั้นมาจากการทำงานกับแมลงวันผลไม้ในสภาพแวดล้อมของแล็บ ในสิ่งมีชีวิตเช่นมนุษย์ที่การทดลองทางพันธุกรรมถูกมองว่าผิดจรรยาบรรณนักพันธุศาสตร์ถูกบังคับให้ต้องพึ่งพาข้อมูลจากประชากรที่มีอยู่เพื่อเรียนรู้เกี่ยวกับลักษณะเด่นและแบบถอยกลับและเพื่อดูว่ากลุ่มของลักษณะทางพันธุกรรมสามารถโต้ตอบได้อย่างไร การทำงานร่วมกันของยีนเป็นผลมาจากการสืบทอดยีนที่ขัดแย้งกันในทางใดทางหนึ่งทำให้เป็นไปไม่ได้ที่พวกเขาทุกคนจะแสดงเป็นรหัสหรือการสืบทอดชุดของยีนที่สัมพันธ์กันซึ่งมีปฏิสัมพันธ์ซึ่งกันและกันเพื่อแสดงออกถึงฟีโนไทป์
บางครั้งปฏิสัมพันธ์ของยีน จำกัด การผลิตโปรตีนบางชนิดซึ่งค่อนข้างเร็วในการพัฒนาของทารกในครรภ์ ในกรณีอื่น ๆ มันสามารถรบกวนการเข้ารหัสของโปรตีนเพื่อให้เกิดการแสดงออกที่ผิดเพี้ยนของลักษณะทางกายภาพ ลูกผสมมักแสดงให้เห็นถึงผลลัพธ์ที่น่าสนใจของการปฏิสัมพันธ์ของยีน ในบางกรณีการโต้ตอบนั้นมีประโยชน์และอาจพัฒนาไปสู่ลักษณะทางพันธุกรรมของตัวเองในขณะที่ในบางกรณีปฏิสัมพันธ์ของยีนอาจสร้างความเสียเปรียบและคุณลักษณะเหล่านั้นจะตายในที่สุด
