transcriptome คืออะไร?

transcriptome เป็นคอลเลกชันที่สมบูรณ์ของ RNA จากสิ่งมีชีวิตกลุ่มของเซลล์หรือแม้แต่เซลล์เฉพาะRNA ถูกสังเคราะห์จาก DNA ผ่านกระบวนการที่เรียกว่าการถอดความRNA ที่มีอยู่ในเซลล์และร่างกายจะกำหนดว่ายีนใดจะแสดงออกมาและมันจะเปลี่ยนแปลงไปตามวิถีชีวิตของสิ่งมีชีวิตซึ่งแตกต่างจาก DNA ซึ่งยังคงคงที่แรงกดดันด้านสิ่งแวดล้อมเป็นหนึ่งในเหตุผลสำคัญสำหรับการเปลี่ยนแปลงเนื่องจากร่างกายพยายามปรับให้เข้ากับการเปลี่ยนแปลงสถานการณ์ด้านสิ่งแวดล้อมเพื่อให้ตัวเองทำงานได้

transcriptome มีขนาดเล็กกว่าจีโนมสิ่งมีชีวิตมากขึ้นในแง่ง่าย ๆ ใคร ๆ ก็คิดว่า DNA เป็นตำราอาหารโดยแสดงรายการสูตรอาหารที่สมบูรณ์ซึ่งสามารถทำได้transcriptome เป็นรหัสที่กำหนดสูตรใดที่จะทำและเมื่อตำราอาหารยังคงคงที่ตลอดชีวิตในขณะที่การเปลี่ยนแปลงการตอบสนองต่อปัจจัยด้านสิ่งแวดล้อม

ส่วนสำคัญประการหนึ่งของ transcriptome คือโมเลกุล mRNAMessenger RNA คือ RNA ซึ่งสื่อสารกับไรโบโซมในเซลล์เพื่อควบคุมเซลล์เพื่อสร้างโปรตีนต่าง ๆโปรตีนเหล่านี้ใช้สำหรับฟังก์ชั่นที่หลากหลายส่วนอื่น ๆ อาจไม่ได้รหัสโดยตรงสำหรับการผลิตโปรตีน แต่ทำสิ่งต่าง ๆ เช่นการกำหนดโครงสร้างเซลล์และควบคุมการแสดงออกของยีนส่วนประกอบต่าง ๆ ของ transcriptome ทำให้การทำงานของสิ่งมีชีวิตและตรวจสอบการแสดงออกของยีนภายในสิ่งมีชีวิตนั้น

ภายในเซลล์ต่าง ๆ ในร่างกาย transcriptome อาจแตกต่างกันมากตัวอย่างเช่นเซลล์ตับมี RNA ซึ่งทำให้เซลล์ตับและทำให้มั่นใจได้ว่าเซลล์ทำหน้าที่ที่จำเป็นในทางกลับกันเซลล์ผิวมี transcriptome ที่แตกต่างกันซึ่งเปิดใช้งานยีนที่จำเป็นในการทำให้เซลล์เป็นเซลล์ผิวทั้งเซลล์ตับและผิวหนังมีสำเนาจีโนมที่สมบูรณ์ แต่ transcriptomes ของพวกเขากำหนดว่าส่วนใดของจีโนมที่เปิดใช้งาน

เช่นเดียวกับ DNA มันเป็นไปได้ที่จะลำดับ RNAการจัดลำดับ Transcriptome สามารถทำได้เพื่อเรียนรู้เพิ่มเติมเกี่ยวกับการกระทำของเซลล์และสิ่งมีชีวิตโฮสต์ DNA และเพื่อระบุสถานที่ที่การแสดงออกของข้อมูลทางพันธุกรรมผิดพลาดเมื่อเซลล์ตับกลายเป็นมะเร็งเช่นนั้นเป็นเพราะ transcriptome ไม่ทำงานตามที่ควรจะเป็นและยีนสำหรับมะเร็งได้เปิดใช้งานหรือเซลล์ขาดการควบคุมในบางวิธีทำให้พวกเขาเติบโตจากการควบคุมการจัดลำดับ RNA ในเซลล์มะเร็งสามารถช่วยให้นักวิจัยทราบว่ายีนใดถูกเปิดใช้งานหรือไม่ทำงานเพื่อทำให้เกิดมะเร็ง