ภายในเซลล์มีการสร้างโปรตีนผ่านกระบวนการแปล ในระหว่างกระบวนการนี้ DNA ในนิวเคลียสของเซลล์จะถูกคัดลอกลงใน RNA ซึ่งจะถูกแปลเพื่อสร้างโมเลกุลโปรตีนจากกรดอะมิโนอิสระที่พบในเซลล์ มีสามประเภทของ RNA ที่เกี่ยวข้องกับการแปล ได้แก่ : Messenger RNA (mRNA), ribosomal RNA (rRNA) และการถ่ายโอน RNA (tRNA) บทบาทของแอนติโกดอนคือเพื่อให้แน่ใจว่ากรดอะมิโนในโปรตีนที่ถูกแปลนั้นเชื่อมโยงกันตามลำดับที่เหมาะสมเพื่อให้แน่ใจว่าการทำงานของโปรตีนที่เหมาะสม การสังเคราะห์โปรตีนไม่สามารถเกิดขึ้นได้หากปราศจากแอนติโกดอน
ดีเอ็นเอทำจากฐานนิวคลีโอไทด์สี่ฐานเรียกว่า A, T, C และ G การรวมกันของฐานเหล่านี้ประกอบขึ้นเป็นรหัสพันธุกรรมของเรา DNA อ่านโดยใช้รหัส triplet ซึ่งเป็นชุดของเบสสามฐานเรียกว่า codons โคดอนแต่ละตัวนั้นตรงกับกรดอะมิโนหนึ่งตัวซึ่งจะเป็นโครงสร้างของโปรตีนทุกตัวในร่างกาย anticodon เป็นส่วนหนึ่งของการถ่ายโอน RNA หรือ tRNA ที่ให้ codon บนสายของ mRNA ที่กำลังถูกแปล
ในการสร้างโปรตีนในเซลล์ DNA จะต้อง "อ่าน" และต้องสังเคราะห์โปรตีน เมื่อต้องการทำเช่นนี้ DNA จะถูกคัดลอกไปยัง messenger RNA หรือ mRNA ซึ่งเป็นข้อมูลทางพันธุกรรมชนิดหนึ่งที่เป็นพิมพ์เขียวสำหรับโปรตีน mRNA ยังมีรหัส triplet เรียกว่า codons ที่ให้ลำดับกรดอะมิโนภายในโปรตีนแต่ละชนิด แต่ละ codon นั้นฟรีกับ anticodon ที่พบในโมเลกุล tRNA anticodon ของ tRNA จะเป็นตัวกำหนดว่ากรดอะมิโนตัวใดที่จะถูกนำไปยึดติดกับโปรตีนที่กำลังเติบโต
มีสี่นิวคลีโอไทด์ในอาร์เอ็นเอที่ตรงกับนิวคลีโอไทด์ใน DNA พวกมันถูกกำหนดโดย A, U, C และ G แต่ละ codon นั้นประกอบด้วยนิวคลีโอไทด์สามตัวดังนั้นจำนวน codons ที่เป็นไปได้ในการเขียนรหัสสำหรับกรดอะมิโนคือ 64 เนื่องจากมี 64 codons ที่เป็นไปได้ ร่างกายกรดอะมิโนแต่ละตัวจะมีตัวแทนมากกว่าหนึ่ง codon และ anticodon codon ของอะมิโนแต่ละตัวนั้นเป็นที่รู้จักกันดี
แม้ว่ามากกว่าหนึ่ง codon อาจตรงกับกรดอะมิโนเดียวสองฐานแรกใน codlet แฝดมีความเหมือนกันหรือคล้ายกันสำหรับกรดอะมิโนแต่ละตัว ตัวอย่างเช่นการเข้ารหัสสองโค้ดสำหรับกรดอะมิโน leucine คือ UUA และ UUG ซึ่งแตกต่างกันเฉพาะในฐานที่สามของ triplet นี่คือการป้องกันเพื่อป้องกันข้อผิดพลาดในการสังเคราะห์โปรตีน เนื่องจากแอนติโกดอนต้อง“ อ่าน” codon เพื่อนำกรดอะมิโนที่เหมาะสมตราบใดที่รหัส triplet สองส่วนแรกถูกต้องกรดอะมิโนที่เหมาะสมจะถูกเพิ่มลงในโปรตีน ทฤษฎีนี้เรียกว่าสมมติฐานวอกแวกและเป็นที่ยอมรับกันโดยทั่วไปเพื่ออธิบายการทำงานร่วมกันระหว่าง codon และ anticodon ในสิ่งมีชีวิตที่รู้จักทั้งหมด
