ฟิชชันแบบไบนารีเป็นรูปแบบของการสืบพันธุ์แบบไม่อาศัยเพศซึ่งถูกใช้โดยสิ่งมีชีวิตทั้งหมดในโปรคาริโอตและสิ่งมีชีวิตยูคาริโอตบางอย่างเช่นเชื้อราเช่นกัน นอกจากจะถูกนำมาใช้เพื่อทำซ้ำสิ่งมีชีวิตทั้งหมดแล้วกระบวนการนี้ยังใช้ในเซลล์ของสิ่งมีชีวิตยูคาริโอตโดยอวัยวะบางส่วน ในกระบวนการนี้เซลล์ลูกสาวสองเซลล์ผลิตโดยเซลล์หลักเดียวที่มีการโคลนตัวเองได้อย่างมีประสิทธิภาพ แบคทีเรีย Escherichia coli มีการใช้อย่างกว้างขวางโดยนักวิจัยศึกษาการแยกฟิชชันแบบไบนารีเนื่องจากเป็นตัวอย่างคลาสสิกของวิธีการสืบพันธุ์แบบไม่อาศัยเพศที่มีการใช้งานจริงและมีอยู่มากมาย
ในฟิชชันแบบไบนารีเซลล์เริ่มต้นด้วยการทำสำเนาดีเอ็นเอเพื่อสร้างชุดที่สมบูรณ์สองชุดจากนั้นเติบโตเป็นขนาดที่ใหญ่กว่าปกติ เมื่อเซลล์โตขึ้นชุดของ DNA จะเลื่อนไปที่ปลายอีกด้านของเซลล์ เมื่อเซลล์มีขนาดที่เหมาะสมก็จะแยกเป็นสองเซลล์สร้างเซลล์ลูกสาวสองตัวที่มี DNA เหมือนกัน กระบวนการนี้ใช้คลาสสิกเมื่อสิ่งมีชีวิตอาศัยอยู่ในสภาพแวดล้อมที่มั่นคง
นอกเหนือจากการทำซ้ำผ่านฟิชชันแบบทวิภาคแล้วโปรคาริโอตหลายชนิดสามารถสร้างเพศสัมพันธ์ได้อีกด้วย การสืบพันธุ์แบบอาศัยเพศเป็นสิ่งสำคัญเพราะมันก่อให้เกิดความหลากหลายทางพันธุกรรมโดยการผสมยีนของบุคคลต่างๆ การแบ่งเซลล์แบบไบนารีซ้ำหลายครั้งจะช่วยลดความหลากหลายทางพันธุกรรมทำให้สายพันธุ์โดยรวมมีความอ่อนไหวต่อการถูกกำจัดออกไป การสืบพันธุ์แบบอาศัยเพศผสมสิ่งต่าง ๆ ทำให้สายพันธุ์มีความหลากหลายและส่งเสริมการพัฒนาของการกลายพันธุ์ที่เป็นประโยชน์
ช่วงเวลาของการแตกตัวของไบนารีเป็นสิ่งสำคัญเนื่องจากสิ่งมีชีวิตจะต้องทำในเวลาที่เหมาะสม กระบวนการบางส่วนได้รับการควบคุมโดย septal ring ซึ่งเป็นวงแหวนของโปรตีนที่อยู่รอบ ๆ กลางของเซลล์กระตุ้นให้มันแยกออกจากกันอย่างเท่าเทียมกันโดยไม่ทำลาย DNA หรือผนังเซลล์ ข้อผิดพลาดในกระบวนการฟิชชันอาจทำให้เกิดการก่อตัวของเซลล์ลูกสาวที่มี DNA ไม่สมบูรณ์หรือสำเนาเพิ่มเติมของยีนบางชนิด แหวนของผนังถูกออกแบบมาเพื่อป้องกันสิ่งนี้
ภายในเซลล์ของสิ่งมีชีวิตยูคาริโอตสิ่งมีชีวิตเช่นไมโทคอนเดรียสามารถทำซ้ำได้ด้วยวิธีนี้ ฟิชชันแบบไบนารีภายในเซลล์มักจะถูกกำหนดเวลาให้เกิดขึ้นเมื่อเซลล์อยู่ในกระบวนการของการจำลองและการหารซึ่งเป็นส่วนหนึ่งของวัฏจักรเซลล์ ข้อผิดพลาดสามารถเกิดขึ้นได้ในระหว่างกระบวนการนี้ทำให้เกิดปัญหากับเซลล์ลูกที่เกิดขึ้นระหว่างการแบ่งเซลล์ ข้อผิดพลาดเหล่านี้อาจทำให้เซลล์ตายเนื่องจากเซลล์ใหม่ไม่สามารถอยู่รอดได้ด้วยตนเองหรืออาจนำไปสู่สภาวะเช่นมะเร็งซึ่งเกิดจากข้อผิดพลาดในการแบ่งเซลล์ซึ่งนำไปสู่การเพิ่มจำนวนของการเติบโตของเซลล์


