การบำบัดทางชีวภาพเป็นรูปแบบหนึ่งของการทำความสะอาดสิ่งแวดล้อมซึ่งอาศัยสิ่งมีชีวิตทางชีวภาพเช่นพืชเชื้อราและจุลินทรีย์เช่นแบคทีเรีย มนุษย์ใช้เทคนิคนี้มานานหลายศตวรรษและในช่วงปลายศตวรรษที่ 20 มันเริ่มถูกนำไปใช้อย่างกว้างขวางมากขึ้นในการแก้ปัญหาสิ่งแวดล้อมทั่วโลก ตัวอย่างของการบำบัดทางชีวภาพโบราณคือการใช้พืชเพื่อดึงเกลือออกจากดินเพื่อให้เพาะปลูกได้อีกครั้งในขณะที่การบำบัดทางชีวภาพแบบดั้งเดิมที่เกี่ยวข้องกับการใช้แบคทีเรียที่เป็นประโยชน์เพื่อช่วยทำความสะอาดคราบน้ำมันของ Exxon-Valdez ในอลาสกา
ผู้คนมักใช้คำว่า "phytoremediation" เพื่อพูดคุยเกี่ยวกับการบำบัดทางชีวภาพกับพืชและ "mycoremediation" เพื่อหารือเกี่ยวกับสถานการณ์ที่มีการใช้เชื้อราการจอง "การฟื้นฟูทางชีวภาพ" เพื่ออ้างถึงการใช้จุลินทรีย์เช่นแบคทีเรียโปรโตซัวและอื่น ๆ ในทุกกรณีเป้าหมายคือการควบคุมคุณสมบัติตามธรรมชาติของสิ่งมีชีวิตเพื่อจัดการกับปัญหาสิ่งแวดล้อมหรือเพื่อดัดแปลงพันธุกรรมสิ่งมีชีวิตที่สามารถรับมือกับสถานการณ์สิ่งแวดล้อมได้
แบคทีเรียจำนวนมากสลายสารพิษซึ่งเป็นส่วนหนึ่งของกระบวนการเผาผลาญปกติของพวกเขาทำให้สารพิษเฉื่อย ลักษณะนี้มักจะใช้ในสถานการณ์ที่สารพิษถูกปล่อยออกสู่พื้นที่ขนาดใหญ่ทำให้พื้นที่เหล่านี้เป็นไปไม่ได้ที่จะทำความสะอาดหรือบรรจุ ตัวอย่างเช่นแม่น้ำที่ปนเปื้อนสามารถล้างออกด้วยแบคทีเรียที่แนะนำอย่างระมัดระวัง แบคทีเรียจะตายเมื่ออุปทานของสารพิษหมดลงเพราะพวกเขาจะหมดเสบียงอาหารจึงป้องกันการพัฒนาของปัญหาสิ่งแวดล้อมที่สอง
หน่วยงานด้านสิ่งแวดล้อมสามารถใช้สิ่งมีชีวิตบนไซต์ด้วยการบำบัดในแหล่งกำเนิดซึ่งสิ่งมีชีวิตที่ต้องการจะถูกนำมาใช้อย่างระมัดระวังต่อสิ่งแวดล้อมและความคืบหน้าของมันจะถูกติดตามจนกว่าไซต์นั้นจะถูกทำความสะอาดหรือสามารถใช้นอกไซต์ได้ การบำบัดทางชีวภาพของ Ex situ ใช้ในการทำความสะอาดดินที่ปนเปื้อนและวัสดุอื่น ๆ ที่ถูกกำจัดและแยกออกจากกัน เทคนิคนี้ช่วยลดการสะสมของสารพิษและอันตรายในหลุมฝังกลบและโรงแยกซึ่งทำให้โลกสะอาดขึ้นสำหรับคนรุ่นอนาคต
ข้อดีอย่างหนึ่งของการบำบัดทางชีวภาพคือการทำความสะอาดปัญหาโดยไม่สร้างปัญหา กระบวนการนี้สามารถใช้ในการรักษาสารพิษใหม่และเก่าซึ่งทำให้มีประโยชน์ในการบรรจุปัญหาที่เกิดขึ้นใหม่รวมถึงการฟื้นฟูสภาพแวดล้อมที่ออกแบบมาเพื่อแก้ไขปัญหาเก่าเช่นมลพิษจากโรงงานย้อนหลังไปหลายสิบปี สิ่งมีชีวิตที่ใช้มักจะอยู่ในตัวเองตายเมื่องานสำเร็จและในกรณีของสิ่งมีชีวิตดัดแปลงพันธุกรรมนักวิจัยสามารถออกแบบสิ่งมีชีวิตโดยเฉพาะเพื่อที่พวกเขาจะได้ง่ายต่อการกำจัดออกจากสภาพแวดล้อมเมื่อพวกเขามีวัตถุประสงค์ .
