การจัดลำดับ RNA ribosomal คืออะไร?

การเรียงลำดับ ribosomal ribonucleic acid (RNA) เป็นกระบวนการของการกำหนดเนื้อหาลำดับของกรดนิวคลีอิกที่ประกอบขึ้นเป็นไรโบโซมในเกือบทุกเซลล์ไรโบโซมเป็น macromolecules ที่สร้างโปรตีนเพื่อให้เซลล์ทำงานพวกเขาประกอบด้วย RNA และโปรตีนหลากหลายชนิดที่ช่วยให้ RNA ทำงานได้อย่างมีประสิทธิภาพมากขึ้นวัสดุส่วนใหญ่ในไรโบโซมมีส่วนร่วมโดยตรงในการสร้างโปรตีนดังนั้นการกำหนดลำดับของไรโบโซมอล RNA สามารถให้ข้อมูลเชิงลึกเกี่ยวกับโครงสร้างสุดท้ายของโมเลกุลเช่นเดียวกับวิธีการทำงานฟังก์ชั่นและโครงสร้างทั่วไปของ RNA ได้รับการอนุรักษ์ไว้อย่างดีระหว่างสายพันธุ์ที่หลากหลาย แต่ลำดับดิบไม่ได้และการเปลี่ยนแปลงในลำดับสามารถใช้เพื่ออนุมานข้อมูลเกี่ยวกับวิวัฒนาการของไรโบโซม

ไม่ว่าจะใช้สำหรับไรโบโซมแบคทีเรียหรือของสิ่งมีชีวิตที่ซับซ้อนมากขึ้นการเรียงลำดับ Ribosomal RNA สามารถทำได้ในลักษณะเดียวกันเมื่อ RNA ถูกแยกออกจากไรโบโซมมันจะทำซ้ำหลายครั้งแล้วแตกออกเป็นชิ้นเล็ก ๆ ที่สามารถระบุลำดับได้อย่างง่ายดายชิ้นส่วนเล็ก ๆ เหล่านั้นจะถูกประกอบขึ้นใหม่เพื่อสร้างลำดับที่กำหนดใหม่งานมีความซับซ้อนมากขึ้นเมื่อลำดับได้นานขึ้น แต่กระบวนการยังค่อนข้างง่ายสำหรับ ribosomal RNA ซึ่งค่อนข้างเล็กไม่มีการรับประกันว่าความพยายามครั้งแรกในการเรียงลำดับ ribosomal RNA จะถูกต้องในครั้งแรกดังนั้นความพยายามหลายครั้งในการตรวจสอบคุณภาพของข้อมูลมักจะดำเนินการ

ข้อมูลที่ได้จากการเรียงลำดับ ribosomal RNA สามารถนำมาใช้เพื่อวัตถุประสงค์ที่หลากหลาย แต่หนึ่งในสิ่งที่พบบ่อยที่สุดคือการระบุแบคทีเรียโดยเฉพาะอย่างยิ่ง ribosomal RNA ของแบคทีเรียได้รับการอนุรักษ์อย่างสูงระหว่างสปีชีส์ดังนั้นการจัดลำดับจึงช่วยให้ลักษณะเฉพาะของสปีชีส์ที่จะรวมเข้ากับโปรไฟล์สำหรับการอ้างอิงโปรไฟล์นี้สามารถใช้เพื่อระบุแบคทีเรียชนิดเฉพาะได้อย่างรวดเร็วและง่ายดายการทดสอบที่สามารถช่วยในการวินิจฉัยและรักษาโรคป่วยด้วยการถือกำเนิดของเทคโนโลยีการเรียงลำดับที่ดีกว่าวิธีการนี้ได้กลายเป็นเรื่องธรรมดามากขึ้นในการวินิจฉัย

การจัดลำดับไรโบโซมอล RNA ที่ได้รับผลกระทบครั้งที่สองสามารถมีต่อสุขภาพของมนุษย์ในการช่วยออกแบบยาเสพติดและยาลำดับของ ribosomal RNA ของแบคทีเรียมีหลายลำดับที่ไม่ซ้ำกันกับแบคทีเรียดังนั้นการกำหนดเป้าหมายภูมิภาคเหล่านี้ด้วยยาต้านจุลชีพสามารถฆ่าแบคทีเรียได้โดยไม่ต้องเป็นอันตรายต่อมนุษย์ข้อมูลการเรียงลำดับของ Ribosomal RNA ในตัวของมันเองไม่ได้ให้ข้อมูลเพียงพอที่จะสร้างยา แต่ให้ภูมิภาคนักวิทยาศาสตร์ให้ความสำคัญกับการศึกษาในอนาคตและการออกแบบยาโมเลกุลยาสามารถออกแบบทางวิศวกรรมที่แนบกับลำดับและปิดการใช้งานไรโบโซมความหลากหลายของยาในปัจจุบันใช้เทคนิคนี้เพื่อต่อสู้กับโรค